单分子实时测序技术在环境微生物研究中的应用

论文摘要

1975年,第一个cDNA的基因组——噬菌体фX174基因组的测序完成,标志着测序时代的开始。1996年以来人类基因组计划的发起极大地推动了测序技术的应用和发展,第二代测序技术也被称为高通量测序技术。而单分子DNA测序技术是最近10年内发展起来的新一代的测序技术,称为第三代测序技术,其中包括单分子实时测序(Single molecule real time sequencing,SMRT)、真正单分子测序和单分子纳米孔测序等技术。SMRT测序技术有超长读长、测序周期短、不需要模板扩增和直接检测表观修饰位点等特点,为研究人员提供了新的选择。本文综述了SMRT测序技术的基本原理、性能以及它在微生物16S rRNA基因、微生物全基因组以及微生物宏基因组测序等方面的应用,并分析了SMRT测序技术在环境微生物应用中的优势以及存在的问题。

论文目录

• 1 SMRT测序技术原理
• 2 SMRT的测序特点
•   2.1 超长的读长
•   2.2 测序的速度较快
•   2.3 无需模板扩增
•   2.4 测序存在随机性的错误
• 3 SMRT测序在环境微生物研究中的应用
•   3.1 微生物16S rRNA基因测序
•   3.2 微生物全基因组测序
•   3.3 微生物环境总基因组测序
• 4 小结

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 韩迎亚,杨乔乔,王倩楠,安贤惠,刘有华,李联泰

关键词: 测序法,测序技术,基因组学,环境微生物

来源: 微生物学通报 2019年11期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 江苏海洋大学

基金: 江苏高校优势学科建设资助(PAPD),江苏省研究生科研创新计划(KYCX18_2569),江苏省研究生科研与实践创新计划(SJCX19_0989,SJCX19_0990)~~

分类号: Q939.9

DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180779

页码: 3140-3147

总页数: 8

文件大小: 419K

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