导读:本文包含了顺反构象异构论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:Pin1,动力学别构,系综分布,化学位移
顺反构象异构论文文献综述
朱文凯[1]（2019）在《人类肽基脯氨酰基顺反异构酶Pin1的系综构象与功能研究》一文中研究指出蛋白质分子的骨架由相邻氨基酸之间形成的肽键维系,肽键可以采取顺式或反式两种构象。反式构象由于在能量上远比顺式构象稳定,因此为肽键的主要构象。脯氨酸由于侧链上五元杂环的空间位阻效应,使得其可以采取一定比例的顺式构象。脯氨酸的顺反异构对蛋白质分子发挥其生物学功能至关重要,但是由于脯氨酸顺反构象之间的活化能势垒很高,在生理条件下,它们之间的转换速率很低,因此需要肽基脯氨酰基顺反异构酶(PPIase)的催化加速其顺反异构速率。Pin1(Peptidy1-proy1 cis-trans isomerase NIMA-interactiing 1)是PPIase家族中的一员,与家族中其他的成员不同,Pin1只特异性地识别包含pS-P或pT-P序列的底物,它参与减数分裂、泛素化、基因表达和淀粉样前体蛋白剪切等多种生理过程,与癌症和神经退行性疾病两类重大疾病的发生密切相关。因此,Pin1结构、动力学与功能的研究对揭示其催化机制以及调控其异构酶活性有着重要的意义。本文利用化学位移相关分析的方法,结合溶液小角X射线散射技术精确定量了Pin1在溶液中紧凑态(29%)和伸展态(71%)的比例,这种方法同样适用于其他多结构域蛋白体系。同时,本论文研究还提供了一种新颖的基于蛋白-配体相互作用的策略,可以用于稳定多结构域蛋白的紧凑态或者调控其结构域间的动力学行为。多结构域蛋白的结构域间的相对运动往往对其功能十分重要,因此其构象动态的调控有利于结构、动态与功能的研究。多结构域蛋白的结构域之间通常由一段柔性区域连接,使得结构域间可以发生相对运动。因此,结构域间的柔性区域可能对多结构域蛋白发挥其功能十分重要。在表征了 Pin1的系综分布后,本文通过编辑结构域间柔性区域长度的方法来调控Pin1的系综分布,进一步研究了结构域间紧凑程度与酶活之间的关系。研究发现,Pin1结构域之间的接触程度与酶活并不存在简单的相关性,适当的增加或者减弱结构域之间的接触程度都可以增加其酶活;通过CPMG弛豫弥散实验我们发现结构域之间的接触可以改变催化活性中心毫秒尺度的动力学行为。本文进一步研究了不同结构域接触程度下Pin1底物结合结构域WW对底物的亲和力,发现不同的底物对Pin1两态的结合偏好性不同,这使得Pin1的WW结构域结合不同的底物后可以增加或者减少结构域之间的接触程度,从而使得催化结构域的活性升高,这表明WW结构域结合底物与催化结构域PPIase催化底物异构之间存在正协同效应。蛋白质分子的激发态或“隐态”往往对其发挥功能至关重要,但却由于比例较低而难以被其它结构生物学手段捕捉,核磁共振技术是研究蛋白质激发态的最强有力的手段。通过CPMG弛豫弥散技术,我们发现Pinl的WW结构域在溶液中存在至少两种激发态构象,并且WW结构域的激发态对底物具有更高的亲和力,因此WW结构域可能主要采取构象选择的机制识别底物蛋白。综上所述,本文通过结合溶液核磁共振和小角X射线散射技术研究了 Pin1的多时间和空间尺度下的动力学行为,包括Pin1结构域间的相对运动、PPIase催化活性中心的毫秒尺度运动和WW结构域的激发态研究,发现这些构象的动态变化与其别构、催化和结合底物密切相关。本论文的研究为Pim1别构药物的设计和调控多结构域蛋白的动力学行为提供了新的思路和方法。(本文来源于《中国科学院大学(中国科学院武汉物理与数学研究所)》期刊2019-06-01）
房晓峰,苏醒,刘毅飞,吴长锋[2]（2016）在《氧杂环取代的四苯基乙烯顺反异构体:构象效应对光学性质的影响》一文中研究指出四苯基乙烯(TPE)衍生物因其独特的聚集诱导发光性质(AIE)在生物成像、光电子器件等领域[1]得到越来越多的关注。Mc Murry偶联反应具有廉价、高效等优点,被广泛用于制备TPE类衍生物。但该反应合成的双取代的TPE是难以分离的顺反异构体的混合物[2]。本文将氧杂环引入到TPE中,通过简单的柱层析实现了两种稳定异构体的分离。初步研究发现,顺式异构体具有高量子效率,长荧光寿命等优异性质。这两种可分离的异构体为研究空间位置对分子性质的影响提供了理想的模型,对设计合成性能优异的TPE类材料具有一定的指导意义。(本文来源于《中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十七分会：光化学》期刊2016-07-01）
