高粱MADS-box家族基因的鉴定与分析

论文摘要

MADS-box家族是一类具有多种生物功能的转录因子,它参与了植物生长发育的各个过程。本研究利用生物信息学方法,从高粱全基因组数据库中筛选并鉴定出98个高粱MADS-box家族成员,并对该家族成员的蛋白理化性质、系统进化树、染色体定位、基因结构、基因表达模式等特征进行了全面分析。结果表明98个高粱MADS-box基因包含了42个M-type-MADS基因和56个MIKC-MADS基因。高粱MADS-box家族基因的内含子数目为0～10个不等,不同基因的内含子数目相差很大。这些基因位于1～10号染色体,且分布较为均匀。高粱花发育过程中有28个M-type-MADS基因和55个MIKC-MADS基因转录表达。果实发育过程中有32个M-type-MADS基因和54个MIKC-MADS基因转录表达。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 试验材料
•   1.2 试验方法
•     1.2.1 SbMADS-box家族基因下载与验证
•     1.2.2 SbMADS-box家族基因进化树构建
•     1.2.3 基因结构分析
•     1.2.4 SbMADS-box家族基因染色体定位分析
•     1.2.5 SbMADS-box家族基因花、果实发育过程表达模式分析
• 2 结果与分析
•   2.1 SbMADS-box家族基因基本信息
•   2.2 SbMADS-box家族基因进化树的构建
•   2.3 SbMADS-box家族基因结构分析
•   2.4 SbMADS-box家族基因的染色体定位
•   2.5 SbMADS-box家族基因在高粱花和果实发育过程中的表达
•     2.5.1 SbMADS-box家族基因在高粱花发育过程中的表达
•     2.5.2 SbMADS-box家族基因在高粱果实发育过程中的表达
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 郑玲,谢爱玲,韩建明

关键词: 高粱,家族,生物信息学

来源: 东北农业科学 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 洛阳师范学院生命科学学院

基金: 河南省科技攻关计划(172102110105)

分类号: S514

DOI: 10.16423/j.cnki.1003-8701.2019.05.006

页码: 26-29

总页数: 4

文件大小: 1076K

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