导读:本文包含了整合突变论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:突变,基因突变,座子,半胱氨酸,生物,耐药性,霉素。
整合突变论文文献综述
颜敏,刘静,夏天,许国旺,朴海龙[1]（2019）在《细胞蛋白质组学和代谢组学整合策略表征散斑型BTB/POZ蛋白质突变调控的关键代谢通路》一文中研究指出散斑型BTB/POZ蛋白(SPOP)是前列腺癌中突变率最高的蛋白质之一。该研究通过整合细胞蛋白质组学和代谢组学的方法,揭示SPOP突变引起的代谢紊乱及其调控的代谢通路。首先,系统地研究了LNCaP SPOP野生型及突变型高表达细胞中的代谢变化。代谢组学结果显示,SPOP野生型和突变型(SPOP_Y87N和SPOP_F133L)导入的LNCaP细胞在偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)得分图上得到了很好的区分。进一步通过单因素方差分析发现,SPOP突变引起富马酸、苹果酸、柠檬酸、天冬氨酸和天冬酰胺等代谢物含量的增加。蛋白质组学共发现909种蛋白质在两种LNCaP SPOP突变体细胞中发生变化。分别对差异代谢物和差异蛋白质进行通路富集分析,发现叁羧酸循环、氨酰基-转运核糖核酸生物合成在代谢组学和蛋白质组学分析中都发生了明显改变。最后,在SPOP敲除的Du145细胞中验证了上述研究结果。该研究证明SPOP突变可促进叁羧酸循环。(本文来源于《色谱》期刊2019年08期）
贾芳,杨江流,宋青山,梁艳霞,王海龙[2]（2019）在《pEASY-E1-Int1表达载体的点突变改造与整合酶的表达分析》一文中研究指出整合子—基因盒系统(Integron-gene cassette system)能使耐药基因在细菌种内和种间快速传播。在整合子—基因盒系统中起关键作用的是整合酶,本研究的目的在于克隆与NCBI公布的整合酶DNA序列完全一致的序列,并进一步表达纯化整合酶。采用PCR技术点突变改造pEASY-E1-Int1表达载体上的目的基因整合酶基因,共含5个突变位点,测序比对后,再连接与pEASY-E1 expression表达载体上,转化到BL21(DE3)感受态细胞中,不同浓度IPTG诱导优化表达,经聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-PAGE)和Western blotting检测分析,结果得到表达产物分子量为33 kD与Ⅰ类整合子整合酶分子量一致的整合酶。本研究为下一步比较野生型和耐药性大肠杆菌整合酶活性提供基础指导。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年06期）
邓雪媚,刘家法,张米,李健健,杨壁珲[3]（2019）在《云南省HIV/AIDS病人原发性整合酶基因耐药突变情况》一文中研究指出目的分析云南省原发性整合酶基因突变及相关耐药情况,为治疗提供参考依据。方法采集2015—2016年云南省14个地州(市)未接受过含整合酶抑制剂(INIs)抗病毒治疗的531例HIV-1感染者外周静脉血,分离血浆,-80℃冻存备用。所有感染者均进行个案流行病学调查并签署知情同意书。采用反转录/巢式聚合酶链式反应扩增病毒pol基因区并进行序列测定,分析IN区耐药突变位点及其耐药程度。结果 531例未经INIs抗病毒治疗的病人血浆扩增成功513例,5.7%(29/513)存在原发IN基因突变,其中9例病人表现出对INIs原发性耐药。全部INIs耐药毒株均属于交叉耐药,包括5例部分交叉耐药和4例完全交叉耐药。共检出10个IN区主要突变位点,其中T66A、E92A/G、G118R、 E138A/K、 G140A、Y143S、 P145S和Q148H等8种主要突变类型引起INIs不同程度耐药;共检出8个IN次要突变位点,A128T出现频率最高,引起INIs耐药的次要突变位点是S153F和G163R。结论云南省存在原发性INIs基因突变且变异位点具有多样性和特异性,应加强IN区耐药监测,合理调整INIs的用药方案。(本文来源于《中国艾滋病性病》期刊2019年04期）
