导读:本文包含了简并寡核苷酸论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:引物,核苷酸,病毒,基因,单细胞,基因组,小鼠。
简并寡核苷酸论文文献综述
胡群,邹春颖,马思杰[1]（2016）在《沙粒病毒属四步法一致-简并杂合寡核苷酸引物实时荧光PCR检测体系的建立》一文中研究指出目的建立沙粒病毒属四步法一致-简并杂合寡核苷酸引物(CODEHOP)实时荧光PCR(Real-time PCR)检测体系。方法设计1对沙粒病毒属的一致-简并引物,分析Real-time PCR的扩增曲线和熔解曲线,根据引物二聚体(PDs)和扩增产物的熔解温度(Tm)值,在通用的叁步法延伸步骤之后,增加5 s的恒温荧光检测步骤,在PDs和特异性扩增产物的熔解温度之间进行荧光检测温度的优化,建立四步法CODEHOP Real-time PCR方法,评价其灵敏度、特异性和重复性。结果 PDs的Tm值为75.32~76.86℃,特异性扩增产物的Tm值为86.84℃,增加一步温度为84℃,荧光检测步骤可有效去除PDs对检测结果的影响,该方法特异性为100%,病毒RNA检测灵敏度为59.6 pg,重复性良好,变异系数<5%,12份鼠肺盲样的检测结果符合预期。结论建立的沙粒病毒四步法CODEHOP Real-time PCR检测方法敏感、特异,可用于鼠类沙粒病毒感染检测。(本文来源于《中国媒介生物学及控制杂志》期刊2016年03期）
赵百慧,王春,沈佳仁,俞雪莲,高烨[2]（2013）在《共有序列简并杂合寡核苷酸引物聚合酶链反应在呼吸道副黏病毒科病毒诊断中的应用》一文中研究指出采用共有序列简并杂合寡核苷酸引物聚合酶链反应(CODEHOP PCR)体系和商品化RV12试剂盒对急性呼吸道感染患儿下呼吸道标本中的副黏病毒科病毒进行检测,比较CODEHOP PCR与RV12试剂盒检测结果的符合率和敏感度,观察CODEHOP PCR在临床呼吸道标本中对副黏病毒诊断的应用价值,进一步探讨具备检测已知呼吸道病毒和未知新病毒特点的CODEHOP PCR在呼吸道疾病谱和未知潜在呼吸道病毒诊断中的推广价值。采集2011年上海市儿童医院因急性呼吸道感染住院的患儿下呼吸道标本572份,分别采用2种方法对副黏病毒进行检测。CODEHOP PCR检测出阳性标本113例,阳性率为19.76%;RV12试剂盒检测出阳性标本102例,阳性率17.83%;2种方法检测符合率为85.39%。以10倍倍比稀释呼吸道合胞病毒A(RSVA)感染的细胞收获液,检测结果显示,CODEHOP PCR和RV12试剂盒检测下限分别为10-8和10-6。CODEHOP PCR具备简便、易操作和测序精度高等特点,适合疾病预防系统和临床检验科使用。该方法与一些新兴的高通量快速分子诊断技术结合,可提高检测灵敏度,具有高通量、快速检测和筛查未知新病毒的优势,在呼吸道病原体检测领域值得进一步优化和推广。(本文来源于《微生物与感染》期刊2013年02期）
邓建强,刘宝琴,蔡继峰,李文慧,龙仁[3]（2012）在《简并寡核苷酸引物PCR技术的建立及其检测灵敏度分析》一文中研究指出目的建立基于简并寡核苷酸引物PCR(degenerate oligonucleotide primed-PCR,DOP-PCR)的全基因组检测体系,并对其可靠性、灵敏度进行研究。方法通过荧光标记STR复合扩增毛细管电泳检测系统,对DOP-PCR扩增产物进行检测,获得DOP-PCR检测体系的灵敏度、可靠性。结果成功建立了可靠的DOP-PCR检测体系,经过DOP-PCR预处理再进行STR分型检验,其检测灵敏度可达到5个细胞量(相当于30 pg)。结论本研究建立的DOP-PCR技术可靠且可提高法医学微量检材的检测灵敏度。(本文来源于《法医学杂志》期刊2012年01期）
王晶,乔龙,孙海翔,胡娅莉,李洁[4]（2008）在《简并寡核苷酸引物PCR扩增单细胞基因组的影响因素研究》一文中研究指出[目的]研究影响简并寡核苷酸引物聚合酶链反应(degenerate oligonucleotide primed PCR,DOP-PCR)扩增单细胞全基因组的因素。[方法]以单个人外周血淋巴细胞为材料,进行DOP-PCR,研究新鲜细胞与冷藏细胞及采用新鲜和冻存的细胞裂解物为模板对扩增产物的均匀性及特异性的影响。[结果]以新鲜的淋巴细胞为模板与以冷藏的淋巴细胞为模板相比,扩增产物的均匀性相当,特异性上新鲜细胞较好。细胞裂解后立即进行扩增的效果在产物的均匀性及特异性方面均明显优于冻存的细胞裂解物。[结论]对单细胞应用DOP-PCR方法进行全基因组扩增时,应尽量选取新鲜细胞进行裂解,裂解后避免冻存以保证扩增的均匀性及特异性。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2008年16期）
