中性进化论文-邓冠奇

中性进化论文-邓冠奇

导读:本文包含了中性进化论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:第叁代,高音单元,钻石,岛状硅酸盐矿物

中性进化论文文献综述

邓冠奇[1](2016)在《越进化越中性,越中性越强悍 第叁代B&W 804 Diamond》一文中研究指出B&W的800系列,相信不用我多说大家对它都很了解的吧!作为副主编的我,80后出生,我不敢说自己对800系列、对B&W很了解,但也曾经是B&W 805 Matrix、CDM1SE的用家。我有一段时间很喜欢B&W的声音,特别是805 Matrix,我拥有了2年时间。我当时喜欢它那很传统的(本文来源于《家庭影院技术》期刊2016年02期)

雷达[2](2014)在《米曲霉中性蛋白酶基因在毕赤酵母中的重组表达及定向进化》一文中研究指出米曲霉中性蛋白酶(neutral protease)是米曲霉在代谢过程中产生的酶系,主要用于酱油酿造生产中,以大豆或豆粕及小麦或面粉为主要原料,经过蛋白酶的分解作用,将蛋白质发酵水解成多种氨基酸,再结合其它的发酵产物,经过复杂的生物化学反应,形成具有特殊色泽、滋味和体态的调味液。毕赤酵母(Pichiapastoris)是一种单细胞真核生物,为甲醇营养型,近年来已被广泛用于商业化生产外源蛋白,能对许多蛋白进行分泌表达,并产生各种不同的翻译后修饰过程,如多肽的折迭、糖基化、甲基化、酰化作用等。毕赤酵母表达外源蛋白过程中发生的糖基化现象是一种十分重要的翻译后修饰过程,它能对蛋白质合成过程中的折迭、组装、结构稳定性、特定信号转导、识别和分泌等产生的一系列作用。基于非理性设计的定向进化技术能够使研究者们在实验室内模拟自然进化机制,将自然界需上亿年才能完成的进化缩短至几个月,在短期内创造出新的酶类。利用定向进化技术对米曲霉中性蛋白酶进行改造,并从中筛选出理想的突变型,可有效改善蛋白酶在工业生产中的应用,最终为提高原料蛋白质利用率及改善酱油风味,降低生产成本奠定基础。主要研究结果如下:1中性蛋白酶在毕赤酵母中的表达、纯化及性质分析构建了pPIC9K-NPI-6His表达载体,转入毕赤酵母GS115并利用BMGY/BMMY培养基诱导表达,诱导培养72h时表达上清酶活达到最高,为46U/mL。对表达的重组中性蛋白酶进行硫酸铵沉淀及镍柱纯化,SDS-PAGE分析纯化效果良好,蛋白大小为55kDa。对纯化后重组中性蛋白酶进行酶学性质分析:其最适反应pH为7.5,在pH7.0的时候稳定性最好;最适反应温度为55oC,对其进行热稳定性测定,50oC以下对酶活影响不大,置于60oC时保温1h后,表达的中性蛋白酶完全失活;金属离子Ca2+、 Mg2+、 Li+等对中性蛋白酶酶活影响不大,但Zn2+、Cu2+的加入则使中性蛋白酶酶活下降显着,丝氨酸蛋白酶抑制剂PMSF对酶活无影响,但金属离子蛋白酶抑制剂EDTA和Phen使蛋白酶完全失活,表面离子活性剂TritonX-100使中性蛋白酶酶活稍有下降。2重组中性蛋白酶的糖基化分析对纯化后的NPI进行糖基化现象的确定及糖基化位点的鉴定。PAS染色法及Endo H去糖基化处理法确定了NPI重组蛋白发生了糖基化现象,去糖基化前后蛋白分子量经MALDI-TOF-MS测定分别为54.5kDa和43.3kDa,nano LCMS/MS鉴定到其成熟肽段第41位氨基酸Asn为糖基化发生位点。利用I-TASSER对NPI蛋白进行叁维结构模拟,发现该糖基化位点位于一处loop环结构上,与NPI蛋白酶活性中心相距较远。利用定点突变技术构建了N41A去糖基化突变株,通过去除表达过程中的糖基化现象来研究糖基化作用对表达的蛋白酶酶活的影响。突变后蛋白分子量大小降至43kDa左右,通过测定突变前后中性蛋白酶酶活并进行比较,发现非糖基化的中性蛋白酶几乎完全丧失酶活,由此证明糖基化作用在NPI表达过程中产生了重要影响。3提高重组中性蛋白酶热稳定性的定向进化利用易错PCR的方法成功构建了NPI毕赤酵母随机突变文库,其库容量为2×104个重组酵母转化子,50%的重组子仍具有中性蛋白酶活力。在构建的随机突变文库中成功筛得一株热稳定性提高的突变体酶,其最适反应温度由野生株的55oC提高至60oC,突变后的酶液56oC半衰期由野生株的7.9min增长至16.7min,为野生株的2.1倍。对野生型NPI蛋白及S93A突变后NPI蛋白进行叁维结构模拟,分析氨基酸突变对蛋白结构的影响。通过两者结构对比发现,第93位氨基酸位于NPI蛋白的一处α-螺旋结构上,Ser突变为Ala后,与其它氨基酸之间增加了两处氢键作用力,且与93位氨基酸前后的非极性氨基酸丙氨酸(Ala)和异亮氨酸(Ile)形成了新的疏水作用力A92-A93和A93-I94,促进NPI蛋白热稳定性提高。(本文来源于《南昌大学》期刊2014-05-30)

