不同生长年限霍山石斛内生菌的多样性与差异性

论文摘要

为探索霍山石斛内生菌的多样性与差异性,该文采用宏基因组学的方法对不同生长年限5组30份霍山石斛样品内生细菌及真菌的菌群进行了分析。研究结果显示,从霍山石斛中鉴定出3 540个细菌OTUs,5组样品共有OTUs为138个;鉴定出2 168个真菌OTUs,5组样品共有OTUs为143个。霍山石斛优势细菌菌群为Sphingomonas sp.,Acinetobacter sp.,Burkholderia sp.,Methylobacterium sp.,Enterococcus sp.,Bacillus sp.,差异菌群Oceanobacillusd sp.,Actinomycetospora sp.,Paenibacillus sp.,霍山石斛优势真菌群为Zasmidium sp.,Zymoseptoria sp.,Alternaria sp.,Cladosporium sp.,Fusarium sp.,差异菌群为Cyphellophore sp.,Fusarium sp.,聚类结果显示无论是内生细菌还是内生真菌,ⅢY2,ⅢY3均独立聚为一类,ⅡY1,ⅢY1也独立聚为一类。研究结果丰富了霍山石斛内生细菌和内生真菌的种类与资源,也为霍山石斛合理采收提供了理论参考。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 霍山石斛样品
•   1.2 样品消毒处理
•   1.3 样品宏基因组测序
•   1.4 数据处理与统计分析
• 2 结果与分析
•   2.1 物种组成（OTU）分析
•   2.2 多样性分析
•   2.3 优势菌和差异菌
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈绍通,戴军,姜雪萍,宋向文,陈存武,陈乃富,郭兰萍,韩邦兴

关键词: 霍山石斛,内生菌,生长年限,宏基因组学

来源: 中国中药杂志 2019年06期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 安徽中医药大学药学院,皖西学院生物与制药工程学院,安徽省中药资源保护与持续利用工程实验室,中国中医科学院中药资源中心

基金: 国家重点研发计划项目(2017YFC1700701),安徽省杰出青年科学基金项目(1808085J17),国家中药材产业技术体系(CARS-21),中央本级重大增减支项目(2060302)

分类号: S567.239;Q93

DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.2019.0022

页码: 1145-1150

总页数: 6

文件大小: 302K

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