玉米Alfin-like转录因子ZmAL5a生物信息和表达分析

论文摘要

Alfin-like基因家族是植物中特有的一类转录调控因子,目前已明确该类转录因子在调控植物生长发育、非生物胁迫响应等过程中起重要作用,但其对生物胁迫的响应仍知之甚少。本研究运用一系列生物信息学方法和基因表达谱对C4作物玉米ZmAL5a基因及其蛋白进行了结构及功能分析。结果表明,玉米ZmAL5a蛋白中的二级构象主要有两种,即α-螺旋和无规则卷曲,各自所占比例分别为43.57%和31.73%。启动子和基因表达分析进一步表明ZmAL5a和β-1,3-GA2基因不但响应非生物胁迫（盐,干旱）,而且对病原菌胁迫也产生响应,表明其参与了玉米对病原菌入侵的信号响应通路。本研究为深入探讨玉米ZmAL5a因子的功能及抗病原菌机理提供线索。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 ZmAL5a的结构域分析及系统发育树构建
•   1.2 ZmAL5a蛋白理化性质分析
•   1.3 ZmAL5a蛋白二级构象和三级结构分析
•   1.4 ZmAL5a基因启动子和表达分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 数据来源
•   3.2 ZmAL5a的结构域及系统发育树
•   3.3 ZmAL5a蛋白亲疏水性和理化参数计算
•   3.4 ZmAL5a蛋白二级构象和三级结构预测和评估
•   3.5 ZmAL5a基因启动子结合位点和表达量分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王姣姣,孙宁,刘征

关键词: 玉米,转录因子,生物信息

来源: 分子植物育种 2019年15期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 河北大学生命科学学院,河北保定师范附属学校

基金: 河北省自然科学基金(C2015201176)资助

分类号: Q943.2;S513

DOI: 10.13271/j.mpb.017.004859

页码: 4859-4864

总页数: 6

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