遗传统计论文_常志光,王冰,薛运波,宋延明,徐凯

导读:本文包含了遗传统计论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:基因,锡伯族,长寿,南通,系统,尼古丁,相互作用。

遗传统计论文文献综述

常志光,王冰,薛运波,宋延明,徐凯[1](2019)在《我国蜜蜂遗传育种专利统计分析》一文中研究指出为提升蜜蜂遗传育种知识产权综合服务能力,实现创新驱动发展,推动蜂业提质增效升级,开展了此项专利调研工作;检索了2009-2018年公开或公告所涉及蜜蜂遗传育种技术的专利申请及授权专利,并对上述专利检索数据进行了统计分析,从专利申请角度揭示蜜蜂遗传育种技术的研究进展情况;结果显示,在蜜蜂育种专利内容方面,培育蜂王、雄蜂的蜂箱及其附件是主要的研究内容,内容较丰富,并显示出了较强的优势;在蜜蜂育种相关技术方面,基因育种技术和人工授精技术是研究的主要方向。(本文来源于《蜜蜂杂志》期刊2019年11期)

徐国昌,张红霞,王卿,刘荣志,张娜[2](2019)在《新疆锡伯族成人十项身体遗传性状统计分析》一文中研究指出在知情同意基础上,采用随机整群抽样方法,对新疆锡伯族677例(男327例,女350例)健康成人的身体遗传性状(卷舌、尖舌、翻舌、迭舌、利手、扣手、交叉臂、拇指、门齿类型、肤色)进行现场调查、统计。结果显示,10项遗传性状存在一定的性别差异以及左右对称性差异。尖舌(81.98%)、卷舌(70.31%)超过半数,翻舌(36.93%)、迭舌(6.06%),尖舌出现率较高,迭舌出现率较低;4种舌运(本文来源于《中国解剖学会2019年年会论文文摘汇编》期刊2019-08-18)

黄翌,宋彦欣,王欣怡,邱尉云[3](2019)在《长江口乡镇人口长寿的遗传、行为和环境因素统计研究》一文中研究指出为探讨中国典型长寿区南通市乡镇人口长寿水平与遗传、行为、环境等多因素的关系,赴南通市11个乡镇调研了162名长寿人口的信息,内容包括性别、习惯、日常饮食、兄弟姐妹寿命、性格、职业等;在长寿人口居住地附近采集了当地种植的稻米,测试了其中9种微量元素含量;从南通市公安局获取了2011—2016年各乡镇老龄人口数和90岁、百岁人口数,据此计算乡镇人口长寿水平;利用皮尔森相关性检验计算各类因素与乡镇尺度人口长寿水平间的相关性。结果表明:1)研究区东部乡镇人口的长寿水平显着高于西部乡镇,具有明显的地理分异特征;2)长寿人口普遍得到良好的照料,生活习惯和心态较好;3)长寿人口的血缘兄弟姐妹寿命显着高于当地预期寿命;4)稻米中Sr含量、饮酒比例、服药比例、血缘兄弟姐妹寿命与各乡镇人口长寿水平存在统计学的相关性。(本文来源于《南通大学学报(自然科学版)》期刊2019年02期)

