外源酚酸诱导枳菌根共生相关基因筛选

论文摘要

【目的】基于丛枝菌根（AM）真菌改变柑橘酚类现象,筛选外源酚酸诱导菌根共生差异基因,分析酚相关基因功能。【方法】以枳（Poncirus trifoliate L.）接种AM真菌,并施加外源酚酸,采用随机引物扩增,获得差异表达片段;继而克隆酚相关基因并进行生物信息学分析。【结果】试验采用20条随机引物和3条锚定引物扩增cDNA,共获得了154条差异显示的表达片段;对其中16条Northern杂交显示阳性的片段测序与比对,发现9条有相关功能注释,参与环境因子及内源信号的识别,调节共生体的形成;DD-11基因只有在外源酚酸添加和接种AM真菌的根系中表达,该片段cDNA全长序列长度为1382 bp,编码454个氨基酸,分子式为C2210H3427N603O657S31,其理论等电点和相对分子量分别为7.81和49950.03;磷酸化分析发现,该蛋白有22个丝氨酸残基、14个苏氨酸残基及7个酪氨酸残基可能成为蛋白激酶磷酸化位点。通过PredictProtein服务器对DD-11蛋白质的二级结构进行分析,该蛋白含有α螺旋22%、无规则卷曲58%、延伸链20%,不含有β折叠结构。【结论】本试验获得菌根共生过程酚相关基因,其功能与植物内源信号识别密切相关,为探讨酚类在菌根共生过程中的分子机制提供了新的视角。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 试验材料
•   1.2 主要试剂
•   1.3 主要培养基
•   1.4 试验设计
•   1.5 根系总RNA提取
•   1.6 差异片段克隆与分析
•   1.7 DD-11基因的生物信息学分析
• 2 结果和分析
•   2.1 枳根系总RNA提取及cDNA合成
•   2.2 DDRT-PCR技术筛选菌根过程酚相关差异表达片段
•     2.2.1 DDRT-RCR扩增:
•     2.2.2 RCR产物凝胶电泳检测:
•     2.2.3 差异条带回收与二次扩增:
•     2.2.4 克隆及测序:
•   2.3 DD-11基因的生物信息学分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王明元,李建福,刘建福,徐志周,林萍,李雨晴

关键词: 丛枝菌根真菌,酚酸,差异片段筛选,蛋白结构

来源: 微生物学报 2019年07期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 华侨大学园艺系,上海交通大学农业与生物学院

基金: 国家自然科学基金(31101512),福建省科技厅高校产学研重大项目(2017N5009)~~

分类号: Q933

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180512

页码: 1383-1394

总页数: 12

文件大小: 692K

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