导读:本文包含了序列分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:序列,转录,模型,平均,间隔,基因,核糖体。
序列分析论文文献综述
胡一凡,张雪梅,石乃星,杨志清[1]（2019）在《云南草果种质资源DNA条形码序列分析》一文中研究指出目的筛选与评价适用于云南草果居群的DNA条形码。方法以云南省草果种质资源为样本对ITS、psbA-trnH、matK、rbcL和ycf15条DNA条形码常用序列进行筛选与评价,并对草果居群进行扩增,测序,测序序列用Genestar进行拼接,然后用Mega进行数据处理,并对草果多样性及其鉴定进行分析。结果引物ITS5和ITS4对草果的扩增片段长度大约为520 bp;rbcLa-F和rbcLa-R对草果的扩增片段长度大约为498 bp;引物ycf1-bF和ycf1-bR对草果的扩增片段长度大约为800 bp;引物psb A-trn H-1F和psbA-trnH-1R对草果的扩增片段长度大约为400 bp;引物matK-2F和matK-2R对草果的扩增片段长度大约为470 bp。扩增及测序的成功率均较高,结果大多可用。通过对草果ITS、psb A-trnH、matK和ycf1序列的扩增结果进行分析,草果与其他豆蔻属植物都可以被清晰地区分开;ITS序列所有样本分为MG5白花草果居群和其他居群;psb A-trn H序列所有样本分为MG5白花草果居群,MG6黄花草果居群和其他居群;matK序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果样本扩增失败;ycf1序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果居群与其他22个草果居群聚为一支;rbcL序列对所有样本的扩增均一致。结论 ITS、matK、psb A-trn H及ycf1序列均能将草果与其他同属植物进行准确区分;MG6的matK、psbA-trnH及ycf1序列发现了序列位点的变异,为草果品种的选育做出贡献。ITS和psb A-trn H序列可将黄花和白花草果序列区分开;草果白花黄花所有样本rbcL序列无任何变异,且用rbcL序列无法鉴别草果与其他同属植物,可将其舍去。(本文来源于《中草药》期刊2019年24期）
陈金林,张学谦[2]（2019）在《资产价格序列分析中的随机扰动探究》一文中研究指出随机扰动在资产价格序列分析中具有特别重要的作用,区分其表现形式和性质不管在理论上还是在实践中都具有较大的意义。本文通过分析稳定的和非稳定的价格序列中随机扰动的作用,发现其在不同状态中的形式和性质各有特点。特别是,随机扰动在随机趋势价格序列中具有的表现,使得随机趋势与确定性趋势在图形上很形似,但是统计性质非常不同。随机扰动的作用在一定程度上影响了我们对随机趋势和确定性趋势的有效区别。(本文来源于《价值工程》期刊2019年36期）
唐燕[3]（2019）在《项目驱动的《时间序列分析》课程教学改革与实践》一文中研究指出《时间序列分析》课程教学运用项目驱动教学法,构建开放多元的教学模式,让学生参与到老师的具体项目、课题中或自选经济、管理等前沿问题的时序模型研究,是提高实践环节和理论方法的教学匹配度,锻炼学生利用时序方法分析实际问题能力的重要措施。(本文来源于《课程教育研究》期刊2019年51期）
王丹丹,孙英新[4]（2019）在《石柱参人参皂苷合成酶基因SS的克隆与序列分析》一文中研究指出以石柱参近缘种野生山参的人参皂苷合成酶基因SS为模板,利用NCBI中的primer-BLAST设计特异性引物,应用PCR技术从石柱参叶片基因组DNA克隆了SS基因。序列分析显示,克隆的基因片段为1 285 bp,能够编码25个氨基酸以上的ORF (Open Reading Frame)有10个,其中最长能够编码295个氨基酸。NCBI序列对比显示,该基因与人参的人参皂苷合成酶基因SS的同源性为97. 05%,与西洋参的人参皂苷合成酶基因SS的同源性为96. 63%。这些数据表明,从石柱参克隆的基因为其人参皂苷合成酶基因SS。(本文来源于《辽东学院学报(自然科学版)》期刊2019年04期）
