犬瘟热病毒弱毒和野毒的全基因组扩增及序列测定

论文摘要

分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒全基因组序列,针对保守区设计了11对特异性通用引物,用于扩增犬瘟热病毒野毒株和疫苗株全基因组。通过优化11对引物的工作浓度及退火温度等条件,对保存的3株疫苗毒CDV3株、OR12株、CDV/R-20/8株和2株野毒HBF-1株和SD（14）07株进行了全基因组扩增。取5μL扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,结果显示11对通用引物对以上5株犬瘟热病毒扩增后,均获得11个特异性目的片段,条带大小与预期相符。选取疫苗毒OR12株和野毒HBF-1株的进行全基因组序列测定,与GenBank中已公布的序列进行比对,同源性均大于99.0%,证实这11对特异性通用引物能够实现对犬瘟热病毒野毒和弱毒全基因组的准确扩增,并获得准确的全基因组序列。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 毒株
•   1.2 主要试剂和仪器
•   1.3 引物的设计
•   1.4 不同毒株犬瘟热病毒RNA提取
•   1.5 不同毒株犬瘟热病毒cDNA合成
•   1.6 犬瘟热病毒全基因组扩增
•   1.7 犬瘟热病毒全基因序列测定
• 2 结果
•   2.1 犬瘟热病毒全长PCR扩增结果
•   2.2 犬瘟热病毒野毒HBF-1株全基因组序列的测定
•   2.3 犬瘟热病毒疫苗毒OR12株全基因组序列的测定
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 薛向红,卜研,赵建军,史宁,胡博,朱言柱,廉士珍,张蕾,白雪,闫喜军

关键词: 通用引物,犬瘟热病毒,全基因组扩增,序列测定

来源: 中国兽医学报 2019年09期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 中国农业科学院特产研究所

基金: 国家重点研发计划资助项目(2016YFD0501001-02)

分类号: S852.65

DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2019.09.09

页码: 1710-1714

总页数: 5

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