梁锦升[4]（2018）在《基于TCGA数据库基因突变和表达整合分析的泛癌症分子机制研究》一文中研究指出癌症的发生率以及死亡率日益上升,其防治的关键在于早诊断、早治疗。但由于癌症的复杂性,其机制的揭示成为世界难题。目前基于大数据的癌症研究是癌症机制揭示重要手段之一。本研究从TGGA中获取11种人类常见癌症的大数据(包括乳腺浸润性癌、结肠癌、结直肠腺癌、头颈癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、肝癌、肺腺癌、肺鳞癌、胃腺癌和胸腺癌),并分别对这11种癌症病人的基因组突变数据、转录组数据,及两者整合的数据进行分析和研究。研究结果如下:本研究首先通过对癌症基因组分析,发现癌症晚期细胞群异质性高的原因与癌症早期的原因可能并不相同。通过分析正常组与癌症组之间基因共表达关系的变化,发现在癌症组织中转录因子和靶基因之间普遍存在的相关关系下降的现象,并筛选出可能对癌症有重要影响作用的普遍性的和特异性的转录因子-靶基因基因对。其中一些基因对,如XRCC5-XRCC6,已经被报道与多种癌症的进展相关,而另一些基因对,如IRF1-PSMB9,分析其可能参与肺癌、肾癌相关癌症发展通路;如CENPA-NEK2,可能与肾癌、胃腺癌和胸腺癌的发展相关,但仍没文献报道这些基因对与癌症的联系。因而这些基因对极有潜力成为新的癌症标志物或者癌症治疗靶标。整合基因组突变、差异表达以及共表达分析叁方面结果,筛选出未被报道的,极有可能对癌症发生发展有着重要意义的癌症驱动基因,如ASB10很可能是乳腺浸润性癌的驱动基因,而CD180则可能是结直肠癌的驱动基因。并且最后得出导致基因对共表达关系在癌组织中变化的可能机制:普遍存在的在癌组织中基因共表达关系下降的原因可能是由于部分基因突变后,破坏了原本的基因网络。本研究在探究泛癌症发生、发展规律的同时,提供新的、极具潜力的泛癌症诊断候选标志物及治疗候选靶标,为未来癌症的防治提供了重要的理论依据。(本文来源于《华南理工大学》期刊2018-11-12）
尤媛媛,陈善泽,李东珏,郭婧,黄宁[5]（2018）在《整合素α4半胱氨酸突变质粒的构建及谷胱甘肽化水平检测》一文中研究指出目的:旨在构建整合素α4半胱氨酸突变质粒,并初步鉴定α4的谷胱甘肽化修饰位点。方法:利用点突变技术将整合素α4的半胱氨酸残基分别突变为天冬氨酸残基,以免疫共沉淀的方法利用anti-Flag琼脂糖珠富积突变的α4蛋白,采用体外谷胱甘肽化的方法检测突变α4的谷胱甘肽化水平。结果:构建了α4的81、85、278、717、767、828位的半胱氨酸单突变质粒,体外谷胱甘肽化检测表明这些单突变的α4仍具有谷胱甘肽化修饰。结论:成功构建了整合素α4所有的未形成二硫键的半胱氨酸突变的真核表达质粒,初步判定α4可能具有多个位点半胱氨酸残基同时被谷胱甘肽化修饰。(本文来源于《四川生理科学杂志》期刊2018年04期）
