导读:本文包含了序列比较论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,序列,叶斑病,线粒体,磁共振,分枝,基因组。
序列比较论文文献综述
冯鉴童[1]（2019）在《蛋螺属（腹足纲：蛋螺亚纲：蛋螺科）线粒体全基因组序列比较及系统发育分析》一文中研究指出为了更好地了解蛋螺的线粒体基因组,我们对中国的4种蛋螺渔舟蛋螺(15427 bp)、齿纹蛋螺(15552 bp)、黑线蛋螺(15571 bp)、波纹蛋螺(15583 bp)的线粒体全基因组进行了比较分析研究。为了确定蛋螺属海生腹足类在系统发育中的地位,我们构建了基于13个蛋白质编码基因的系统发育树。这项研究有助于了解比较蛋螺科的线粒体基因组和蛋螺科的系统发育关系。(本文来源于《第叁届现代海洋（淡水）牧场学术研讨会摘要集》期刊2019-10-17）
姜庆林,张宜辉,尹召华,俞步清,姚新年[2]（2019）在《我国地方鸡种CYP21A2基因外显子1序列比较分析》一文中研究指出为了探究CYP21A2基因在鸡中的遗传多样性,对25个地方鸡品种的CYP21A2基因外显子1序列进行目标捕获测序,以红色原鸡(Gallus gallus)为标准基因库,并用MEGA6软件对25个鸡种CYP21A2基因外显子1序列进行对比分析,筛选CYP21A2基因外显子1的SNPs位点和Indels位点,以及氨基酸对应的变化,最后运用邻接法构建进化树进行聚类分析。结果显示:在25个品种中有2个SNPs位点和1个Indels位点;在36 bp处的SNP1,由G→C,为同义突变;在119 bp处的SNP2,由G→A,为错义突变,编码的氨基酸由谷氨酰胺突变为精氨酸;聚类分析显示25个鸡种大致分为3类,其中AA鸡单独为一类,安卡鸡、SPF来航鸡和广西黄鸡等12个鸡种聚为一类,其余12个鸡种聚为一类,表明AA鸡CYP21A2基因外显子1为单独起源。综上分析,我国地方鸡品种中CYP21A2基因外显子1具有丰富的遗传多样性,在抗病性和免疫能力不同的鸡品种间存在差异,提示其与我国地方鸡种的先天免疫功能和抗病有关。(本文来源于《中国家禽》期刊2019年19期）
刘本帅,郑圣晗,原小雅,陈颖,张莘[3]（2019）在《25个鸡品种DMB2基因序列比较分析》一文中研究指出[目的]DMB2(major histocompatibility complex,class Ⅱ,DM beta 2)基因是鸡MHCⅡ类的典型基因座,通过比较不同鸡品种的DMB2基因序列探究该基因对鸡的免疫反应和抗病性的作用和意义。[方法]本研究对25个不同鸡种的DMB2基因序列进行目标捕获测序,以NCBI上Gallusgallus的DMB2基因序列作为参考序列,通过MEGA6软件进行序列比对分析,筛选出不同鸡种DMB2基因序列上的SNPs和Indels位点以及氨基酸的变化,并根据基因序列的差异构建系统进化树,探究不同鸡种的同源性。[结果]结果表明DMB2基因表现其遗传多态性的同时呈现出较高的保守性,外显子上突变和插入缺失较少。进化树分析显示抗病性较强的鸡种广西黄鸡、SPF-来航鸡、藏鸡、雪山草鸡的同源性较高。[结论]不同鸡种中DMB2基因呈现出较高的保守性,在进化过程中不易发生突变,该基因在鸡的免疫反应中具有重要作用。(本文来源于《西南农业学报》期刊2019年08期）
徐腊红,陆籽豪,唐历波,李栎[4]（2019）在《几条热点DNA条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力比较》一文中研究指出【目的】比较ITS2、ITS、psbA-trnH、rbcL、matK序列对海南大戟科植物的鉴定能力。【方法】利用PCR测序法对供试样本目的片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析。【结果】5条候选序列的序列获得率分别为86.96%、76.81%、89.86%、79.71%、49.28%;ITS2序列的变异系数和信息位点系数最大;ITS2序列存在明显的barcoding gap,种间与种内变异分布呈两边分开的趋势。ITS序列虽存在barcoding gap,但种内变异和种间变异有较多的重迭区;psbA-trnH和matK序列barcoding gap均不明显,同时种内变异和种间变异有较多的重迭区;rbcL序列虽barcoding gap不明显,但种内变异和种间变异重迭比例较小。【结论】ITS2条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力强,rbcL序列不能作为单独的条形码鉴定物种,但可以作为ITS2的补充条形码。(本文来源于《广东农业科学》期刊2019年09期）
