狗枣猕猴桃AkHSP20基因的生物信息学分析

狗枣猕猴桃AkHSP20基因的生物信息学分析

论文摘要

为探明狗枣猕猴桃AkHSP20的功能,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明:AkHSP20的cDNA全长为922bp,CDS为582bp,编码蛋白是由194个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白,属于HSP20蛋白家族(ID 10157978),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,与其他15种植物的HSP氨基酸序列进行对比,表明其与中华猕猴桃变种亲缘关系较近。

论文目录

  • 1 数据来源与方法
  •   1.1 材料来源
  •   1.2 方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 AkHSP20的理化性质
  •   2.2 AkHSP20的信号肽及跨膜结构
  •   2.3 AkHSP20的结构域
  •   2.4 AkHSP20的二级结构及三级结构
  •   2.5 AkHSP20蛋白质的修饰位点
  •   2.6 氨基酸序列的同源性
  • 3 结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘丹,毕德泷,陈鑫,王立凤

    关键词: 狗枣猕猴桃,生物信息学

    来源: 贵州农业科学 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,园艺

    单位: 牡丹江师范学院

    基金: 黑龙江省教育厅项目(1354MSYYB007),牡丹江师范学院科研项目(QN2019005),黑龙江省教育厅项目(1353PT007),黑龙江省大学生创新创业训练计划项目(201910233007)

    分类号: S663.4;Q811.4

    页码: 87-90

    总页数: 4

    文件大小: 1626K

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