丹参转录因子SmGRAS3的克隆、亚细胞定位和表达分析

论文摘要

GRAS转录因子在调控植物根生长与GA信号通路中起着重要作用。该研究克隆得到了SmGRAS3基因,其开放阅读框2 247 bp,编码748个氨基酸。运用生物信息学软件对该基因编码的蛋白进行了理化性质与结构分析。该基因属于GRAS家族中的SCL9亚家族,其启动子序列主要包含光响应、胁迫响应与激素响应等元件,并可能与GA信号通路及抗逆反应相关蛋白互作。亚细胞定位显示SmGRAS3蛋白主要定位于细胞核。表达模式分析结果显示该基因的表达量在根中最高,茎中最低,光和低温均会诱导SmGRAS3的高表达。该研究为进一步探讨SmGRAS3基因在丹参根生长与抗逆过程中的作用奠定了基础。

论文目录

• 1 材料
•   1.1 植物
•   1.2 菌种与载体
•   1.3 试剂
• 2 方法
•   2.1 总RNA的提取和cDNA的合成
•   2.2 Sm GRAS3基因克隆
•   2.3 SmGRAS3基因的生物信息学分析
•   2.4 SmGRAS3蛋白的亚细胞定位
•   2.5 qRT-PCR分析
• 3 结果与分析
•   3.1 SmGRAS3基因cDNA全长序列的克隆
•   3.2 SmGRAS3基因的生物信息学分析
•     3.2.1 序列分析
•     3.2.2 蛋白二级与三级结构预测
•     3.2.3 进化树分析
•     3.2.4 启动子分析
•     3.2.5 相互作用蛋白分析
•   3.3 SmGRAS3蛋白的亚细胞定位
•   3.4 SmGRAS3基因的表达分析
• 4 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李雯瑞,白朕卿,刘景玲,梁宗锁

关键词: 丹参,生物信息学,亚细胞定位,表达模式分析

来源: 中国中药杂志 2019年22期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 中国科学院水利部水土保持研究所,中国科学院大学,西北农林科技大学生命科学学院,浙江理工大学生命科学与医药学院

基金: 国家自然科学基金项目(81773835)

分类号: S567.53;Q943.2

DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20190829.108

页码: 4830-4836

总页数: 7

文件大小: 426K

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