张坤,陈雯,甘海峰,罗云建,陈夕军[5]（2019）在《江苏省扬州市水仙病毒检测鉴定与序列分析》一文中研究指出水仙属于石蒜科水仙属,是重要的观赏花卉之一。2016年-2017年,在江苏省扬州市采集的水仙上发现典型的花叶、条斑等病毒病症状。利用已报道的水仙病毒通用引物对疑似病样进行RT-PCR检测,结果表明,扬州采集到的3份病样上均能扩增到与预期大小相同的DNA片段。经克隆测序和序列分析发现,所得序列包含3种不同的类型,分别与水仙普通潜隐病毒Narcissus common latent virus(NCLV)、水仙退化病毒Narcissus degeneration virus(NDV)和水仙黄条病毒Narcissus yellow stripe virus(NYSV)有93%、98%和99%的相似性,表明江苏水仙受到了NCLV、NDV、NYSV 3种病毒侵染。这是江苏水仙上第一次发现NCLV、NDV、NYSV。在系统树中,NCLV可分为两个组,本研究所得NCLV-YZ与上海分离物位于同一组中;NDV也可分为两个组,本研究所得NDV与其他中国分离物均位于第二组;而NYSV具有很高的多样性,可分为4个组,本研究所得NYSV与其他部分中国分离物和日本分离物位于第一组。NCLV和NDV分组具有清晰的地理差异性,而NYSV受到地理隔离的影响不明显。(本文来源于《植物保护》期刊2019年06期）
张凯强,常志成,温海深,李吉方,齐鑫[6]（2020）在《花鲈低氧诱导因子基因(hifs)的序列分析及低氧诱导表达》一文中研究指出低氧诱导因子基因(hifs)是由α和β构成的异源二聚体转录因子,在生物低氧应答中发挥着重要作用。本实验对花鲈4个hifs基因进行了序列分析及组织表达检测,并检测了各基因在低氧诱导后的mRNA表达变化。研究表明,通过全基因组比对、进化树分析和共线性分析,共鉴定出花鲈的4个hifs基因,分别为hif1α、hif2α、hif3α、hif1β。组织表达结果显示,hifs基因具有组织特异性表达特征。低氧((1.56±0.24)mg/L)诱导下,hifs各基因的响应时间和响应程度存在一定差异。肝组织中,低氧胁迫3和6 h后,hif1α、hif2α、hif3α和hif1β表达量均出现了显著升高,表明hifα和hif1β基因可能共同起低氧调控作用;而低氧胁迫12 h后,仅hif1α表达量显著高于对照组,表明hif1α基因在肝组织低氧调控12 h内持续起作用。鳃组织中,低氧胁迫3 h后,hif1α、hif2α、hif3α基因表达量出现了显著升高,而低氧胁迫6 h后,hif3α和hif1β基因表达量显著升高,说明在鳃组织前3h的低氧胁迫中仅hifα基因起调控作用,而6 h后hif3α和hif1β基因共同调控低氧胁迫。常氧恢复阶段肝、鳃组织中各基因表达量均与对照组无显著差异。本研究结果表明,4个hifs基因的组织表达具有特异性,同时对低氧的响应时间和程度不同,研究结果弥补了花鲈hifs基因及低氧应答研究的空白。(本文来源于《中国海洋大学学报(自然科学版)》期刊2020年01期）
韩玲,王鸿,颜隆,高治理,贺娟[7]（2019）在《河北省手足口病发病趋势的时间序列分析》一文中研究指出目的:运用季节性自回归移动平均混合(SARIMA)模型分析预测河北省手足口病发病趋势的可行性和适用性,为手足口病的防控工作提供决策依据。方法:利用R3.5.1软件对河北省2008年1月至2014年12月手足口病月发病率资料进行建模,并以2015年手足口病月发病率资料验证模型的预测效果。结果:模型SARIMA(1,1,1)(0,1,1)12较好地拟合了河北省手足口病月发病率资料,模型残差为白噪声序列(Ljung-Box Q=9.289,P=0.411),预测值与实际值的相对误差范围为0.924%～35.526%,平均相对误差为13.408%。结论:SARIMA模型可较好地反映河北省手足口病的发病趋势并进行短期预测。(本文来源于《中华中医药杂志》期刊2019年12期）
蒋波,冯震,秦峰,刘浩,杨美成[8]（2019）在《药品质量控制中常见产毒真菌ITS和LSU rRNA基因的序列分析》一文中研究指出目的:评价rRNA基因的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和大亚基单元(large subunit,LSU)序列对药品质量控制中常见产毒真菌的鉴定作用。方法:以形态分类方法对8个产毒真菌属的菌株进行初步鉴定;然后从试验菌株中提取基因组DNA,对ITS和LSU序列进行PCR扩增和序列测定,通过序列聚类关系分析,进一步评价不同序列对产毒真菌的分子鉴定能力。结果:分别采用ITS、LSU rRNA基因序列分析方法对产毒真菌的鉴定至少可达到"属"水平,采用ITS和LSU rRNA基因的串联序列可以将青霉属和曲霉属中的试验菌株鉴定至"种"水平。结论:ITS和LSU rRNA序列系统发育分析可作为产毒真菌的鉴定方法。(本文来源于《药物分析杂志》期刊2019年11期）
