温度梯度凝胶电泳论文_张伟,李闻,张伟尉,马静,刘红艳

导读:本文包含了温度梯度凝胶电泳论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:梯度,电泳,凝胶,温度,群落,线粒体,多态性。

温度梯度凝胶电泳论文文献综述

张伟,李闻,张伟尉,马静,刘红艳[1](2008)在《采用温度梯度凝胶电泳(TGGE)分析消毒剂对池塘型微宇宙细菌群落结构的影响》一文中研究指出构建6个池塘型微宇宙模拟水生态系统,1个设为对照组,试验组连续投加次氯酸钠13d,投加剂量分别为1.0、2.5、5.0、10.0、20.0mg/L,停止投加后再观察10d.试验期间对各微宇宙分别进行8次采样,经37℃培养后提取细菌总DNA,进行16SrDNAV3区扩增后,对扩增产物进行TGGE分析.对TGGE图谱中的主要条带进行回收、重新扩增、克隆、建库、测序以及序列分析.结果显示,消毒剂进入环境后会对细菌群落结构产生影响,但不同剂量消毒剂产生的影响有显着差异,存在明显的剂量-效应关系:低剂量消毒剂对细菌群落结构的影响比较小,而且是可逆的,微宇宙系统对消毒剂逐渐适应后其群落结构即可恢复;而高剂量消毒剂对细菌群落结构的破坏比较大,且不可逆转,即使消毒剂停止投加后也不能恢复.说明盲目的过量投加消毒剂会对水体微生态环境造成严重破坏.图4表1参10(本文来源于《应用与环境生物学报》期刊2008年01期)

张伟[2](2006)在《温度梯度凝胶电泳(TGGE)分析消毒剂对微宇宙细菌群落结构的影响》一文中研究指出温度梯度凝胶电泳(temperature gradient gel electrophoresis,TGGE)是变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)的衍生技术,由于它们可对长度一致但碱基序列不同的DNA片段进行有效分离,该技术最初被用于基因点突变研究。1993年首次将其用于微生物生态学研究,分析分子大小相同但序列不同的16S rDNA片段,根据不同细菌其核糖体小亚基基因可变区碱基序列的不同,对其种群多样性、数量比例和系统进化等进行更为详尽的描述。TGGE技术不仅可以分析微生物群落结构组成,还能快速同时对比分析不同的微生物群落之间的差异,也可以研究同一个微生物群落随时间和外部环境压力的变化过程。同时该技术还具有分辨率高、电泳条件易于控制、重现性好、操作简便快速等优点,因此,该技术出现后很快就被广泛应用于各种微生物生态学研究,目前已发展成为环境微生物群落结构分析研究的主要手段之一。近年来,由于传染性非典型肺炎(SARS)和高致病性禽流感在我国部分省市流行,为了预防和控制疫情,在SARS期间和禽流感防治中大量使用了消毒剂。大规模持续使用消毒剂虽然可以提高消毒效果,但同时也加重了环境负担,对生态环境造成不同程度的污染,甚至破坏生态平衡。而生态平衡的破坏往往始于微生物生态的不可逆改变,目前对消毒剂进入环境后对微生物生态的影响所知甚少,因此开展消毒剂进入环境后的微生物生态效应研究十分必要。本研究系科技部SARS专项研究课题(编号:2003A07)的部分内容。目的应用TGGE指纹图谱技术揭示微宇宙细菌种群多样性,初步了解消毒剂对微宇宙细菌群落结构的影响,为合理地使用消毒剂、最大限度地减轻消毒剂对微生态环境的破坏提供科学依据。方法构建6个池塘型微宇宙模拟水生态系统,1个设为对照组,试验组连续投加次氯酸钠13天,投加剂量分别为1.0 mg/L、2.5 mg/L、5.0 mg/L、10.0 mg/L和20.0 mg/L,停止投加后再观察10天。其中在消毒剂投加前(第0天)、投加后第1天、第5天、第9天、第13天、第15天(停止投加后48 h)、第19天、第23天共8个时期对各微宇宙分别进行采样,并测定游离性余氯和细菌总数,采用涂布平板法37℃培养48 h后提取细菌基因组总DNA,再用通用引物进行16S rDNA V3区扩增,对扩增产物进行TGGE分析,通过对比分析不同剂量组微宇宙8个时期的TGGE指纹图谱,揭示消毒剂对微宇宙细菌群落结构的影响。对微宇宙TGGE图谱中的主要条带进行回收、重新扩增、克隆建库、测序及序列分析,探讨TGGE条带的序列多态性和微宇宙细菌种群多样性。结果投加消毒剂后,游离氯的量与消毒剂投加剂量、投加时间成正比,停止投加后,游离氯量也随之明显下降。消毒剂投加剂量较低(1.0、2.5 mg/L)时,细菌总数不但没有减少,反而明显增加;投加剂量较高(10.0、20.0 mg/L)时,细菌总数明显减少甚至降低为零;停止投加后,细菌总数明显回升。对比分析各试验组微宇宙8个时期的TGGE指纹图谱,结果显示不同剂量组的TGGE指纹图谱存在明显差异,低剂量组图谱在消毒剂投加初期发生主弱条带倒置,但随后即恢复到投加前图谱模式;高剂量组图谱在投加初期变化不明显,但在停止投加后图谱中的主弱条带发生倒置,甚至一条带消失。TGGE条带的序列分析结果表明,同一TGGE条带是由序列不同的片段组成;测序所得21个序列按序列相似性≥97%的标准分成10个操作分类单元(OTU),全部OTU与GeneBank数据库中已登录的细菌种类的同源性均≥97%,根据系统进化关系可将其分为叁大类:Bacillus、Pseudomonas和Drinking water bacterium MB16,其中前两者为优势菌群。结论消毒剂进入环境后会对细菌群落结构产生影响,但不同剂量消毒剂产生的影响有显着差异,存在明显的剂量-效应关系:低剂量消毒剂对细菌群落结构的影响比较小,而且是可逆的,微宇宙系统对消毒剂逐渐适应后其群落结构即可恢复;而高剂量消毒剂对细菌群落结构的破坏比较大,且不可逆转,即使消毒剂停止投加后也不能恢复。本研究结果提示,盲目的过量投加消毒剂会对微生态环境造成严重破坏。(本文来源于《华中科技大学》期刊2006-05-01)