张雪芬[4](2019)在《遗传异质性加权U统计模型的评估与应用研究》一文中研究指出目的:大规模全基因组测序研究逐渐成为生物遗传与医学研究关注的重要内容,上千种基因与人类复杂疾病的关系已从病理生理及病因学角度得到了比较合理的生物学解释。但是由于更多的人类复杂疾病,可鉴定与解释的遗传变异仅仅是生物遗传因素的一部分。既往研究表明,具有相同或相似临床表现的某些复杂疾病可能具有不同的潜在遗传病因,寻找其罕见变异,探索基因-基因互作及基因-环境互作,结构变异及其它引致遗传力缺失的遗传变异研究尚存在许多未解的难题。有关遗传异质性的研究中,现有的统计方法通常都假定研究疾病均具有相同的遗传效应。若某疾病存在遗传病因的异质性时,现有方法对疾病与遗传因素的关联性分析,有可能会降低其检验效能,甚至得出假阳性分析结果。本研究拟针对现有分析方法低估遗传变异效应问题,提出一种基于U统计量分析的非参数统计方法——异质性加权U检验,集中解决由遗传变异引致的异质性效应;并通过探讨异质性加权U统计量的渐近分布,进而证实该方法高效的计算性能;通过调整加权方案,为解决更多的遗传效应模型应用问题提供新思路。方法:本课题针对既往遗传变异异质效应分析中,分析方法均需假定研究疾病具有相同的遗传病因,缺乏可以用来推断群体异质性亚群(潜在相似度)先验知识的问题,采用重复模拟研究,证实并提出解决有关遗传异质性问题对应的高维数据统计分析方法。模拟人口亚群,按遗传效应、效应大小和方向等设置不同的遗传异质性模型,进而证实异质性加权U、非异质性加权U和GLM等方法的计算效率及灵活性等,以发展改进并提出一些解决低估遗传变异影响力的分析思路与方法,开展对不同亚群(如性别和种族)遗传变异产生的影响研究。发展一种不依赖基因表型特定分布,可广泛应用于定性和定量基因表现型样本分析的方法。结合尼古丁依赖SAGE实例验证并分析具有潜在人群结构与遗传变异,以某种联合方式产生的效应,为遗传变异变量间相互作用问题研究提供新方法。在两个遗传异质性和第叁个专门针对非正态分布与错误指定权重函数的模拟试验的集合中,设R=I,基于欧几里德距离的ki,j和交叉积的f(gI,gj)来形成加权函数。每次模拟均重复1000次。根据1000次重复中,P值小于或等于0.05的比率,对比研究异质性加权U、非异质性加权U和常规广义线性模型(GLM)等模型方法的检验效能和Ⅰ型错误。基于尼古丁依赖的SAGE实例,选取Illumina Human 1M DNA Analysis BeadChip芯片基因分型的26个尼古丁依赖相关基因和表型变量等,取基因型所需的最小后验概率为0.9,用Beagle软件进行基因型填补。在对基因型数据进行质量评估基础上,检查每个标记、基因型调用比例等,删除调用比例不足90%的标记,剔除基因型缺失10%以上的个体;并使用标记的最小等位基因均值来填补;对照Hardy-Weinberg平衡标记出过度偏差的标记物等。利用交叉乘积核来计算遗传相似度f(Gi,Gj),运用异质性加权U,结合可能存在的性别异质性效应,逐个分析26个候选基因与尼古丁依赖的关系。对潜在的混杂效应性别、种族、样本来源以及根据全基因组数据计算的前四个主成分作为协变量进行分析。结果:1.异质性加权U检验在遗传异质性模型分析中优势更为突出模拟试验一:假设有两个人口亚群,按照效应大小和方向模拟设置了四种遗传异质性模型,对比分析了异质性加权U、非异质性加权U和GLM叁种方法的Ⅰ型错误和检验效能。进一步证实了异质性加权U检验在遗传异质性模型分析中,与非异质性加权U和GLM法相比,控制的Ⅰ型错误更小,方法检验效能更高。呈非正态潜在基因表型分布分析时,异质性加权U检验相较基于参数的GLM法更稳健。为进一步证实遗传模式不明确时的新方法性能,本研究在两个亚群中模拟设置了不同的七种遗传模式,进而证实并提出:当亚群中存在明显的遗传异质性时,异质性加权U优于非异质性加权U及GLM法。2.遗传异质性越大的分类和连续型基因表型分析异质性加权U的计算性能更佳模拟试验二:设定亚群数量增加到20个,潜在结构协变量25个,以更接近真研实景中复杂的潜在人口结构。分别运用异质性加权U、非异质性加权U和GLM叁种方法,对二分类和连续型表型数据进行模拟证实。结果表明,复杂潜在结构的二分类和连续型表型数据,采用异质性加权U分析,都明显优于非异质性加权U和GLM法。当遗传异质性可忽略不计时,叁种方法性能基本相近。但对生物遗传信息利用模型研究中,若纳入噪声参数时,异质性加权U与非异质性加权U和GLM叁种方法的检验效能均有所降低。