杨祺[5]（2019）在《iShim,SS-EPI弥散序列在甲状腺结节弥散加权成像的应用比较》一文中研究指出目的探讨单层动态匀场技术在3.0T磁共振扫描仪上甲状腺结节弥散加权成像中提高图像质量可行性。方法 24例超声已明确诊断为甲状腺结节的患者共32个结节,对其进行单层动态匀场技术(iShim-EPI)和常规单次激发平面回波成像(SS-EPI)两种不同弥散序列(diffusion-weighted-imaging, DWI)扫描。以(本文来源于《中国中西医结合学会医学影像专业委员会第十七次全国学术大会暨甘肃省中西医结合学会医学影像专业委员会第六届学术年会资料汇编》期刊2019-08-22）
陆艳,黄仁军,李勇刚[6]（2019）在《颅颈部高分辨率MRA:常规黑血序列与SNAP序列的比较》一文中研究指出目的:比较非对比增强血管和斑块内出血同时成像(SNAP)序列与常规黑血(BB)序列在颅颈动脉(CCA)成像中的图像质量,探讨SNAP序列的临床实用性。方法:对45例患者行颅颈动脉高分辨率MRI检查,扫描序列包括SNAP、T1WI-BB、T2WI-BB及容积采集各向同性快速自旋回波质子加权成像(PDWI-VISTA)。分别在各序列图像上测量和计算管腔及管壁的信噪比(SNR)、管壁与管腔信号差异噪声比(SDNR)及管壁与管腔的对比噪声比(CNR)。对诊断为颈内动脉夹层壁内血肿(IMH)的20例患者按照上述方法计算壁内血肿的SNR及壁内血肿与管腔的SDNR和CNR。采用单因素方差分析和Student-Newman-Keuls q检验对4个序列的上述各项测量指标分别进行两两比较。结果:(1)SNAP序列与T1WI-BB、T2WI-BB及PDWI-VISTA序列之间的管腔SNR、管壁SNR、管壁与管腔SDNR的差异均具有统计学意义(P<0.001),而与其它序列的管壁与管腔CNR的差异无统计学意义(P=0.014);(2)两两比较发现SNAP序列的管腔和管壁SNR与其它3个序列间的差异具有统计学意义(P<0.05);(3)20例有壁内血肿的患者壁内血肿SNR及血肿与管腔CNR在SNAP序列与其它3个序列之间具有显着的统计学差异(SNR:P<0.001;CNR:P<0.001),而壁内血肿与管腔SDNR的差异无统计学意义(P=0.048),但血肿与管腔SDNR在SNAP序列中均值最高;(4)两两比较发现血肿SNR及血肿与管腔CNR在SNAP序列与其它3种序列之间差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:虽然SNAP序列能够清晰显示管壁及管腔结构,但管壁与管腔对比度不及T1WI-BB序列;而SNAP序列在识别壁内血肿方面较其它3个序列具有优势。(本文来源于《放射学实践》期刊2019年08期）
杨正钊,王梓豪,辛明明,姚颖垠,宿振起[7]（2019）在《小麦主栽品种济麦22与良星99的全基因组序列比较分析》一文中研究指出济麦22与良星99是系谱相同且农艺性状高度相似的两个大面积种植品种。为了分析两品种的差异,首先采用田间试验,对表型进行了系统分析,发现在株高和穗长上两者存在显着性差异,其中良星99高于济麦22,这与前人的研究结果相吻合。其次,采用Illumina HiSeq2000测序技术进行了全基因组测序,每个品种测序量为90G。经分析发现,与参考基因组中国春相比,济麦22有总长度约为557Mbp的拷贝数变异区域,而良星99则有总长度约为511Mbp的拷贝数变异区域,其中466Mbp为两个品种与中国春均存在差异的区域,占小麦参考基因组序列长度的3.31%。