吉氏巴贝斯虫多个GPI锚定蛋白基因的筛选与生物信息学分析

论文摘要

吉氏巴贝斯虫是一类红细胞内专性寄生的血液原虫,犬一旦感染终生带虫,治疗后时有复发,因此需要简便快捷的临床诊断方法及时确诊治疗。GPI锚定蛋白是虫体表面重要的抗原分子,是很好的潜在诊断标识,在虫体粘附、识别以及入侵红细胞等过程中具有非常重要的作用。为了筛选吉氏巴贝斯虫GPI锚定蛋白基因,通过搜索NCBI、Uniprot以及PiroplasmaDB数据库中吉氏巴贝斯虫表面抗原,与武汉株吉氏巴贝斯虫数据库作比对,筛选出可能的吉氏巴贝斯虫武汉株的GPI锚定蛋白基因,并通过bigPI、PredGPI、GPI-SOM网站预测其GPI锚定位点。运用生物信息学分析软件预测其氨基酸信号肽、跨膜区、疏水区以及结构域和抗原表位等,分析其生物信息特性。通过分析确定了5个吉氏巴贝斯虫武汉株的GPI候选抗原,分别命名为BgP50-WH、BgP47-WH、BgP45-WH、BgP32-WH、BgP12-WH,其GPI锚定位点均位于C端,长度约为21～22个氨基酸,均有信号肽并含有4个抗原表位。分析结果表明,这5个GPI抗原均有望成为吉氏巴贝斯病的诊断标识,其中BgP47-WH和BgP50-WH与抗体亲和力最强,最具有成为诊断标识的潜力。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 吉氏巴贝斯虫GPI锚定相关蛋白基因的搜索以及确定
•   1.2 G P I锚定相关蛋白性质的预测分析
• 2 结果
•   2.1 GPI锚定相关蛋白基因的检索以及序列分析
•   2.2 GPI锚定相关蛋白的理化性质（以BgP50-WH为例）
•     2.2.1 基本理化性质
•     2.2.2 疏水性分析
•     2.2.3 跨膜区分析
•     2.2.4 信号肽预测
•     2.2.5 亚细胞定位
•     2.2.6 抗原表位预测
•     2.2.7 修饰性位点预测
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 战雪燕,聂政,赵阳楠,罗晓莹,李慕晓,安晓梦,敖阳思琦,崔杰,王森,贺兰,赵俊龙

关键词: 吉氏巴贝斯虫,锚定蛋白,生物信息学,免疫原性

来源: 中国动物传染病学报 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 畜牧与动物医学

单位: 华中农业大学动物医学院

基金: 国家重点基础研究发展计划(973计划)(2017YFD0501201)

分类号: S852.72

页码: 57-64

总页数: 8

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