谭虹虹,余细勇,单志新,符永恒,邓春玉[3](2005)在《应用温度梯度凝胶电泳检测冠心病人β_2-AR基因多态性》一文中研究指出【目的】建立用于测定β_2肾上腺素受体(β_2-AR)基因多态性的温度梯度凝胶电泳(TGGE)技术,检测 Arg16Gly和 Gln27Glu,以确定冠心病 Beta2AR 基因的多态性。【方法】以经心脏造影确定为冠状动脉阻塞的病人 DNA 标本为模板,选择性 PCR 扩增β_2-AR Arg16Gly,Gln27Glu 区域,然后经测序确定,建立并优化 TGGE 技术参数。【结果】建立了分析130bpβ_2-AR Arg16Gly,205 bp Gln27Glu 的 TGGE 技术,可检测出 Arg16Gly,Gln27Glu 的多态性。30例样品中,13例为 Arg16Arg型,5例为 Gly16Gly 型,12例为 Arg16Gly 型;22例为 Gln27Gln 型,1例为 Glu27Glu 型,7例为 Gln27Glu 型。【结论】所建立的PCR-TGGE 技术可用于β_2肾上腺素受体16及27位点基因多态性的分子筛选。(本文来源于《中山大学学报(医学科学版)》期刊2005年S1期)

洪纬,魏桂芳,庞小燕,王凌华,赵立平[4](2005)在《应用PCR与温度梯度凝胶电泳分析龈上菌斑微生物群落》一文中研究指出目的应用PCR与温度梯度凝胶电泳(PCRTGGE)分子技术对成年健康口腔的龈上菌斑中微生物群落组成进行分析。方法8例成年个体包括4男4女,年龄19~29岁,分别采取每例个体上下颌牙周龈上菌斑样品,共18份(个体Subl间隔10天采集2次样品)。提取菌斑DNA,PCR扩增16SrDNAV3可变区,产物经TGGE后进行相似系数分析。结果同一个体的上下颌微生物群落组成相似性系数为81%~95%,而不同个体的龈上菌斑微生物群落组成相似性系数,均在60%以下。结论不同个体具有其独特的牙周微生物群落,而且在一定时期内组成稳定。(本文来源于《中国微生态学杂志》期刊2005年01期)