对小片段的插入/缺失序列和SNP分析发现,济麦22与中国春之间存在的差异位点数目分别为1389861和18411441个,而良星99与中国春之间的差异位点数目分别为1578034和20444407个,其中两者与中国春同时存在差异的位点数目分别为1065770和16197912个。对上述3个不同类型的差异所在染色体位置进行分析发现,大片段拷贝数变异区域主要位于2B、4B等染色体上,而小片段的插入/缺失序列和SNP差异位点则主要位于1D、2B、4B等染色体上。在此基础上,对济麦22与良星99之间株高和穗长相关基因的序列进行了系统研究,已证明3个基因编码的蛋白在两个品种之间存在差异,其中位于2D染色体上的1个基因发生了移码突变。综上所述,济麦22与良星99在基因组序列上相似性较高,但是存在部分染色体上存在显着的差异,并且鉴定出3个株高候选基因,为制定小麦品种特异性标准及利用这2个品种作为亲本进行遗传改良提供了有价值的遗传信息。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11）
叶雅丽,闫李侠,黄至澄,陈保文,王国治[8]（2019）在《16S rRNA序列分析法与传统生化分析法对分枝杆菌分型鉴别的比较研究》一文中研究指出目的比较16S rRNA序列分析法与传统生化分析法鉴别54株分枝杆菌模式菌株的异同。方法采用PCR方法扩增54株分枝杆菌模式菌株16S rRNA序列,通过序列比对构建发育树状谱,计算相似性,并与传统生化分析分型结果进行比较。结果 16S rRNA序列分析可鉴定出41株(41种)分枝杆菌,其它6组(包括13株11种)的分枝杆菌16S rRNA序列两两之间相同无法区别,传统的生化分析方法难以区分鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌、龟分枝杆菌和偶然分枝杆菌,但采用16S rRNA很容易区分;16S rRNA基因无法区分海分枝杆菌与溃疡分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌,但采用传统生化分型方法很容易区分。结论在分枝杆菌的分型鉴定方面,分枝杆菌16S rRNA基因序列分析与传统分型均十分有效,且两者的联合应用,能够提高鉴定的准确性。(本文来源于《全科医学临床与教育》期刊2019年07期）
郑圣晗,陈颖,陈国宏,常国斌[9]（2019）在《CENPA基因在不同鸡种上的序列比较分析》一文中研究指出为找出不同鸡种CENPA基因序列上的差异,为鸡抗病育种研究提供基础材料,利用目标区域捕获测序技术对25个鸡种的CENPA基因进行序列测定。以NCBI网站上Gallus_gallus-5. 0(GCF_000002 315. 4)的CENPA基因序列为参照,利用MEGA 6. 06软件对25个鸡种的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和InDel位点,并构建系统进化树。结果表明:CENPA的外显子没有丰富的多态性,CENPA内含子的丰富多态性主要体现在Intron4上。CENPA基因在Exon3具有保守性,在鸡的进化历史中稳定遗传。25个鸡种大致可被分为4大类,表明我国的地方鸡品种资源丰富,且之间的同源性较低,可为抗病育种的研究提供丰富的样本。(本文来源于《上海农业学报》期刊2019年04期）
唐中发,秦春秀,林春花,郑服丛,缪卫国[10]（2019）在《海南菠萝可可毛色二孢(Lasiodiplodia theobromae)叶斑病病原菌的分离与鉴定以及多基因序列比较分析》一文中研究指出为明确菠萝可可毛色二孢叶斑病病原菌在海南省16个市县的亲缘关系及遗传差异。从海南省的海口、澄迈、儋州、叁亚、保亭等18个市县进行病样采集和病样分离,根据科赫氏法则鉴定,获得18株致病菌株,观察形态特征,并基于多基因联合序列分析其遗传多样性。