阳文广[3](2014)在《进化图中性漂变研究》一文中研究指出进化图论是结合了进化生物学以及数学等学科的新的研究领域,是研究种群空间结构对种群进化动态影响的一种行之有效的方法。自Lieberman等人引入进化图论以来,它已经基本形成了成熟的科学理论体系。进化动力学理论为进化图论探索种群结构对进化动态的影响提供了强有力的数学理论基础。本文在进化图论已有研究的基础上,结合中性进化理论进一步研究了种群进化动态的两个动力学特征-固定概率和固定时间。本文在第叁章分析研究了基于生灭过程的双向线型图的固定概率问题,给出了中性漂变下图上每个突变个体的固定概率以及随机产生的单个突变个体的平均固定概率的表达公式,进一步通过线性方程组的方法分析讨论了随机漂变下每个突变个体的固定概率以及随机产生的单个突变个体的平均固定概率的求解方法。第四章在birth-death过程下,探索有向环、无向环以及完全图叁种特殊等温图的平均固定时间,尤其是重点考虑了近似中性漂变下随机产生的突变个体的平均固定时间并分析得到了在近似中性漂变条件下,等温图的平均固定时间在不利突变下单调递增,在有利突变下单调递减的结论,进一步扩展了进化图理论。(本文来源于《暨南大学》期刊2014-05-10)

陈贤富,郭晶,任岳淼[4](2014)在《中性进化算法模型及其实验研究》一文中研究指出借鉴生物学中的非达尔文进化理论,并针对传统遗传算法中可能存在的"早熟收敛"、种群多样性维护困难等方面的问题,提出一种无传统"选择"操作的"中性进化"算法模型.该模型基于木村资生中性进化思想,侧重交叉和变异纯随机遗传操作,并采用自适应种群更新策略,使得算法结构更为简洁、多样性维持能力有所加强.若干数值类型的多峰函数测试以及复杂经典NP类318城市货郎担问题实验研究,已初步显示出中性进化算法在抑制"遗传支配"现象、避免陷入"早熟收敛"以及改进遗传算法的全局优化效果方面与Holland传统遗传算法相比性能较优的特性.(本文来源于《小型微型计算机系统》期刊2014年04期)