徐顺,赵晓洋,李瑞玲,刘宏民[3]（2007）在《(E)-N-(4-氨基正丁基)-3-(3-羟基-4-甲氧基-苯基)丙烯酰胺顺反构象异构化的理论研究》一文中研究指出在HF/6-31G(d)水平上寻找(E)-N-(4-氨基正丁基)-3-(3-羟基-4-甲氧基-苯基)丙烯酰胺的顺反构象异构化的过渡态,计算得到了顺反异构化的势垒,揭示其在常温下反式和顺式异构体可迅速转化,但顺式异构体占绝大部分。在B3LYP/6-311 +G(2d,p)水平上用GIAO方法计算两种异构体的~1H和~(13)C NMR的化学位移,通过对理论计算值与实验值的统计分析,显示顺式构象的计算值与实验值较为接近,实验结果证实了理论推断的正确性。(本文来源于《计算机与应用化学》期刊2007年07期）
凌伦奖,倪向善,陈润生,石秀凡[4]（1989）在《细菌视紫红质的构象模拟和视黄醛的顺反异构模型》一文中研究指出本文在细菌视紫红质构象模拟的基础上提出了一个视黄醛顺反异构模型.该模型中视黄醛的C_(13)—C_(14)与Lys—216的C~δ—C~e处于一直线上,这样,顺反异构只涉及视黄醛C_(15)和Lys—216的N~ζ绕此直线为抽的旋转.理论计算表明,这是一种空间障碍最小的模型,并能通过Asp—96和Asp—212传递质子.(本文来源于《生物物理学报》期刊1989年03期）
杨燕,石和平[5]（1988）在《对(mèng)烷的~(13)C-NMR研究顺反异构体比及顺式构象平衡常数K(35℃)》一文中研究指出本工作是在35℃下测定对(艹孟)烷(p-Menthane)(即对位甲基异丙基环已烷)的~(13)C-NMR谱。由取代基参数,经验加和规律计算各碳化学位移数值,归属各谱峰位置。由积分值得知顺式、反式对(艹孟)烷含量之比。并根据权分法计算顺式对(艹孟)烷中构象1与构象2分子数之比。结果表明顺式对(艹孟)烷中异丙基处于平展位置的构象2为主。(本文来源于《分析测试通报》期刊1988年06期）
顺反构象异构论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
四苯基乙烯(TPE)衍生物因其独特的聚集诱导发光性质(AIE)在生物成像、光电子器件等领域[1]得到越来越多的关注。Mc Murry偶联反应具有廉价、高效等优点,被广泛用于制备TPE类衍生物。但该反应合成的双取代的TPE是难以分离的顺反异构体的混合物[2]。本文将氧杂环引入到TPE中,通过简单的柱层析实现了两种稳定异构体的分离。初步研究发现,顺式异构体具有高量子效率,长荧光寿命等优异性质。这两种可分离的异构体为研究空间位置对分子性质的影响提供了理想的模型,对设计合成性能优异的TPE类材料具有一定的指导意义。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
顺反构象异构论文参考文献
[1].朱文凯.人类肽基脯氨酰基顺反异构酶Pin1的系综构象与功能研究[D].中国科学院大学(中国科学院武汉物理与数学研究所).2019
[2].房晓峰,苏醒,刘毅飞,吴长锋.氧杂环取代的四苯基乙烯顺反异构体:构象效应对光学性质的影响[C].中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十七分会：光化学.2016
[3].徐顺,赵晓洋,李瑞玲,刘宏民.(E)-N-(4-氨基正丁基)-3-(3-羟基-4-甲氧基-苯基)丙烯酰胺顺反构象异构化的理论研究[J].计算机与应用化学.2007
[4].凌伦奖,倪向善,陈润生,石秀凡.细菌视紫红质的构象模拟和视黄醛的顺反异构模型[J].生物物理学报.1989
[5].杨燕,石和平.对(mèng)烷的~(13)C-NMR研究顺反异构体比及顺式构象平衡常数K(35℃)[J].分析测试通报.1988