庞小燕,赵立平[5](2004)在《用TGGE(温度梯度凝胶电泳)分析人胃肠道中拟杆菌的组成》一文中研究指出脆弱拟杆菌属是一类厌氧、不形成芽孢的革兰氏阴性菌,是正常肠道菌群中数量最多的一个优势菌属,包括B.fragilis(脆弱拟杆菌),B.vulgatus(普通拟杆菌),B.thetaiotaomicron(多形拟杆菌),B.distasonis(吉氏拟杆菌)和B.eggerthii(艾格茨氏拟杆菌)等种。健康状态下,拟杆菌是肠道菌群的重要组成部分,与其它菌共同行使肠道菌群的正常功能,但过量的脆弱拟杆菌却能引起各种感染,如内源性腹部脓肿、伤口感染、菌血症等。拟杆菌的分离、鉴定一般需要培养以及生化试验和气相色谱分析来完成,且很难区分拟杆(本文来源于《中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第叁届第七次学术研讨会论文集》期刊2004-04-01)

谭端军,刘玲玲,文毅,薛桥,王士雯[6](2004)在《时相温度梯度凝胶电泳在线粒体基因突变检测中的应用》一文中研究指出目的 评价时相温度梯度凝胶电泳技术 (TTGE)在肿瘤患者线粒体基因同质性和异质性突变检测中的应用。方法 对117例肿瘤组织和配对正常组织的全线粒体基因进行PCR扩增和TTGE突变筛选分析 ,对TTGE显示在肿瘤和配对正常组织中具有不同类型电泳带型变化的片段进行测序。结果 TTGE在总共 36 5 4片段中发现 16 0个体细胞性线粒体基因突变片段 ,经与直接测序结果比较 ,TTGE检测体细胞性突变的敏感性和特异性分别达 96 2 7%和 94 0 5 %。结论 TTGE是筛选线粒体基因体细胞性同质性突变和各种比例异质性突变的一种敏感方法。(本文来源于《解放军医学杂志》期刊2004年02期)

谭虹虹,余细勇,单志新,符永恒[7](2003)在《应用温度梯度凝胶电泳筛选冠心病人β_2-AR的Gln27Glu突变》一文中研究指出目的 :β2 肾上腺受体 (β2 AR)基因的多态型与高血压等疾病具有相关性。现已发现 β2 AR基因在欧美人群中存在 3种突变(Arg16Gly、Gln2 7Glu、Ser16 4Phe) ,这 3种突变是否与冠心病的发生发展存在相关性还不清楚。为研究(本文来源于《中国病理生理杂志》期刊2003年11期)

赵翔,安志东[8](2003)在《现代生物技术在环境微生物学中的应用:Ⅲ.限制性片段长度多态性分析、变性/温度梯度凝胶电泳和报道基因》一文中研究指出这是现代生物技术在环境微生物学中的应用系列综述文章的第叁篇 ,讨论限制性片段长度多态性 (RFLP)分析、变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和温度梯度凝胶电泳 (TGGE)以及报道基因。(本文来源于《氨基酸和生物资源》期刊2003年02期)

谭端军,白仁奎,,LJC,Wong[9](2002)在《时间温度梯度凝胶电泳结合基因测序对乳癌体细胞全线粒体DNA扫描及突变检测》一文中研究指出目的 线粒体主要通过氧化磷酸化途径以叁磷酸腺苷 (ATP)的形式产生能量在细胞内发挥作用。它是活性氧产生的主要场所 ,对DNA氧化性损伤十分敏感 ,同时缺乏保护性组蛋白和有限的DNA修复机制 ,其突变率至少是核基因组的 1 0倍以上。线粒体在能量代谢、活(本文来源于《中华老年多器官疾病杂志》期刊2002年01期)

