水稻OsHDT703基因的鉴定和表达分析

水稻OsHDT703基因的鉴定和表达分析

论文摘要

植物所特有的HD2家族蛋白是一类重要的组蛋白去乙酰酶(HDAC),在调节真核生物的组蛋白乙酰化水平上起着重要作用,对植物的生长发育和逆境适应均具有重要的影响。水稻中存在3个HD2家族蛋白,其中OsHDT701和OsHDT702的生物学功能已被报道,OsHDT703的生物学功能目前尚未见报道。本研究在分析了OsHDT703基因及其所编码蛋白质特点的基础上,进一步鉴定了该基因可能存在的可变剪接体,揭示了正常和逆境下OsHDT703在水稻不同组织部位中的表达模式,初步确定了OsHDT703蛋白在细胞中的表达部位及其组蛋白去乙酰酶活性,创建了OsHDT703的CRISPR敲除表达、过量表达及其与FLAG融合表达的转基因水稻材料,为进一步研究OsHDT703基因的生物学功能奠定了基础。主要结果如下:1.OsHDT703及其编码蛋白的生物信息学分析OsHDT703位于水稻的第1号染色体上,启动子序列中含有多种与激素和逆境响应相关的作用元件,如干旱诱导的MYB结合位点MBS、ABA响应元件、赤霉素响应元件等。该基因存在5种可变剪接体,这些剪接体对应的编码蛋白均具有HD2家族蛋白保守的NPL结构域;系统进化树分析结果表明,OsHDT703蛋白与OsHDT702蛋白的进化关系较近,与OsHDT701蛋白的进化关系较远。2.OsHDT703蛋白的亚细胞定位及生化功能通过构建OsHDT703-GFP融合表达载体,转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析发现,OsHDT703蛋白主要在细胞核中表达。蛋白质免疫印迹实验结果表明,与野生型相比,OsHDT703其过量表达植株中H4组蛋白乙酰化水平则有明显降低的趋势;由此说明OsHDT703是一种组蛋白去乙酰化酶,能影响组蛋白H4的去乙酰化水平。3.正常和逆境下OsHDT703在水稻中的组织表达特性荧光定量PCR结果表明,正常情况下,OsHDT703基因在水稻的不同组织部位中均有表达,表达量最高的部位是茎,其次是幼穗,然后是根和叶片,籽粒中的表达量最低。OsHDT703基因对低温、干旱和高盐胁迫均匀响应,但响应的模式存在差异;在冷胁迫下,OsHDT703基因在根、茎、叶中的表达量均明显上调;干旱处理后,该基因在根和茎中的表达量均显著上调,叶中的表达量上调不显著;高盐处理后,OsHDT703基因在根和茎中均上调表达,而在叶中的表达量变化不明显。4.获得了OsHDT703的CRISPR敲除纯合突变体利用CRISPR基因编辑技术,共获得了24株阳性转基因T0代植株,有20株的靶位点发生了突变,阳性植株突变率为83.33%;20株中共有11株为纯合突变,纯合突变率为45.83%;纯合突变有4种类型,其中A碱基插入突变率为12.50%,T碱基插入突变率为16.67%,C碱基插入突变率为4.17%,C碱基缺失突变率为12.50%;这4种类型的纯合敲除突变均造成了OsHDT70基因编码的氨基酸序列翻译提前终止。5.创建了OsHDT703的过量表达及其与FLAG融合表达的转基因水稻材料构建了OsHDT703的过量表达载体和OsHDT703-FLAG融合表达载体,利用农杆菌介导法转化了粳稻中花11。目前获得了4个家系的OsHDT703基因过量表达T2代纯合植株,OsHDT703-FLAG融合表达转基因阳性T0代植株6株,为深入研究OsHDT703基因的生物学功能奠定了基础。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 前言
  •   1.1 表观遗传学
  •   1.2 组蛋白修饰作用
  •   1.3 组蛋白乙酰化
  •     1.3.1 组蛋白乙酰转移酶(HAT)
  •     1.3.2 组蛋白去乙酰化酶(HDAC)
  •   1.4 HD2 蛋白的研究进展
  •   1.5 本研究的目的和意义
  • 第二章 材料与方法
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 水稻材料
  •     2.1.2 载体和实验菌株
  •     2.1.3 实验试剂
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 OsHDT703 基因生物信息学分析