异质性加权U与非异质性加权U和GLM叁种方法的几种模型的Ⅰ型错误均小于0.05。无论是二分类表型,还是连续型表型,异质性加权U都具有更高的检验效能;遗传异质性越大,异质性加权U的性能更佳。3.多基因模型异质性加权U较VCscore检验不仅能更好的控制Ⅰ型错误,且具有更高的检验效能模拟试验叁:设基因信息大数据分析的随机效应模型模拟表型为:yi=μ+Ziα+giβi+εi,εi~F,式中,Zi:受试对象i的协变量;a:协变量效应估计系数,误差F服从非正态分布。通过模拟自由度为2的t分布、柯西分布和正态与卡方的混合分布等;并对含有混杂效应(模拟生成与gi相关联的Zi,由于a≠0,Zi也和yi相关联)和未含混杂效应的两种情况,模拟对比异质性加权U和VCscore法的研究过程中都纳入协变量Z的100万个模拟数据研究。进而证实异质性加权U和方差分量评分检验(VCscore),考虑混杂效应基础上,应用自由度为2的t分布、柯西分布和正态和卡方混合分布的稳健性均好。无论是否含有混杂效应,叁种非正态分布中异质性加权U均未发现可加大Ⅰ型错误。但存在混杂效应且误差F服从柯西分布时,VCscore法可能会加大Ⅰ型错误。当权重函数指定有误,异质性加权U法虽然控制的Ⅰ型错误很好,但检验效能却有所降低。当含有协变量缺失或加入噪声协变量时,异质性加权U的检验效能也会降低。当临界值取5×l0-5时,异质性加权U的Ⅰ型错误为4.0×10-5。4.异质性加权U在复杂结构基因大数据分析中的应用基于国际上人群迄今为止最大且最全面遗传与环境成瘾性研究(Study of Addiction:Genetics and Environment,SAGE)中,来自酗酒遗传学合作研究(COGA)、可卡因依赖的家系研究(FSCD)和尼古丁依赖的合作遗传学研究(COGEND)叁个较大的互补数据集实例,其中女性1445名,男性1272名,包括807名非洲裔美国人,1910名欧洲裔美国人。本研究主要针对尼古丁依赖的Fagerstrom测试项目(FTND)中的每日吸烟量(CPD)的终身得分(lifetime score)、尼古丁使用和依赖的遗传学研究中经常用到的表型变量[16]、有关的人口学特征(如年龄、性别)及环境条件和物质滥用过程的评估[25,26]等资料进行实例验证。考虑性别遗传异质性的实例研究表明,对26个尼古丁依赖候选基因,经异质性加权U分析,17个基因与尼古丁依赖有关;非异质性加权U则仅分析出1个基因与尼古丁依赖有关。在CHRNA5-CHRNA3-CHRNB4基因簇和CHRNB3-CHRNA6基因簇的关联性分析中,两种方法都得出了基因簇与尼古丁依赖有关联性存在的结果。针对CHRNA6和CHRNB3基因的分析结果表明,CHRNA6基因在女性与尼古丁依赖高度相关,而在男性中则尚不能认为有关联性存在;而CHRNB3基因分析则得出了恰好相反的结果。CYP基因分析结果表明,尼古丁依赖与CYP2B6基因高度相关。经对26个尼古丁依赖候选基因分析可见,有遗传异质性存在时,异质性加权U法性能更佳。不同群体遗传变异呈异质性分布时,传统统计方法均要假设遗传变异的影响是相同的,而本文实例分析推荐应用的异质性加权U法不仅容许遗传变异的效应不同,而且可通过调整加权函数,很容易地将该方法由基于遗传异质性检验的可加模型单位点异质性加权U,扩展成多位点效应模型或其它的遗传模型,尤其在构建潜在结构时,加权函数尚可提供一定的灵活性。实例验证分析表明,应用本文介绍的异质性加权U方法,不需要对基因表型进行分布的假设检验,为遗传关联分析提供了结果更稳健、性能更优越的新方法。解决现有统计分析方法无法解决的大数据复杂性问题。结论:课题通过对结构复杂的基因大数据模拟对比和实例验证,完善发展了异质性加权U法,解决了未知基因表型分布研究中的一个难题。叁次模拟试验证实,异质性加权U不仅能很好地控制Ⅰ型错误,即使面对更复杂的遗传环境和潜在结构数据,其检验效能均高于文中提及的非异质性加权U、GLM和VCscore检验等,并表现出优越的计算性能。但是,当加权函数指定有误或协变量含有缺失值时,异质性加权U虽优于其它方法,但检验效能也会有所降低。实例验证结果表明,与现有报道的生物学关联解释结果一致。异质性加权U检验,不仅可更好地控制复杂结构多基因潜在异质性模型分析中的Ⅰ型错误,且较传统分析方法具有更高的检验效能,计算效能优于非异质性加权U等。是生物遗传基因异质性大数据分析中性能优,适用范围广,可灵活应用的一种新方法。(本文来源于《山西医科大学》期刊2019-05-31)