赵永忠,徐湘民,杨阳[10](2001)在《应用温度梯度凝胶电泳分析非缺失型〆-地中海贫血突变》一文中研究指出目的 建立用于非缺失型 α-地中海贫血 (α-地贫 )突变筛查的温度梯度凝胶电泳(temperature gradientgel electrophoresis,TGGE)技术。方法 以不同基因型人基因组 DNA为模板 ,选择性扩增全长 α2 -珠蛋白基因 ,继以巢式 PCR扩增突变热点区域 ,然后建立并优化 TGGE参数。在此基础上 ,筛查表型阳性的 15例非缺失型 α-地贫疑诊样品 ,阳性样品经 DNA序列测定确认突变。结果 建立了分析5 43bp PCR片段和 α2珠蛋白基因全长 10 85 bp片段的 TGGE技术 ,可检测出中国人群中常见的两种 α-地贫点突变 :Hb Constant Spring(Hb CS)和 Hb Quong Sze(Hb QS)及 Hb Westmeadα2 CD12 2 CAC→ CAG(His→ Gln)。15例样品中 ,10例为 Hb CS,2例为 Hb QS,2例为 Hb Westmead,1例为新的与 Hb H病相关的突变 α2 CD31AGG→ AAG(Arg→ L ys)。结论 所建立的 PCR- TGGE技术可用于非缺失型 α-地贫点突变和 α-珠蛋白基因多态性的分子筛查(本文来源于《中华医学遗传学杂志》期刊2001年01期)

温度梯度凝胶电泳论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

温度梯度凝胶电泳(temperature gradient gel electrophoresis,TGGE)是变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)的衍生技术,由于它们可对长度一致但碱基序列不同的DNA片段进行有效分离,该技术最初被用于基因点突变研究。1993年首次将其用于微生物生态学研究,分析分子大小相同但序列不同的16S rDNA片段,根据不同细菌其核糖体小亚基基因可变区碱基序列的不同,对其种群多样性、数量比例和系统进化等进行更为详尽的描述。TGGE技术不仅可以分析微生物群落结构组成,还能快速同时对比分析不同的微生物群落之间的差异,也可以研究同一个微生物群落随时间和外部环境压力的变化过程。同时该技术还具有分辨率高、电泳条件易于控制、重现性好、操作简便快速等优点,因此,该技术出现后很快就被广泛应用于各种微生物生态学研究,目前已发展成为环境微生物群落结构分析研究的主要手段之一。近年来,由于传染性非典型肺炎(SARS)和高致病性禽流感在我国部分省市流行,为了预防和控制疫情,在SARS期间和禽流感防治中大量使用了消毒剂。大规模持续使用消毒剂虽然可以提高消毒效果,但同时也加重了环境负担,对生态环境造成不同程度的污染,甚至破坏生态平衡。而生态平衡的破坏往往始于微生物生态的不可逆改变,目前对消毒剂进入环境后对微生物生态的影响所知甚少,因此开展消毒剂进入环境后的微生物生态效应研究十分必要。本研究系科技部SARS专项研究课题(编号:2003A07)的部分内容。目的应用TGGE指纹图谱技术揭示微宇宙细菌种群多样性,初步了解消毒剂对微宇宙细菌群落结构的影响,为合理地使用消毒剂、最大限度地减轻消毒剂对微生态环境的破坏提供科学依据。方法构建6个池塘型微宇宙模拟水生态系统,1个设为对照组,试验组连续投加次氯酸钠13天,投加剂量分别为1.0 mg/L、2.5 mg/L、5.0 mg/L、10.0 mg/L和20.0 mg/L,停止投加后再观察10天。其中在消毒剂投加前(第0天)、投加后第1天、第5天、第9天、第13天、第15天(停止投加后48 h)、第19天、第23天共8个时期对各微宇宙分别进行采样,并测定游离性余氯和细菌总数,采用涂布平板法37℃培养48 h后提取细菌基因组总DNA,再用通用引物进行16S rDNA V3区扩增,对扩增产物进行TGGE分析,通过对比分析不同剂量组微宇宙8个时期的TGGE指纹图谱,揭示消毒剂对微宇宙细菌群落结构的影响。对微宇宙TGGE图谱中的主要条带进行回收、重新扩增、克隆建库、测序及序列分析,探讨TGGE条带的序列多态性和微宇宙细菌种群多样性。结果投加消毒剂后,游离氯的量与消毒剂投加剂量、投加时间成正比,停止投加后,游离氯量也随之明显下降。消毒剂投加剂量较低(1.0、2.5 mg/L)时,细菌总数不但没有减少,反而明显增加;投加剂量较高(10.0、20.0 mg/L)时,细菌总数明显减少甚至降低为零;停止投加后,细菌总数明显回升。对比分析各试验组微宇宙8个时期的TGGE指纹图谱,结果显示不同剂量组的TGGE指纹图谱存在明显差异,低剂量组图谱在消毒剂投加初期发生主弱条带倒置,但随后即恢复到投加前图谱模式;高剂量组图谱在投加初期变化不明显,但在停止投加后图谱中的主弱条带发生倒置,甚至一条带消失。TGGE条带的序列分析结果表明,同一TGGE条带是由序列不同的片段组成;测序所得21个序列按序列相似性≥97%的标准分成10个操作分类单元(OTU),全部OTU与GeneBank数据库中已登录的细菌种类的同源性均≥97%,根据系统进化关系可将其分为叁大类:Bacillus、Pseudomonas和Drinking water bacterium MB16,其中前两者为优势菌群。结论消毒剂进入环境后会对细菌群落结构产生影响,但不同剂量消毒剂产生的影响有显着差异,存在明显的剂量-效应关系:低剂量消毒剂对细菌群落结构的影响比较小,而且是可逆的,微宇宙系统对消毒剂逐渐适应后其群落结构即可恢复;而高剂量消毒剂对细菌群落结构的破坏比较大,且不可逆转,即使消毒剂停止投加后也不能恢复。本研究结果提示,盲目的过量投加消毒剂会对微生态环境造成严重破坏。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