张田,潘尔顺[9]（2019）在《基于时间序列分析的电容器退化模型》一文中研究指出针对高温下电容器电容值下降的问题,基于差分自回归移动平均(ARIMA)模型及分数阶自回归移动平均(ARFIMA)模型,引入时间序列分析法预测电容值的退化轨迹.对于ARIMA模型,当电容器的退化过程服从Wiener分布时,利用过差分预判法(OPM)预判原时间序列的过差分阶数;根据单位根检验、自相关及偏自相关函数的计算结果确定经过一阶差分后的时间序列的平稳性.对于ARFIMA模型,利用重标极差法判定退化数据是否具有长期记忆性;通过最小准则及极大似然法估计模型阶数及其相关参数值.最后,通过残差检验验证OPM-ARIMA及ARFIMA模型在提取有效信息与准确预测两方面的能力,并进一步分析了这两种模型的可行性与有效性.(本文来源于《上海交通大学学报》期刊2019年11期）
任翔,杨菁,邹颜秋硕,杨祖顺[10]（2019）在《云南省6种鹅膏菌DNA条形码序列分析》一文中研究指出目的对云南省6种鹅膏菌的核糖体大亚基(nuclear large-subunit ribosomal DNA,nLSU rDNA)及内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)DNA序列进行比对分析,探究其亲缘关系以找到合适的鉴定鹅膏菌DNA条形码序列的方法。方法采用试剂盒离心柱法提取6种鹅膏菌DNA,以ITS4/ITS5作为ITS序列引物和LR5/LROR作为nLSU序列的引物进行PCR扩增,后送至华大基因科技有限公司进行测序。所返回的序列进行遗传距离分析及邻接树构建。结果球基鹅膏、红托鹅膏与小豹斑鹅膏3种鹅膏菌亲缘关系较近。以ITS序列分析,叁者遗传距离在0.0202～0.0801之间。以nLSU序列分析,叁者遗传距离在0.0031～0.0303之间。黄毒蝇鹅膏与赭盖鹅膏菌H2在ITS序列中与黄毒蝇鹅膏20、21、H7、D1、D16、D24亲缘关系较近,遗传距离在0.0462～0.0479。赭盖鹅膏菌7与黄毒蝇鹅膏D14两株菌遗传距离仅有0.1528。从邻接树来看ITS序列存在种内多,聚类分析结果不稳定,明显不同的2个种聚为一支。而nLSU序列可将各种分离开。结论建议鹅膏菌快速鉴定选用nLSU序列作为主要鉴定序列, ITS序列作为辅助序列。(本文来源于《食品安全质量检测学报》期刊2019年22期）
序列分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
随机扰动在资产价格序列分析中具有特别重要的作用,区分其表现形式和性质不管在理论上还是在实践中都具有较大的意义。本文通过分析稳定的和非稳定的价格序列中随机扰动的作用,发现其在不同状态中的形式和性质各有特点。特别是,随机扰动在随机趋势价格序列中具有的表现,使得随机趋势与确定性趋势在图形上很形似,但是统计性质非常不同。随机扰动的作用在一定程度上影响了我们对随机趋势和确定性趋势的有效区别。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列分析论文参考文献
[1].胡一凡,张雪梅,石乃星,杨志清.云南草果种质资源DNA条形码序列分析[J].中草药.2019
[2].陈金林,张学谦.资产价格序列分析中的随机扰动探究[J].价值工程.2019
[3].唐燕.项目驱动的《时间序列分析》课程教学改革与实践[J].课程教育研究.2019
[4].王丹丹,孙英新.石柱参人参皂苷合成酶基因SS的克隆与序列分析[J].辽东学院学报(自然科学版).2019
[5].张坤,陈雯,甘海峰,罗云建,陈夕军.江苏省扬州市水仙病毒检测鉴定与序列分析[J].植物保护.2019
[6].张凯强,常志成,温海深,李吉方,齐鑫.花鲈低氧诱导因子基因(hifs)的序列分析及低氧诱导表达[J].中国海洋大学学报(自然科学版).2020
[7].韩玲,王鸿,颜隆,高治理,贺娟.河北省手足口病发病趋势的时间序列分析[J].中华中医药杂志.2019
[8].蒋波,冯震,秦峰,刘浩,杨美成.药品质量控制中常见产毒真菌ITS和LSUrRNA基因的序列分析[J].药物分析杂志.2019
[9].张田,潘尔顺.基于时间序列分析的电容器退化模型[J].上海交通大学学报.2019
[10].任翔,杨菁,邹颜秋硕,杨祖顺.云南省6种鹅膏菌DNA条形码序列分析[J].食品安全质量检测学报.2019
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