连锁与连锁不平衡联合作图解析烟草青枯病抗性遗传变异

论文摘要

选用"粤烟98"×"118-3"构建的133份F7代单粒传重组自交系（RIL）群体和94份烟草种质组成的自然群体作为研究材料,运用253个SSR和293个InDel标记对这些材料进行基因分型,并针对烟草青枯病抗性开展连锁和连锁不平衡联合作图分析。结果显示,基于RIL群体的连锁分析在4个环境中共发现4个解释率介于12.00%～30.10%之间的QTLs,利用自然群体的关联分析在3个环境中发现解释率在8.78%～11.42%之间的8个单倍型与抗病性密切相关,利用RIL群体和自然群体开展的连锁-连锁不平衡的整合作图分析发现8个解释率介于4.95%～6.93%之间的单倍型与抗病性密切相关。两种或以上分析方法均探测到与烟草青枯病抗性密切相关的单倍型有4个,分别为具正表型效应的Hap227和Hap368及负表型效应的Hap289和Hap370。所得结果表明连锁和连锁不平衡联合作图策略能较准确地发现与烟草青枯病抗性相关的QTLs,该结果可为烟草青枯病抗性相关研究及后续烟草青枯病抗性材料的辅助筛选提供参考。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 试验材料
•   1.2 试验设计
•   1.3 青枯病病情调查
•   1.4 DNA提取及基因分型
•   1.5 数据分析
•   1.6 遗传连锁图谱的构建和QTL定位
•   1.7 单倍型的构建及关联分析
•   1.8 连锁与连锁不平衡联合作图及表型效应分析
• 2 结果
•   2.1 烟草青枯病病情指数
•   2.2 连锁图谱的构建及青枯病抗性的QTL定位
•   2.3 连锁不平衡分析和单倍型构建
•   2.4 群体结构分析和关联分析
•   2.5 连锁与连锁不平衡平行作图
•   2.6 228份烟草材料的群体结构及整合作图
•   2.7 青枯病抗病相关单倍型的表型效应
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 赖瑞强,李荣华,夏岩石,郭培国,袁清华,赵伟才,张振臣

关键词: 烟草,青枯病抗性,连锁分析,关联分析,连锁和连锁不平衡联合作图

来源: 中国烟草科学 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 植物保护

单位: 广州大学生命科学学院,广东省农科院作物研究所,广东省烟草南雄科学研究所

基金: 广东省烟草专卖局（公司）科技计划项目“烟草抗青枯病育种及分子标记辅助选择研究”（201403）,“优良烤烟品种（系）的青枯病抗性定向改良研究”（201702）,中国烟草总公司科技计划面上项目“烟草SSR标记的开发与青枯病抗性材料的鉴定筛选”{2011[151]19}

分类号: S435.72

DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2019.06.001

页码: 1-10

总页数: 10

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