温度梯度凝胶电泳论文参考文献

[1].张伟,李闻,张伟尉,马静,刘红艳.采用温度梯度凝胶电泳(TGGE)分析消毒剂对池塘型微宇宙细菌群落结构的影响[J].应用与环境生物学报.2008

[2].张伟.温度梯度凝胶电泳(TGGE)分析消毒剂对微宇宙细菌群落结构的影响[D].华中科技大学.2006

[3].谭虹虹,余细勇,单志新,符永恒,邓春玉.应用温度梯度凝胶电泳检测冠心病人β_2-AR基因多态性[J].中山大学学报(医学科学版).2005

[4].洪纬,魏桂芳,庞小燕,王凌华,赵立平.应用PCR与温度梯度凝胶电泳分析龈上菌斑微生物群落[J].中国微生态学杂志.2005

[5].庞小燕,赵立平.用TGGE(温度梯度凝胶电泳)分析人胃肠道中拟杆菌的组成[C].中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第叁届第七次学术研讨会论文集.2004

[6].谭端军,刘玲玲,文毅,薛桥,王士雯.时相温度梯度凝胶电泳在线粒体基因突变检测中的应用[J].解放军医学杂志.2004

[7].谭虹虹,余细勇,单志新,符永恒.应用温度梯度凝胶电泳筛选冠心病人β_2-AR的Gln27Glu突变[J].中国病理生理杂志.2003

[8].赵翔,安志东.现代生物技术在环境微生物学中的应用:Ⅲ.限制性片段长度多态性分析、变性/温度梯度凝胶电泳和报道基因[J].氨基酸和生物资源.2003

[9].谭端军,白仁奎,,LJC,Wong.时间温度梯度凝胶电泳结合基因测序对乳癌体细胞全线粒体DNA扫描及突变检测[J].中华老年多器官疾病杂志.2002

[10].赵永忠,徐湘民,杨阳.应用温度梯度凝胶电泳分析非缺失型〆-地中海贫血突变[J].中华医学遗传学杂志.2001

论文知识图

MTHFR基因外显子4的PCR扩增产物平行型...MTHFR基因外显子4的PCR扩增产物垂直型...不同处理PCR-DGGE图谱利用土壤总DNA分析土壤原生动物群落结...对照组8个时期的TGGE指纹图谱

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