空肠弯曲菌Ⅵ型分泌系统结构特征和菌株中分布

论文摘要

目的明确中国空肠弯曲菌Ⅵ型分泌系统基因簇的结构特征及其在菌株中的分布。方法对中国不同来源空肠弯曲菌菌株进行全基因组测序,并与数据库不同来源空肠弯曲菌菌株基因组序列和VI型分泌系统基因簇做比较分析。结果 52株空肠弯曲菌经基因组系统发育分析被分为了6个进化分支,对应不同来源的菌株。空肠弯曲菌的Ⅵ型分泌系统基因簇大小约14 kb,包含14个基因,其中hcp等9个主要基因与其他细菌T6SS相同基因的同源性较高,但仍具有空肠弯曲菌独特的基因簇结构。有36.5%(19/52)空肠弯曲菌菌株含有Ⅵ型分泌系统基因簇,主要为鸡来源分支和混合来源分支中的鸡来源菌株;有83.3%(10/12)中国的鸡来源菌株携带Ⅵ型分泌系统基因簇。结论空肠弯曲菌的Ⅵ型分泌系统与鸡来源菌株密切相关。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材 料
•     1.1.1 测序菌株
•     1.1.2 主要试剂
•   1.2 方 法
•     1.2.1 菌株培养和DNA提取
•     1.2.2 菌株基因组测序
•     1.2.3 系统发育构建
•     1.2.4 T6SS基因簇结构分析
• 2 结 果
•   2.1 基因组测序及组装
•   2.2 基因组序列系统发育分析
•   2.3 空肠弯曲菌T6SS基因簇结构特征
•   2.4 T6SS基因簇在空肠弯曲菌菌株中的分布
• 3 讨 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 梁昊,顾一心,周贵兰,张建中,张茂俊

关键词: 空肠弯曲菌,全基因组测序,系统发育结构,型分泌系统

来源: 中国人兽共患病学报 2019年11期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 基础医学

单位: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所

基金: 国家科技重大专项(No.2018ZX10305409,No.2018ZX10712-001)~~

分类号: R378

页码: 996-1001

总页数: 6

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