生菜连作及生菜-菠菜轮作对土壤细菌群落结构的影响

论文摘要

以生菜连作和生菜-菠菜轮作不同次数的土壤样品为材料,研究比较生菜不同种植方式下土壤细菌群落的差异。采集0-20 cm深度土壤样品,分别提取样品总DNA,采用高通量测序技术分析生菜种植前后土壤样品中细菌多样性。测序结果经过质控过滤,共获得有效序列46 865条,对相似水平为97%的OTU进行生物信息统计分析,共得到OTU 21 692个。Heatmap图和群落组成分析显示,样品共检测到细菌40个门,89个纲,190个目,371个科,693个属,其中变形菌门、厚壁菌门和放线菌门在连作过程中占比逐渐下降,而在轮作过程中较为稳定。另外,壤霉菌属、节细菌属、黄杆菌属、溶杆菌属及微细菌属等有益菌属逐渐成为轮作土壤样品中的优势菌属。主成分分析结果表明,轮作和连作土壤样品差异明显。生菜在连续种植第5次后,产量和过氧化氢酶活性分别下降了24.1%和20.7%,出现连作障碍,而轮作生菜产量和过氧化氢酶活性较连作分别提高了49.6%和10.5%。菠菜-生菜轮作土壤中细菌类群具有丰富的多样性,随着轮作的增加有上升的趋势,可在一定程度上缓解生菜连作过程中出现的问题。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 大田试验设计
•     1.2.2 样品采集及指标测定
•     1.2.3 土壤微生物基因组DNA的提取及16S rRNA基因PCR扩增
•     1.2.4 数据统计
• 2 结果
•   2.1 序列质量控制及细菌群落组成分析
•   2.2 OTU聚类分析
•   2.3 主成分分析与ANOSIM分析
•   2.4 LEfSe多级物种差异分析
•   2.5 生菜植株的产量及土壤过氧化氢酶活性
•   2.6 细菌群落结构与生菜产量、过氧化氢酶活性的相关性
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 洪洁,康建依,刘一倩,高秀芝,易欣欣

关键词: 细菌群落结构,生菜,轮作,连作

来源: 生物技术通报 2019年08期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,园艺

单位: 食品质量安全北京实验室农产品有害微生物及农残安全检测与控制北京市重点实验室微生态制剂关键技术开发北京市工程实验室北京农学院食品科学与工程学院

基金: 北京市叶类蔬菜产业创新团队(BAIC07-2019)

分类号: S154.3;S636.2;S636.1

DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0182

页码: 17-26

总页数: 10

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