邹洋[6]（2018）在《基于整合数据的肝癌基因突变分析》一文中研究指出肝癌是世界范围内第五常见的癌症,也是死亡率位列第叁的癌症。肝癌的发生与许多风险因子有关。诸多病例对照研究鉴定了许多肝癌易感突变位点,但是针对具体多态性位点(SNP)的研究结果之间存在明显差异。因此,基于肝癌病例对照研究数据的系统整合分析对于更加深入地了解肝癌的多态性遗传风险非常必要。除此之外,基于人类大规模基因组队列数据和基因组的连锁不平衡规律,我们可以对于肝癌关联SNP进行连锁分析,发现新的潜在肝癌关联遗传位点。在本论文中,我们重点评价了已知的肝癌易感基因和突变,在调控方式和功能上进行了探讨,并运用测序技术对未知的基因和突变进行进一步探索和研究。本研究第一部分是对目前现有的肝癌相关的遗传突变分析进行荟萃分析和系统评价研究。通过关键词检索并筛选出2,667篇相关文献,共纳入69个与肝癌相关的易感位点,并采用3种遗传模型进行荟萃分析。结果显示,31个突变的25个基因与肝癌易感性显着相关。利用威尼斯评级,我们鉴定到一个评级为A的位点(NQO1 rs1800566)。在此基础上,我们还构建了HCCdb肝癌易感基因数据库,旨在为研究者开展后续分析提供便利。本研究第二部分对肝癌易感位点进行了功能注释,对调控肝癌细胞表达的机理进行了探究。全基因组关联分析在多种癌症的遗传风险位点鉴定中是重要的分析工具。但大多数鉴定到的风险位点位于基因组的非编码区和调控区,这些突变对癌症易感性的作用机制和功能研究尚不明确。在本次工作中,我们对13个肝癌GWAS tag-SNP进行了基于基因组结构区、表观修饰区和转录因子结合区以及肝癌表达数据的功能注释。结果显示,KIF1B和PGD的外显子、启动子和相邻增强子上都受到肝癌相关SNP的影响。除此之外,对转录因子结合区的注释发现,肝癌易感突变rs11121557影响了NFE2L2对PGD上游增强子的结合,从而影响了PGD的表达。本研究第叁部分对肝母细胞瘤的突变图谱进行了描绘。肝母细胞瘤(Hepatoblastoma)是儿童最常见的肝脏肿瘤。为了鉴定肝母细胞瘤的突变情况,我们对20对肝母细胞瘤癌组织和癌旁组织样本进行全外显子组测序。研究发现,肝母细胞瘤与其他儿童肿瘤类似,其突变率很低。同时,研究进一步确认了CTNNB1是肝母细胞瘤里的最常见突变基因,Wnt信号通路是最重要信号通路。我们还鉴定了KMT2D、FAM47C和MUC16等新的突变基因,以及钙离子信号通路、MAPK信号通路和mTOR信号通路等细胞信号通路。CTNNB1和MUC16的染色体重排变异和FANCL等7个的生殖细胞突变基因也是首次被发现。总之,本研究初步地探讨了肝癌的遗传学机理,探寻到诸多与肝癌的发生发展相关的关键基因,其中部分基因是首次被发现。我们的结果对于深入理解和揭示肝癌的发生发展机制,推动肝癌个体化防治以及预后判断有重要理论意义和潜在的应用价值。(本文来源于《华东师范大学》期刊2018-05-01）
廖国建,田俊,彭希希,胡昌华[7]（2017）在《整合报告基因和转座突变筛选达托霉素生物合成调控基因》一文中研究指出达托霉素已成为治疗革兰氏阳性菌感染的重要药物。达托霉素的生物合成途径无典型的途径特异性调控基因,暗示其合成调控可能具有独特的机理。筛选和鉴定达托霉素生物合成的调控基因,对于丰富链霉菌次级代谢调控有重要意义,也将为提高提高达托霉素产量提供重要的候选靶点。本研究以葡萄糖甘酸酶基因gusA和卡那霉素抗性基因neo作为报告基因,将其与目标基因的启动子结合,同时联合转座突变来筛选基因簇转录水平和达托霉素产量发(本文来源于《第十叁届全国抗生素学术会议论文集》期刊2017-11-22）