周子君[5](2013)在《中性时尚的变革与进化》一文中研究指出中性风在如今看来早已不是什么值得大肆渲染的New Style。但从另一个角度来说,已是时尚主流风尚的中性风其实一直以来都并未停留于原始的阶段,而是在廓形、色彩以及设计理念等方面,潜移默化地推进着时尚的脚步,并成为最终赋予时尚界更多让人耳目一新甚至掀起时髦(本文来源于《中国经营报》期刊2013-03-18)

姚友旭,李雨霏,侯晟琦,李春梅,陈惠[6](2011)在《基于易错PCR技术的中性内切葡聚糖酶基因的定向进化》一文中研究指出纤维素酶的工业应用一直受酶活性低,成本高的限制,为了提高中性内切葡聚糖酶的活性,本研究利用易错PCR技术对来自枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)C-36的内切葡聚糖酶基因进行定向进化研究,在酶分子水平上改造内切葡聚糖酶分子。实验获得了最佳突变株b-15和b-28,其内切葡聚糖酶活力比亲本酶分别提高了2.1和3.6倍。序列分析表明:突变体b-15有6个碱基发生了突变,分别是A360G、T402A、A419T、T648A、A1208G和A1397T,导致4个氨基酸突变,分别是N134K、Q140L、N403S和Q466L;b-28只有1个碱基发生了突变,导致了398位Lys突变为Arg。通过SWISS-MODEL服务器模拟酶的叁维结构,分析表明,b-15改变的4个氨基酸分别位于催化结构域的第4和第5个α螺旋之间的转角和结合结构域的第5个β折叠及第9和第10个β折叠之间的转角;b-28的突变位于结合结构域的第4个β折叠。同时,对获得的两株突变株b-15和b-28用正交试验优化产酶条件,优化后的酶活分别达到4.542和5.136 U/mL,是优化前的2.2和1.5倍。实验获得了酶活性提高的内切葡聚糖酶菌株,为进一步在分子水平研究内切葡聚糖酶的功能和其应用打下了基础,也为高酶活酶分子在其他高表达系统的表达提供了基础材料。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2011年06期)

侯化鹏[7](2008)在《枯草芽孢杆菌中性蛋白酶nprE的定向进化研究》一文中研究指出枯草芽孢杆菌中性蛋白酶(neutral protease),是一类被广泛应用于工业生产的酶类,在洗涤剂、制革、丝绸、食品加工等多种行业上有着广泛的用途。本课题主要是通过体外定向分子进化技术,改造nprE基因,从而构建能够高效稳定生产中性蛋白酶的枯草芽孢杆菌菌株。主要结果如下:1.运用PCR技术,从枯草芽孢杆菌标准株扩增出强启动子P43序列和nprE全长基因。克隆到pMD18-T载体中,鉴定了上述基因。标准株nprE序列与已公布序列完全相同。2.鉴定了产蛋白酶效率较高的11株分离株,PCR扩增得到其中8株的nprE全长基因。3.构建枯草芽孢杆菌原核表达载体pNP43-nprE,重组质粒转化枯草芽孢杆菌168菌株,并在枯草芽孢杆菌中表达,12%SDS-PAGE电泳分析,重组菌可表达分子量分别约为42kDa的蛋白。经抗生素压力选择后,表达量在OD600为0.8时,酶产量出现最高,粗酶液酶活力达到了出发菌株的3倍。3.以nprE全长基因为出发点,应用基因家族改组(Familly DNA Shuffling)技术,以标准株和野生型菌株的nprE基因作为材料,对其进行突变。在酶产率未提高的情况下,第一轮筛选,突变株酶活力提高了126%,以第一轮筛选的高活力突变株为基础进行第二轮突变和筛选,酶活力又提高了将近90%,且能够稳定遗传。分析表明,nprE基因的碱基发生了改变。这种改变引起了其产物中性蛋白酶分子的氨基酸的改变,从而造成酶活力的改变。通过比较,发现应用表达载体在抗生素压力下提高了酶的产量。定向进化则改变了基因结构从而提高了酶活力,相比表达载体更为经济和稳定。(本文来源于《华中农业大学》期刊2008-06-01)

