4种鲤科鱼类线粒体atp6基因差异分析

论文摘要

目的:通过对武昌鱼、鲫鱼、草鱼和鲢鱼4种鱼类线粒体atp6基因序列的差异性开展研究和分析,为鲤科鱼类的系统发育关系、遗传特异性、遗传资源的保护研究提供参考。方法:通过常规的酚-氯仿抽提法提取4种鲤科鱼基因组DNA,以基因库中的草鱼（HQ891005）线粒体基因组序列为模板设计引物,对4种鱼的线粒体atp6基因序列进行PCR扩增和测序,将测序结果与GenBank上公布的17种鱼类（其中鲤科鱼类8种、鲭科鱼类3种、鲑科鱼类2种、鳅科、慈鲷科、近魟科、狗母鱼科鱼类各1种）线粒体基因组序列进行比对,构建系统进化树。结果:4种实验鲤科鱼类与GenBank上下载的8种鲤科鱼进行比对,通过分析这12种鲤科鱼类的线粒体atp6基因（436bp）的核苷酸序列中T、C、A和G平均含量分别为29%、28%、30%和13%,在建立的系统进化树中,12种鲤形目鱼被分成两部分,一部分中是11种鲤形目鱼,它们的亲缘关系为45;剩余一目的胭脂鱼和灯笼鱼目的杂斑狗母鱼被分为第二部分,亲缘关系为52。4种鲤科鱼类的亲缘关系,与同属间较近,与不同属的较远。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 实验材料
•     1.1.1 选择的其他实验鱼类
•   1.2 主要仪器与试剂
•   1.3 DNA的提取与检测
•   1.4 引物设计
•   1.5 atp6部分序列PCR扩增及测定
•   1.6 数据处理
• 2 结果与分析
•   2.1 DNA提取结果分析
•   2.2 引物退火温度筛选及PCR扩增结果分析
•     2.2.1 退火温度筛选
•     2.2.2 PCR扩增结果
•   2.3测序结果分析
•   2.4 12种鲤科鱼类atp6基因差异性对比结果分析
•   2.5系统发育进化树分析
• 3 讨论
•   3.1 遗传多样性分析
•   3.2 系统发育特点

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 郭元顺,王树峰,李生瑄,王静汝,董鑫,李洁

关键词: 鲤科鱼,线粒体基因,差异分析

来源: 甘肃畜牧兽医 2019年10期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,水产和渔业

单位: 甘肃农业大学动物科学技术学院

基金: 甘肃农业大学2018年学生科研训练计划（SRTP）项目编号（20180436）

分类号: S917.4

DOI: 10.15979/j.cnki.cn62-1064/s.2019.10.016

页码: 51-55

总页数: 5

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