谢珊,李金明[5]（2006）在《一致-简并杂交寡核苷酸引物设计用于未知病原微生物检测的进展》一文中研究指出近年研究发现,暴发的“非典型性肺炎”,禽流感及四川发生的猪链球菌感染等要么是已发现的病原微生物家族中的新成员,要么是原来不感染人的动物病原体。因此,快速、及时、准确定性检测这些病原体,对防治疾病具有重要意义。目前,对病原微生物快速检测通常采用聚合酶链反应(本文来源于《中华检验医学杂志》期刊2006年08期）
杨丽君,郁卫东,梁蓉,尚美,郭静竹[6]（2005）在《基因组简并寡核苷酸引物聚合酶链反应的影响因素》一文中研究指出目的:对影响现有微量基因组扩增方法———简并寡核苷酸引物聚合酶链反应(degenerateoligonucleotideprimedPCR,DOP-PCR)的因素进行探讨。方法:针对现有DOP-PCR扩增过程中存在的影响产物产量和特异性的因素进行分析,分别从不同的DNA模板来源、模板梯度稀释与否以及DOP-PCR扩增产物是否采用低熔点胶回收去除干扰分析的小片段等方面进行研究,最后以特异性基因(FTCD和CBS)PCR扩增的结果作为评价指标,了解上述因素对DOP-PCR扩增的影响。结果:以小鼠单个卵细胞基因组为模板与以肝基因组DNA为模板相比,在产量上前者明显低于后者,特异性上两者相当。小鼠肝基因组DNA梯度稀释作为模板进行扩增的结果没有明显差异。与未经低熔点胶回收的DOP-PCR产物相比,经低熔点胶回收的DOP-PCR产物在常规PCR扩增反应中得到的产物特异性更好。结论:应用DOP-PCR方法进行扩增时,小鼠单个卵细胞可以用来进行DOP-PCR的扩增从而用于对特异性基因的检测,但是在扩增产量方面需要进一步的改进或优化。对现有DOP-PCR反应进行产物低熔点胶回收纯化,能够增加产物的特异性,效果满意。(本文来源于《北京大学学报(医学版)》期刊2005年04期）
石正丽,Durand,Stephanie,Bonami,Jean-Robert[7]（2000）在《用简并寡核苷酸探针筛选对虾白斑综合征病毒DNA多聚酶基因片段》一文中研究指出根据一些病毒的DNA多聚酶氨基酸序列中特有的保守序列VYGDTD设计的简并寡核苷酸 ,经地高辛标记后与对虾白斑综合征病毒基因库克隆杂交 ,筛选出一段长度为 70 7bp的EcoRI基因片段 ,该片段在一个开放阅读框内。并含DNA多聚酶B家族特有的保守序列YGDTDS。经与基因库比较 ,其氨基酸序列与藻类DNA病毒科 (Phycodnaviridae)的几株藻类病毒的DNA多聚酶片段有部分相似 ,因此推测该核苷酸片段为对虾白斑综合征病毒DNA多聚酶基因的部分序列。(本文来源于《中国病毒学》期刊2000年03期）
金帆,黄荷凤,叶英辉,徐晨明,邢兰凤[8]（2000）在《简并寡核苷酸引物聚合酶链反应扩增单细胞全基因组均匀性研究》一文中研究指出目的 探讨单细胞简并寡核苷酸引物聚合酶链反应 (DOP PCR)扩增全基因组DNA的均匀性及植入前胚胎遗传学研究的新途径。方法 获取正常男女性、X单体、X、13和 2 1叁体细胞 ,行单细胞DOP PCR ,通过比较基因组杂交 (CGH )双色荧光强度比变化 ,分析扩增均匀性。结果 (1)DOP PCR产物 /正常男性基因组DNACGH :约 1/ 3常染色质区强度比均数及标准差超过正常允许范围 ,X染色体假性过度表达 ,13、2 1叁体无明显变化。 (2 )DOP PCR产物 /正常男性单细胞DOP PCR产物CGH :94%强度比均数及标准差接近期望值 ,能显示正常男女性、X单体、X、13和 2 1叁体染色体拷贝数变化。结论 单细胞DOP PCR扩增基因组DNA存在明显的不均匀性 ,但这种不均匀扩增是非随机的。如选择合适的参照 ,扩增产物可用于植入前胚胎等单细胞全基因组研究。(本文来源于《中华妇产科杂志》期刊2000年08期）