刘鹤玲,刘奇[8](2006)在《分子进化中性学说对达尔文进化论的冲击和完善》一文中研究指出分子进化中性学说对达尔文进化论的自然选择和表型进化造成了一定冲击。但是,分子进化中性学说对达尔文的自然选择学说并不构成否定,而是在分子进化水平上对自然选择学说作出相应的补充和完善。(本文来源于《广西社会科学》期刊2006年04期)

王向军,林春生,龚沈光[9](2003)在《基于中性进化、自组织和自然选择的进化算法》一文中研究指出生物的进化同时在基因层、个体层和种群层进行。基因层上的进化是随机、均匀、无方向性的 ;个体层的随机行为通过自组织作用形成种群的复杂行为 ;种群的进化则是一个以环境为参考的自然选择过程。基于此 ,本文提出了一种基于中性进化 ,自组织和自然选择的进化算法 ,该算法同时考虑基因层、个体层和种群层上的进化过程以及叁个层次间的相互作用和映射关系。提出了个体能力评估函数 f ( xi)的概念 ,分析了个体能力评估函数f( xi)与种群适应度函数 fit( X)间的关系。对该算法的性能进行了仿真研究 ,仿真结果表明该算法相对于传统的进化算法具有更好的全局收敛性 ,更快的收敛速度和更强的参数鲁棒性(本文来源于《数据采集与处理》期刊2003年04期)

陈建华[10](2000)在《进化需要宽容——生物进化的新中性学说》一文中研究指出适应性进化是一种非本质的进化。生物在本质意义上的进化必须以不受选择为前提,这一点正好与达尔文的主张相反,所以是反达尔文主义的。不选择与木村的观点相近,而且造成进化的机制也是随机固定,但木村针对的是分子水平上的中性突变,这里针对的则是生命过程的一次飞跃,所以,这不是中性学说的简单推广,而是一种新的中性学说。(本文来源于《自然杂志》期刊2000年01期)