  •     2.2.2 OsHDT703 基因的启动子序列分析
  •     2.2.3 OsHDT703 蛋白进化分析
  •     2.2.4 载体构建
  •     2.2.5 水稻组织培养以及农杆菌介导的水稻遗传转化
  •     2.2.6 核酸相关实验
  •     2.2.7 转基因阳性植株的鉴定
  • 2 代过表达纯合植株筛选'>    2.2.8 T2代过表达纯合植株筛选
  •     2.2.9 提取水稻叶片总蛋白
  •     2.2.10 蛋白质免疫印迹(Western Blot)
  •     2.2.11 OsHDT703 亚细胞定位载体的构建
  •     2.2.12 拟南芥原生质体的制备及转化
  • 第三章 结果分析
  •   3.1 OsHDT703 基因的生物信息学分析
  •     3.1.1 水稻OsHDT703 基因的可变剪接体分析
  •     3.1.2 水稻OsHDT703 基因的启动子序列分析
  •     3.1.3 水稻OsHDT703 蛋白的结构特点
  •     3.1.4 水稻OsHDT703 蛋白的系统进化关系
  •   3.2 水稻OsHDT703 基因的可变剪接体鉴定
  •     3.2.1 可变剪接体的鉴定引物及其在可变剪接体上的位置
  •     3.2.2 水稻OsHDT703 基因可变剪接体的RT-PCR扩增
  •     3.2.3 OsHDT703 可变剪接体的RT-PCR产物克隆测序结果
  •   3.3 水稻OsHDT703 蛋白的亚细胞定位
  •   3.4 正常和逆境下水稻OsHDT703 基因的组织表达特性分析
  •     3.4.1 正常条件下OsHDT703 在水稻中的组织表达特性
  •     3.4.2 逆境下OsHDT703 在水稻不同组织中的差异表达
  •   3.5 水稻OsHDT703 的转基因材料创建
  •     3.5.1 水稻OsHDT703的CRISPR/Cas9 敲除载体构建
  •     3.5.2 水稻OsHDT703 的过量表达载体构建
  •     3.5.3 OsHDT703-FLAG融合表达载体的构建
  • 0 代植株'>    3.5.4 成功获得了OsHDT703 的转基因T0代植株
  • 0 代阳性植株'>    3.5.5 检测获得了OsHDT703 的转基因T0代阳性植株
  • 0 代突变类型鉴定'>    3.5.6 水稻OsHDT703 敲除植株T0代突变类型鉴定
  • 2 代纯合植株'>    3.5.7 鉴定获得了OsHDT703 的过量表达转基因T2代纯合植株
  •   3.6 H4 组蛋白的乙酰化水平检测
  • 第四章 讨论与展望
  •   4.1 水稻OsHDT703 基因的表达模式
  •   4.2 水稻OsHDT703 基因的启动子分析
  •   4.3 水稻OsHDT703 基因可能具有组蛋白去乙酰化酶的作用
  •   4.4 OsHDT703 基因的研究展望
  • 致谢
  • 参考文献
  • 附录A
  • 攻读学位期间的研究成果
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 邹志明

    导师: 李绍波

    关键词: 组蛋白去乙酰化酶,表达模式,亚细胞定位,水稻,可变剪接体

    来源: 南昌大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 南昌大学

    基金: 国家自然科学基金(31560383和31460279)

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.27232/d.cnki.gnchu.2019.001859

    总页数: 60

    文件大小: 9893K

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    • [1].水稻OsHDT703基因的可变剪接体分析[J]. 华北农学报 2019(04)

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