郝宏蕾,吴微微,任文彦,苏艳佳,吕德坚[5](2018)在《浙江汉族人群19个X-STR基因座的遗传多态性统计分析》一文中研究指出目的通过19个X-STR的遗传多态性统计分析,对其法医学可应用性进行评估。方法应用自行建立的19个X-STR荧光复合扩增体系,对浙江788份无关个体(男性样本399份,女性样本389份)进行扩增、检测,并对等位基因、PD值、连锁不平衡等与亲缘关系鉴定相关的数据进行计算。结果共得到268个等位基因,有12个基因座呈现高多态性。经分析,在调查的浙江汉族所有基因座间均不存在明显的连锁不平衡现象。19个X-STR荧光复合扩增体系在浙江汉族女性群体中累积个体识别率CPD为1.000 000 000 000 0,男性群体达到0.999 999 999 999 8。结论 19个X-STR的整体效能符合法医学DNA检验要求,可成为复杂亲权案件鉴定和个体识别有效的辅助工具。(本文来源于《刑事技术》期刊2018年06期)

孙甜甜[6](2018)在《遗传相互作用数据中的统计建模分析》一文中研究指出在生物系统中,遗传相互作用指的是两个基因同时突变的表型异于它们分别突变表型迭加效果的现象。近年来,随着高通量技术的发展,遗传相互作用的高通量筛选得以实现,产生了大量遗传相互作用数据。通路基因指的是一组在同一条生物通路上相互协作的基因,它们共同完成某一项生命过程。发掘遗传相互作用数据中的通路基因可以研究基因之间如何进行相互作用共同影响某种表型,是理解生物学通路的结构和功能,生物系统进化规律,和研究复杂疾病的重要途径。然而,由于基因多效性以及高维数据处理困难等问题,如何发现遗传相互作用数据中的通路基因面临着很大挑战。本文中,我们通过改进的偏相关系数算法计算基因间的条件独立性,即删除掉通路中的已知基因的影响后,研究基因间的相关性。而这些通路中的已知基因将在模型中作为种子基因发掘通路中的其它基因。我们将讨论该算法在模拟数据和实际数据中的计算效果,证明该算法在遗传相互作用数据应用中的有效性。并且对挖掘的已知通路基因和新通路基因,探究其基因功能的相互作用关系。得到基因间的相互作用,共同完成生命活动。(本文来源于《青岛大学》期刊2018-05-18)

[7](2017)在《《植物遗传资源学报》影响力统计分析》一文中研究指出(本文来源于《植物遗传资源学报》期刊2017年06期)

杨前勇[8](2017)在《地方品种遗传多样性和群体结构的分析与统计方法》一文中研究指出遗传多样性是生物多样性的核心,开展遗传多样性调查和群体结构的分析是开发利用本土动物群体的基础,本文根据最新的统计方法,列举了遗传多样性调查的遗传参数,详细阐述了群体遗传结构的分析方法的优缺点,群体分化指数的统计和选择信号扫荡,为我国动物地方品种的群体遗传多样性分析和功能基因定位提供了方法支持。(本文来源于《江西畜牧兽医杂志》期刊2017年05期)

艾剑鸣[9](2017)在《从高考试题例谈遗传定律教学中的若干数理统计问题》一文中研究指出本文以近五年的部分高考试题为实例,介绍在高中生物学遗传定律的教学中一些常用的数理统计方法,包括加法原理、乘法原理、二项分布、数列分析及分离比的检验等。(本文来源于《生物学教学》期刊2017年07期)