结果表明,通过形态学鉴定和ITS-TUB2基因序列联合进化树分析,其中来自海口、澄迈、儋州、叁亚、保亭等16个市县的16株病原菌均鉴定为可可毛色二孢(Lasiodplodia theobromae),分生孢子平均大小为:(22.06～31.07)μm×(11.77～16.48)μm;来自乐东的1株为假可可毛色二孢属(L.pseudotheobromae),其分生孢子平均大小为:(21.52～29.77)μm×(12.04～15.42)μm;来自临高的1株为画眉草弯孢(Curvularia eragrostidis),其分生孢子平均大小为:(17.16～26.77)μm×(8.44～16.32)μm;对16株可可毛色二孢菌株(L.theobromae)进行ITS-TUB2-EF-1α-GAPDH-CHS-1-ACT基因拼接序列聚类分析,结果分为3个类群,海南岛的中部(儋州、昌江、白沙、五指山、万宁、琼海等地)聚为一个类群、中北部(屯昌、临高)聚为一个类群、西南部(东方、乐东、叁亚等地)聚为一个类群。该结果说明来源于不同产地不同菠萝品种上的可可毛色二孢遗传多样性丰富。(本文来源于《中国植物病理学会2019年学术年会论文集》期刊2019-07-20）
序列比较论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为了探究CYP21A2基因在鸡中的遗传多样性,对25个地方鸡品种的CYP21A2基因外显子1序列进行目标捕获测序,以红色原鸡(Gallus gallus)为标准基因库,并用MEGA6软件对25个鸡种CYP21A2基因外显子1序列进行对比分析,筛选CYP21A2基因外显子1的SNPs位点和Indels位点,以及氨基酸对应的变化,最后运用邻接法构建进化树进行聚类分析。结果显示:在25个品种中有2个SNPs位点和1个Indels位点;在36 bp处的SNP1,由G→C,为同义突变;在119 bp处的SNP2,由G→A,为错义突变,编码的氨基酸由谷氨酰胺突变为精氨酸;聚类分析显示25个鸡种大致分为3类,其中AA鸡单独为一类,安卡鸡、SPF来航鸡和广西黄鸡等12个鸡种聚为一类,其余12个鸡种聚为一类,表明AA鸡CYP21A2基因外显子1为单独起源。综上分析,我国地方鸡品种中CYP21A2基因外显子1具有丰富的遗传多样性,在抗病性和免疫能力不同的鸡品种间存在差异,提示其与我国地方鸡种的先天免疫功能和抗病有关。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列比较论文参考文献
[1].冯鉴童.蛋螺属（腹足纲：蛋螺亚纲：蛋螺科）线粒体全基因组序列比较及系统发育分析[C].第叁届现代海洋（淡水）牧场学术研讨会摘要集.2019
[2].姜庆林,张宜辉,尹召华,俞步清,姚新年.我国地方鸡种CYP21A2基因外显子1序列比较分析[J].中国家禽.2019
[3].刘本帅,郑圣晗,原小雅,陈颖,张莘.25个鸡品种DMB2基因序列比较分析[J].西南农业学报.2019
[4].徐腊红,陆籽豪,唐历波,李栎.几条热点DNA条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力比较[J].广东农业科学.2019
[5].杨祺.iShim,SS-EPI弥散序列在甲状腺结节弥散加权成像的应用比较[C].中国中西医结合学会医学影像专业委员会第十七次全国学术大会暨甘肃省中西医结合学会医学影像专业委员会第六届学术年会资料汇编.2019
[6].陆艳,黄仁军,李勇刚.颅颈部高分辨率MRA:常规黑血序列与SNAP序列的比较[J].放射学实践.2019
[7].杨正钊,王梓豪,辛明明,姚颖垠,宿振起.小麦主栽品种济麦22与良星99的全基因组序列比较分析[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019
[8].叶雅丽,闫李侠,黄至澄,陈保文,王国治.16SrRNA序列分析法与传统生化分析法对分枝杆菌分型鉴别的比较研究[J].全科医学临床与教育.2019
[9].郑圣晗,陈颖,陈国宏,常国斌.CENPA基因在不同鸡种上的序列比较分析[J].上海农业学报.2019
[10].唐中发,秦春秀,林春花,郑服丛,缪卫国.海南菠萝可可毛色二孢(Lasiodiplodiatheobromae)叶斑病病原菌的分离与鉴定以及多基因序列比较分析[C].中国植物病理学会2019年学术年会论文集.2019
论文知识图
