木犀科植物叶绿体基因组结构特征和系统发育关系

论文摘要

木犀科11属19个种叶绿体基因组的一般特征和变异特征的比较分析显示,结果表明,该科叶绿体基因组大小为154–165kb,其差异主要是大单拷贝(LSC)长度的差异所致。Jasminum属3个物种的叶绿体基因组长度与其余物种有较大差异,该属clpP基因内含子和accD基因丢失。共线性分析表明, Jasminum属3个物种多个基因出现基因重排现象,倒位可能是重排的主要原因。Jasminum属在IRb/SSC和SSC/IRa边界的基因均与其它物种不同;重复序列与SSR数量检测结果表明,Jasminum属与其余物种在数量及重复长度上差异较大。基于CDS数据构建的系统发育树表明, Abeliophyllum distichum和Forsythia suspensa为木犀科中较早分化的类群。

论文目录

• 1 数据与方法
•   1.1 研究数据
•   1.2 基因组统计和比较
•   1.3 重复序列及SSR搜索
•   1.4 系统发育树构建及属间关系分析
• 2 结果与分析
•   2.1 基因组结构和特征
•   2.2 基因数量
•   2.3 基因长度
•   2.4 重复序列及SSR分析
•   2.5 边界分析
•   2.6 全基因组水平比对及共线性分析
•   2.7 系统发育分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 赵月梅,杨振艳,赵永平,李筱玲,赵志新,赵桂仿

关键词: 木犀科,叶绿体基因组,结构特征,系统发育

来源: 植物学报 2019年04期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 商洛学院生物医药与食品工程学院,中国科学院昆明植物研究所东亚植物多样性与生物地理学重点实验室,西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室

基金: 商洛市博士科技创新团队(No.SK2017-45),商洛学院高层次人才引进项目(No.17SKY029)

分类号: Q943

页码: 441-454

总页数: 14

文件大小: 1350K

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