二芳基乙烯衍生物与DNA结合的分子动力学研究

论文摘要

基于分子动力学方法,对2种旋转异构的二芳基乙烯(DTE,dithienylethene)衍生物(DTE1和DTE2)与不同分子结构DNA结合过程的热力学与动力学特征进行模拟,结果发现,DTE1,DTE2与DNA分子采用小凹槽结合(MiGB)的模式结合时所需能量最低,存在的分子间库仑能与范德华相互作用能最小,说明该结合模式最稳定;由于空间位阻作用,互为旋转异构体的2个DTE衍生物与DNA作用表现出截然不同的结合行为,DNA对DTE衍生物具有明显的对映异构体选择性; DTE衍生物与DNA分子作用位点的选择性直接与构成位点的碱基对相关.

论文目录

• 1 计算方法
• 2 结果与讨论
•   2.1 单一碱基对的DNA序列与DTE分子的结合
•     2.1.1 A-T碱基对
•     2.1.2 C-G碱基对
•   2.2 复杂碱基对的DNA序列与DTE分子的结合
•     2.2.1 复杂碱基对的DNA序列与DTE分子的单独结合
•     2.2.2 复杂碱基对的DNA序列与DTE分子的混合结合
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 孙浩帆,张凌怡,PATRICK Norman,张维冰

关键词: 分子动力学模拟,手性药物,二芳基乙烯衍生物,旋转异构体,结合模式

来源: 高等学校化学学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 有机化工

单位: 华东理工大学上海市功能材料化学重点实验室,瑞典皇家理工学院

基金: 国家自然科学基金(批准号:21475044),国家科技支撑项目(批准号:2015BAK44B00),中央高校基本科研专项资金(批准号:222201817022),国家留学基金(批准号:201706745036)资助~~

分类号: TQ460.1

页码: 1229-1235

总页数: 7

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