王新新[10](2017)在《分布式统计系统的任务调度遗传算法》一文中研究指出针对各类基础数据的统计分析系统为管理者制定决策、挖掘用户喜好、数据整合提供巨大帮助。随着基础数据的增多和统计逻辑的复杂化,统计系统逐渐向分布式转变。在分布式统计系统中,如何结合任务特点和系统特点进行任务调度,成为解决分布式统计系统任务调度的关键。目前分布式系统任务调度,主要包括商业系统中的FIFO调度、公平调度和能力调度,还有科学研究中的Min-min调度、PSO调度、蚁群算法、模糊逻辑等。这些方法较为简单,无法适应复杂的调度环境,且不能结合系统及任务特点,导致调度效率不高。本文结合实际项目中遇到的问题,针对分布式专利业务统计分析管理系统的任务特点及资源需求,分别对专利导入校验任务的特点及计算节点性能特点进行描述。构建统计系统任务调度的形式化描述,并将其转化为一个多目标优化问题,设计适用于专利数据导入校验系统的任务调度遗传算法。结合系统特点及用户需求,以快速响应用户请求与保证系统负载均衡作为调度目标,保证结果有效性的同时改进杂交算子找到更优解。具体工作如下:首先,详细分析分布式专利业务统计分析管理系统的业务流程、任务特点和资源需求,对统计系统任务调度目标、任务调度过程、任务特点及计算节点分别进行形式化描述,为算法各个相关参数的设计提供基础。然后,提出适用于专利业务统计分析管理系统任务调度的遗传算法,解决系统响应时间较长且负载不均衡问题。详细介绍了资源—任务种群编码策略,降低染色体关联性的种群初始化策略,结合系统任务完成时间和负载均衡构建的参数可控适应函数,并保留进化过程中的最好个体作为最优解策略。在算法改进部分,提出带阈值的自适应杂交概率函数,前期保证促进种群进化,后期降低进化概率从而保留好的结果。最后搭建实验平台,模拟任务和计算节点,实现适用于统计系统任务调度的遗传算法。实验验证算法的有效性,同时对比实验证明算法能找到更优的解,并进行杂交概率参数、变异概率参数及最大变异步长的参数优化。(本文来源于《武汉大学》期刊2017-05-01)

遗传统计论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

在知情同意基础上,采用随机整群抽样方法,对新疆锡伯族677例(男327例,女350例)健康成人的身体遗传性状(卷舌、尖舌、翻舌、迭舌、利手、扣手、交叉臂、拇指、门齿类型、肤色)进行现场调查、统计。结果显示,10项遗传性状存在一定的性别差异以及左右对称性差异。尖舌(81.98%)、卷舌(70.31%)超过半数,翻舌(36.93%)、迭舌(6.06%),尖舌出现率较高,迭舌出现率较低;4种舌运

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

遗传统计论文参考文献

[1].常志光,王冰,薛运波,宋延明,徐凯.我国蜜蜂遗传育种专利统计分析[J].蜜蜂杂志.2019

[2].徐国昌,张红霞,王卿,刘荣志,张娜.新疆锡伯族成人十项身体遗传性状统计分析[C].中国解剖学会2019年年会论文文摘汇编.2019

[3].黄翌,宋彦欣,王欣怡,邱尉云.长江口乡镇人口长寿的遗传、行为和环境因素统计研究[J].南通大学学报(自然科学版).2019

[4].张雪芬.遗传异质性加权U统计模型的评估与应用研究[D].山西医科大学.2019

[5].郝宏蕾,吴微微,任文彦,苏艳佳,吕德坚.浙江汉族人群19个X-STR基因座的遗传多态性统计分析[J].刑事技术.2018

[6].孙甜甜.遗传相互作用数据中的统计建模分析[D].青岛大学.2018

[7]..《植物遗传资源学报》影响力统计分析[J].植物遗传资源学报.2017

[8].杨前勇.地方品种遗传多样性和群体结构的分析与统计方法[J].江西畜牧兽医杂志.2017

[9].艾剑鸣.从高考试题例谈遗传定律教学中的若干数理统计问题[J].生物学教学.2017

[10].王新新.分布式统计系统的任务调度遗传算法[D].武汉大学.2017

论文知识图

牛INSR基因扩增产物检测二Fig.4-3Det...不同遗传统计模型检测到开花期...在染色体上的分布Figure1Distributi...4 多 Agent 遗传算法实现

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