邓昊,王文,夏家辉[9]（1998）在《用简并寡核苷酸引物构建人类染色体区带特异性探针池的技术》一文中研究指出目的建立快速有效构建人类染色体区带特异性探针池及其文库的技术。方法显微切割人类染色体３ｐ２３－ｐ２６，３ｑ２１－ｑ２２，４ｐ１２－ｐ１６区带，用简并寡核苷酸引物－ＰＣＲ（ｄｅｇｅｎｅｒａｔｅｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｅｄｐｒｉｍｅｒｅｄ－ＰＣＲ，ＤＯＰ－ＰＣＲ）扩增，并用荧光原位杂交（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅｉｎｓｉｔｕｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ，ＦＩＳＨ）检测扩增产物来源，再将区带特异性扩增产物克隆于ｐＵＣ１９载体构建区带特异性文库，以及用α－３２ＰＡＴＰ标记的ｇＤＮＡ行菌落原位杂交。结果经ＦＩＳＨ证实，３ｐ２３－ｐ２６，３ｑ２１－ｑ２２，４ｐ１２－ｐ１６探针池均在切割相应区带出现特异性信号。其中３ｑ２１－ｑ２２获得的１．２×１０４个阳性克隆。随机分析３０个含插入片段的白色菌落，其插入片段平均约４２０ｂｐ。２２０个白色克隆菌落原位杂交示单拷贝和低度重复序列占８１％（１７８／２２０）。结论改进的显微切割结合ＤＯＰ－ＰＣＲ为人类染色体探针池及文库构建建立了一个简易、高效的方法，这将有助于基因克隆和人类基因的全序列分析。(本文来源于《中华医学遗传学杂志》期刊1998年03期）
简并寡核苷酸论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
采用共有序列简并杂合寡核苷酸引物聚合酶链反应(CODEHOP PCR)体系和商品化RV12试剂盒对急性呼吸道感染患儿下呼吸道标本中的副黏病毒科病毒进行检测,比较CODEHOP PCR与RV12试剂盒检测结果的符合率和敏感度,观察CODEHOP PCR在临床呼吸道标本中对副黏病毒诊断的应用价值,进一步探讨具备检测已知呼吸道病毒和未知新病毒特点的CODEHOP PCR在呼吸道疾病谱和未知潜在呼吸道病毒诊断中的推广价值。采集2011年上海市儿童医院因急性呼吸道感染住院的患儿下呼吸道标本572份,分别采用2种方法对副黏病毒进行检测。CODEHOP PCR检测出阳性标本113例,阳性率为19.76%;RV12试剂盒检测出阳性标本102例,阳性率17.83%;2种方法检测符合率为85.39%。以10倍倍比稀释呼吸道合胞病毒A(RSVA)感染的细胞收获液,检测结果显示,CODEHOP PCR和RV12试剂盒检测下限分别为10-8和10-6。CODEHOP PCR具备简便、易操作和测序精度高等特点,适合疾病预防系统和临床检验科使用。该方法与一些新兴的高通量快速分子诊断技术结合,可提高检测灵敏度,具有高通量、快速检测和筛查未知新病毒的优势,在呼吸道病原体检测领域值得进一步优化和推广。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
简并寡核苷酸论文参考文献
[1].胡群,邹春颖,马思杰.沙粒病毒属四步法一致-简并杂合寡核苷酸引物实时荧光PCR检测体系的建立[J].中国媒介生物学及控制杂志.2016
[2].赵百慧,王春,沈佳仁,俞雪莲,高烨.共有序列简并杂合寡核苷酸引物聚合酶链反应在呼吸道副黏病毒科病毒诊断中的应用[J].微生物与感染.2013
[3].邓建强,刘宝琴,蔡继峰,李文慧,龙仁.简并寡核苷酸引物PCR技术的建立及其检测灵敏度分析[J].法医学杂志.2012
[4].王晶,乔龙,孙海翔,胡娅莉,李洁.简并寡核苷酸引物PCR扩增单细胞基因组的影响因素研究[J].安徽农业科学.2008
[5].谢珊,李金明.一致-简并杂交寡核苷酸引物设计用于未知病原微生物检测的进展[J].中华检验医学杂志.2006
[6].杨丽君,郁卫东,梁蓉,尚美,郭静竹.基因组简并寡核苷酸引物聚合酶链反应的影响因素[J].北京大学学报(医学版).2005
[7].石正丽,Durand,Stephanie,Bonami,Jean-Robert.用简并寡核苷酸探针筛选对虾白斑综合征病毒DNA多聚酶基因片段[J].中国病毒学.2000
[8].金帆,黄荷凤,叶英辉,徐晨明,邢兰凤.简并寡核苷酸引物聚合酶链反应扩增单细胞全基因组均匀性研究[J].中华妇产科杂志.2000
[9].邓昊,王文,夏家辉.用简并寡核苷酸引物构建人类染色体区带特异性探针池的技术[J].中华医学遗传学杂志.1998
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