杨立莉[8]（2017）在《运用一个饱和的HIV-1整合酶随机突变库筛选对整合酶抑制剂耐药的突变》一文中研究指出本文的主要研究内容是利用转座子介导的碱基交换突变方法(TDEM)构建一个饱和的HIV-1整合酶随机突变库,然后利用这个突变库筛选耐受已上市的属于整合酶链转移抑制剂(INSTI)的雷特格韦和在初级研发阶段的属于变构整合酶抑制剂(ALLINI)的BI-D,KF116的突变株。实验方法:1.为了构建一个突变覆盖整合酶上所有氨基酸位点的随机突变库,我们使用了 TDEM方法,造成目的基因连续叁个碱基的替换,在目的蛋白中造成单个氨基酸或连续两个氨基酸的突变。这种方法兼具随机突变可以在一轮突变产生成千上万个随机突变的优点和定点突变可以控制突变类型的特点。2.为了筛选出可以耐受整合酶抑制剂的HIV-1突变株,我们将构建的整合酶突变库克隆到含有HIV-1基因组的质粒pNL4.3上,通过转染293T细胞得到含有整合酶突变库的HIV-1,并在药物存在下,感染CEM细胞,筛选出耐药突变株。我们分别使用了 Sanger测序和二代测序两种方法确定筛选的突变株的序列,并通过与野生型HIV-1整合酶的序列进行比对,识别出耐药性突变。分析二代测序结果时,某个突变在筛选后突变库中的频率与其在输入突变库中频率的比值,简称为FC。实验结果:1.通过TDEM,我们构建了 一个突变位点能覆盖整合酶(288个氨基酸)全部氨基酸残基的随机突变库,库的多样性覆盖了理想突变库多样性5472(288x19)的 65.8%。2.含有整合酶突变库的HIV-1与CEM细胞分别在雷特格韦(20 nM和40 nM)、BI-D(200nM和400nM)和KF116(50nM)存在下共培养,得到了耐受该药物的病毒突变库。雷特格韦筛选之后的病毒库的二代测序结果显示,已报道的大多数主要初级耐药突变在二代测序中得到FC都大于1,还识别到E35K,C56G,Q221K等未报道的耐药突变。400nMBI-D的筛选条件下,二代测序得到了的C56G,G82E,G272E等未报道的突变。Sanger测序得到的50nMKF116筛选到的突变集中于T124,T125两个氨基酸,与其他文献报道的耐药突变位点一致。结论:TDEM方法可以构建一个在饱和的整合酶随机突变库,并且利用含有这个突变库的HIV-1病毒库,可以筛选出对于耐药性有重要贡献的氨基酸残基。结合Sanger测序和二代测序的测序结果,我们发现雷特格韦的已报道的大部分主要初级耐药突变在筛选后的突变库中可以鉴别到,证明了利用本突变库筛选耐药突变的可行性。另外我们还识别到一些并未报道的比较有趣的位点,我们选取了其中五个从未报道过的突变进行耐药性的验证。由于毕业年限限制,这五个突变已经通过定点突变PCR获得,但是还未完成细胞实验部分。(本文来源于《浙江大学》期刊2017-06-01）
魏取好,胡庆丰,林晓伟,李万翔,吕火烊[9]（2015）在《通过转座子插入突变寻找宿主菌中影响整合酶表达水平的因素》一文中研究指出目的整合子在细菌耐药性产生和播散中发挥重要作用,但其具体的调控机制还不明了,本研究通过转座子插入突变寻找宿主细菌中影响整合酶表达水平的因素。方法在大肠埃希菌JM109中建立转座子随机插入突变文库,用链霉素耐药基因aadA2替代整合酶基因intI1,用琼脂稀释法筛选耐药性发生变化的突变株,将MIC值发生明显变化的细菌,抽提RNA,经逆转录后运用实时定量PCR检测报告基因aadA2的相对表达水平,通过反向PCR并经测序分析,以确定转座子插入突变的基因。结果获得库容量大于7000的转座子随机插入突变文库,可基本覆盖大肠埃希菌的所有读码框。通过药物敏感试验在JM109转座子随机插入突变文库中寻找宿主细菌中影响整合酶表达水平的因素,共筛查了4000株细菌,共找到3个插入突变基因可使报告基因aadA2转录水平,即整合酶基因转录水平增高:过氧化氢酶/过氧化物酶HPI(I)基因、磷酸烯醇丙酮酸羧激酶(PPC)基因、ATP依赖的蛋白酶ATP结合亚单位(clpx)基因。结论本研究中发现的3个插入灭活基因与整合酶的表达水平相关,该3个基因均与细菌的代谢有关,但其具体机制还有待进一步研究,本研究结果为进一步研究整合子捕获与表达耐药性基因盒调控机制提供新的线索。(本文来源于《第六届中国临床微生物学大会暨微生物学与免疫学论坛论文汇编》期刊2015-09-03）
