基于数据库分析不同类型生境中厌氧氨氧化细菌的多样性分布特征

论文摘要

【目的】厌氧氨氧化过程是一种能在厌氧条件下氧化NH4+同时还原NO2–或者NO3–生成N2的过程,是氮素循环过程的重要途径之一。厌氧氨氧化过程由厌氧氨氧化细菌催化完成,目前通过分子生物学的手段已证实了厌氧氨氧化细菌存在于多种类型的生境中,本文对厌氧氨氧化细菌在不同类型生境中的多样性分布规律进行了系统分析。【方法】基于NCBI数据库中厌氧氨氧化细菌的16SrRNA基因序列,利用Mothur分析平台系统分析了厌氧氨氧化细菌在不同生境中的多样性分布规律和特征。【结果】分析表明,海洋环境中Ca. Scalindua属的厌氧氨氧化细菌占绝对主导;淡水和农业土壤中Ca. Brocadia属的厌氧氨氧化细菌占优势;工程系统中普遍存在Ca. Brocadia和Ca. Kuenenia属的厌氧氨氧化细菌;而湿地和河口环境中厌氧氨氧化细菌多样性最高,Ca. Scalindua、Ca. Brocadia和Ca. Kuenenia属的厌氧氨氧化细菌均有较高的相对丰度,显示出了陆地与海洋交汇的显著特征。【结论】本研究系统展示了不同的生境中厌氧氨氧化细菌的多样性群落结构生境分布特征,表明环境特征差异直接影响了厌氧氨氧化细菌的种群分布和系统演化。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 数据收集与整理
•   1.2 Anammoxers参考数据库的建立
•   1.3 利用Mothur软件分析厌氧氨氧化细菌的多样性
•     1.3.1 不同生境之间的显著性差异分析:
•     1.3.2 不同生境Anammoxers的α多样性分析:
•     1.3.3 不同生境Anammoxers的β多样性分析:
• 2 结果和分析
•   2.1 厌氧氨氧化细菌在不同类型生境中的多样性指数
•   2.2 不同类型生境中厌氧氨氧化细菌的种属组成
•   2.3 不同类型生境中厌氧氨氧化细菌的种属分布差异
•   2.4 不同生境的环境因素与厌氧氨氧化菌种群结构的关系
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 洪义国,黄天政,李益本,吴佳鹏,焦黎静,崔明超

关键词: 厌氧氨氧化细菌,数据库,多样性,生境,群落结构

来源: 微生物学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 广州大学大湾区环境研究院,广州大学环境科学与工程学院

基金: 国家自然科学基金(31870100,41576123,9185111),广州大学百人计划人才引进启动基金(GZHU-B-05)~~

分类号: Q938

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180403

页码: 1143-1155

总页数: 13

文件大小: 1437K

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