不同年龄段银杏树雌株根系土壤细菌群落演替特征分析

论文摘要

以幼年期(10年以下)、挂果期(20年)和盛年期(40年以上)的银杏树根系土壤为研究对象,探讨银杏雌株树龄与土壤中细菌菌群结构的关系。运用Illumina Mi Seq平台测序分析幼年期、挂果期以及盛年期银杏树根系土壤细菌的16S r RNA V3～V4区变异序列,对不同年龄阶段银杏树雌株根系土壤细菌的菌群多样性和结构进行研究。银杏树雌株根系土壤共获得612219条微生物的16S r RNA有效基因序列,在97%的相似水平下共得到OTU个数为23294。热图分析表明,各个年龄段银杏树雌株的土壤细菌群落差异较大,不同年龄段优势属不同。据9个土壤样品的多样性指数分析得出,在3组年龄段银杏雌株的土壤样本中,幼年期Shannon指数、Simpson指数、Chao1指数以及ACE指数都是最大,而挂果期皆最小,表明幼年期银杏雌株土壤的细菌菌群丰富度和多样性最高,挂果期银杏土壤的细菌菌群丰富度和多样性最低。变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)在土壤细菌群落中占绝对优势。挂果期和盛果期银杏雌株土壤中浮霉菌门(Planctomycetes)及变形菌门(Proteobacteria)和相对丰度普遍低于幼年期,挂果期银杏树的土壤与盛果期银杏树的土壤中的放线菌门(Actinobacteria)与绿弯菌门(Chloroflexi)的相对丰度明显高于幼年期银杏树的土壤。WS3在盛果期银杏土壤中的相对丰度最低。银杏树雌株树龄可对土壤细菌菌群的多样性及菌群结构产生影响。伴随着育种年限的增加,银杏雌株表层土壤中细菌多样性呈现先降低后增加的变化趋势,且银杏雌株树龄对其土壤细菌的多样性和结构有显著影响。

论文目录

• 1 研究材料与研究方法
•   1.1 研究地区概况
•   1.2 样地设计及样品采集
•   1.3 土壤总DNA的提取、16S rRNA基因的PCR扩增及测序
•   1.4 数据分析
• 2 结果与分析
•   2.1 16S rRNA基因序列测序深度分析
•   2.2 OTU聚类分析
•   2.3 微生物指数多样性分析
•   2.4 微生物群落结构分析
•   2.5 聚类分析
•   2.5 LEfSe分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张萌,侯怡铃,钱叶,陈嘉慧,侯万儒,丁祥

关键词: 菌群多样性,高通量测序,细菌群落,银杏,树龄

来源: 土壤通报 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农业基础科学,林业

单位: 西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川省内江市第六中学,西华师范大学环境科学与工程学院

基金: 2017年国家级大学生创新创业训练计划项目（201710638001）,2017年省级大学生创新创业训练计划项目（201710638001）,2016年校级大学生创新训练项目（cxcy2016018）资助

分类号: S792.95;S714.3

DOI: 10.19336/j.cnki.trtb.2019.06.12

页码: 1343-1351

总页数: 9

文件大小: 1296K

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