常艳,周长慧,张铭,黄鹏程,涂宏刚[10]（2015）在《基于流式细胞术的Pig-a基因突变试验:让替代和整合成为可能》一文中研究指出基于流式细胞仪技术的大鼠体内Pig-a基因突变试验首次发表于2008年,此后便立即得到了业内同行的广泛关注,并引起国际遗传毒性工作组(IWGT)及美国健康与环境科学研究所(HESI)的重视。2008年HESI的遗传毒理学技术工作小组便成立了Pig-a工作小组,致力于方法学的进一步优化和实验室间联合验证,并探讨成为管理毒理学评价方法的可能性。国家上海新药安全评价研究中心作为全球15家参与联合验证的实验室之一,(本文来源于《2015毒性测试替代方法与转化毒理学（国际）学术研讨会会议论文集》期刊2015-07-26）
整合突变论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
整合子—基因盒系统(Integron-gene cassette system)能使耐药基因在细菌种内和种间快速传播。在整合子—基因盒系统中起关键作用的是整合酶,本研究的目的在于克隆与NCBI公布的整合酶DNA序列完全一致的序列,并进一步表达纯化整合酶。采用PCR技术点突变改造pEASY-E1-Int1表达载体上的目的基因整合酶基因,共含5个突变位点,测序比对后,再连接与pEASY-E1 expression表达载体上,转化到BL21(DE3)感受态细胞中,不同浓度IPTG诱导优化表达,经聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-PAGE)和Western blotting检测分析,结果得到表达产物分子量为33 kD与Ⅰ类整合子整合酶分子量一致的整合酶。本研究为下一步比较野生型和耐药性大肠杆菌整合酶活性提供基础指导。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
整合突变论文参考文献
[1].颜敏,刘静,夏天,许国旺,朴海龙.细胞蛋白质组学和代谢组学整合策略表征散斑型BTB/POZ蛋白质突变调控的关键代谢通路[J].色谱.2019
[2].贾芳,杨江流,宋青山,梁艳霞,王海龙.pEASY-E1-Int1表达载体的点突变改造与整合酶的表达分析[J].基因组学与应用生物学.2019
[3].邓雪媚,刘家法,张米,李健健,杨壁珲.云南省HIV/AIDS病人原发性整合酶基因耐药突变情况[J].中国艾滋病性病.2019
[4].梁锦升.基于TCGA数据库基因突变和表达整合分析的泛癌症分子机制研究[D].华南理工大学.2018
[5].尤媛媛,陈善泽,李东珏,郭婧,黄宁.整合素α4半胱氨酸突变质粒的构建及谷胱甘肽化水平检测[J].四川生理科学杂志.2018
[6].邹洋.基于整合数据的肝癌基因突变分析[D].华东师范大学.2018
[7].廖国建,田俊,彭希希,胡昌华.整合报告基因和转座突变筛选达托霉素生物合成调控基因[C].第十叁届全国抗生素学术会议论文集.2017
[8].杨立莉.运用一个饱和的HIV-1整合酶随机突变库筛选对整合酶抑制剂耐药的突变[D].浙江大学.2017
[9].魏取好,胡庆丰,林晓伟,李万翔,吕火烊.通过转座子插入突变寻找宿主菌中影响整合酶表达水平的因素[C].第六届中国临床微生物学大会暨微生物学与免疫学论坛论文汇编.2015
[10].常艳,周长慧,张铭,黄鹏程,涂宏刚.基于流式细胞术的Pig-a基因突变试验:让替代和整合成为可能[C].2015毒性测试替代方法与转化毒理学（国际）学术研讨会会议论文集.2015
论文知识图