中性进化论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

米曲霉中性蛋白酶(neutral protease)是米曲霉在代谢过程中产生的酶系,主要用于酱油酿造生产中,以大豆或豆粕及小麦或面粉为主要原料,经过蛋白酶的分解作用,将蛋白质发酵水解成多种氨基酸,再结合其它的发酵产物,经过复杂的生物化学反应,形成具有特殊色泽、滋味和体态的调味液。毕赤酵母(Pichiapastoris)是一种单细胞真核生物,为甲醇营养型,近年来已被广泛用于商业化生产外源蛋白,能对许多蛋白进行分泌表达,并产生各种不同的翻译后修饰过程,如多肽的折迭、糖基化、甲基化、酰化作用等。毕赤酵母表达外源蛋白过程中发生的糖基化现象是一种十分重要的翻译后修饰过程,它能对蛋白质合成过程中的折迭、组装、结构稳定性、特定信号转导、识别和分泌等产生的一系列作用。基于非理性设计的定向进化技术能够使研究者们在实验室内模拟自然进化机制,将自然界需上亿年才能完成的进化缩短至几个月,在短期内创造出新的酶类。利用定向进化技术对米曲霉中性蛋白酶进行改造,并从中筛选出理想的突变型,可有效改善蛋白酶在工业生产中的应用,最终为提高原料蛋白质利用率及改善酱油风味,降低生产成本奠定基础。主要研究结果如下:1中性蛋白酶在毕赤酵母中的表达、纯化及性质分析构建了pPIC9K-NPI-6His表达载体,转入毕赤酵母GS115并利用BMGY/BMMY培养基诱导表达,诱导培养72h时表达上清酶活达到最高,为46U/mL。对表达的重组中性蛋白酶进行硫酸铵沉淀及镍柱纯化,SDS-PAGE分析纯化效果良好,蛋白大小为55kDa。对纯化后重组中性蛋白酶进行酶学性质分析:其最适反应pH为7.5,在pH7.0的时候稳定性最好;最适反应温度为55oC,对其进行热稳定性测定,50oC以下对酶活影响不大,置于60oC时保温1h后,表达的中性蛋白酶完全失活;金属离子Ca2+、 Mg2+、 Li+等对中性蛋白酶酶活影响不大,但Zn2+、Cu2+的加入则使中性蛋白酶酶活下降显着,丝氨酸蛋白酶抑制剂PMSF对酶活无影响,但金属离子蛋白酶抑制剂EDTA和Phen使蛋白酶完全失活,表面离子活性剂TritonX-100使中性蛋白酶酶活稍有下降。2重组中性蛋白酶的糖基化分析对纯化后的NPI进行糖基化现象的确定及糖基化位点的鉴定。PAS染色法及Endo H去糖基化处理法确定了NPI重组蛋白发生了糖基化现象,去糖基化前后蛋白分子量经MALDI-TOF-MS测定分别为54.5kDa和43.3kDa,nano LCMS/MS鉴定到其成熟肽段第41位氨基酸Asn为糖基化发生位点。利用I-TASSER对NPI蛋白进行叁维结构模拟,发现该糖基化位点位于一处loop环结构上,与NPI蛋白酶活性中心相距较远。利用定点突变技术构建了N41A去糖基化突变株,通过去除表达过程中的糖基化现象来研究糖基化作用对表达的蛋白酶酶活的影响。突变后蛋白分子量大小降至43kDa左右,通过测定突变前后中性蛋白酶酶活并进行比较,发现非糖基化的中性蛋白酶几乎完全丧失酶活,由此证明糖基化作用在NPI表达过程中产生了重要影响。3提高重组中性蛋白酶热稳定性的定向进化利用易错PCR的方法成功构建了NPI毕赤酵母随机突变文库,其库容量为2×104个重组酵母转化子,50%的重组子仍具有中性蛋白酶活力。在构建的随机突变文库中成功筛得一株热稳定性提高的突变体酶,其最适反应温度由野生株的55oC提高至60oC,突变后的酶液56oC半衰期由野生株的7.9min增长至16.7min,为野生株的2.1倍。对野生型NPI蛋白及S93A突变后NPI蛋白进行叁维结构模拟,分析氨基酸突变对蛋白结构的影响。通过两者结构对比发现,第93位氨基酸位于NPI蛋白的一处α-螺旋结构上,Ser突变为Ala后,与其它氨基酸之间增加了两处氢键作用力,且与93位氨基酸前后的非极性氨基酸丙氨酸(Ala)和异亮氨酸(Ile)形成了新的疏水作用力A92-A93和A93-I94,促进NPI蛋白热稳定性提高。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

中性进化论文参考文献

[1].邓冠奇.越进化越中性,越中性越强悍第叁代B&W804Diamond[J].家庭影院技术.2016

[2].雷达.米曲霉中性蛋白酶基因在毕赤酵母中的重组表达及定向进化[D].南昌大学.2014

[3].阳文广.进化图中性漂变研究[D].暨南大学.2014

[4].陈贤富,郭晶,任岳淼.中性进化算法模型及其实验研究[J].小型微型计算机系统.2014

[5].周子君.中性时尚的变革与进化[N].中国经营报.2013

[6].姚友旭,李雨霏,侯晟琦,李春梅,陈惠.基于易错PCR技术的中性内切葡聚糖酶基因的定向进化[J].农业生物技术学报.2011

[7].侯化鹏.枯草芽孢杆菌中性蛋白酶nprE的定向进化研究[D].华中农业大学.2008

[8].刘鹤玲,刘奇.分子进化中性学说对达尔文进化论的冲击和完善[J].广西社会科学.2006

[9].王向军,林春生,龚沈光.基于中性进化、自组织和自然选择的进化算法[J].数据采集与处理.2003

[10].陈建华.进化需要宽容——生物进化的新中性学说[J].自然杂志.2000

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中性进化论文-邓冠奇
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