LncRNA-NONMMUT131476.1对PHEV复制的影响及其靶基因Nlrc5的验证

论文摘要

长链非编码RNA（long non-coding RNA,LncRNA）是长达200个以上核苷酸的转录本,在不同组织和发育阶段的表达具有特异性。为筛选与猪血凝性脑脊髓炎病毒（porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus,PHEV）致小鼠神经系统损失相关的LncRNA,本试验对正常小鼠和PHEV感染小鼠大脑皮质进行高通量测序,获得PHEV感染过程中LncRNA差异表达数据。经过生物学分析,发现与PHEV感染相关的LncRNA-NONMMUT131476.1位于小鼠第8号染色体Herpud1（homocysteine-inducible,endoplasmic reticulum stress-inducible,ubiquitin-like domain member 1）和Nlrc5（NLR family,CARD domain containing 5）两基因间,由5个外显子构成。利用qPCR方法对感染PHEV的小鼠脑组织和N2a细胞中LncRNA-NONMMUT131476.1及Nlrc5基因的表达量进行检测,发现LncRNA-NONMMUT131476.1和Nlrc5基因的表达量均呈上调。研究发现干扰LncRNA-NONMMUT131476.1后Nlrc5表达被抑制,表明Nlrc5可能为其潜在靶基因。同时,沉默LncRNA-NONMMUT131476.1表达能促进病毒复制增殖,表明该LncRNA可能作为调节因子,参与调控PHEV感染过程,但其具体机制有待于进一步研究。本试验为PHEV感染发病机制和PHEV防制研究提供新思路。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 试剂
•   1.2 细胞、动物与毒株
•   1.3 细胞培养与转染
•   1.4 生物信息学分析
•   1.5 PHEV感染及样本采集
•   1.6 qPCR检测PHEV、LncRNA-NONMMUT-131476.1及Nlrc5表达量
•   1.7 Western blot检测PHEV蛋白表达量
•   1.8 siRNA沉默LncRNA-NONMMUT131476.1表达
•   1.9 统计学方法
• 2 结果
•   2.1 TANRIC数据库中LncRNA-NONMMUT-131476.1注释信息
•   2.2 PHEV感染过程中LncRNA-NONMMUT-131476.1表达检测
•   2.3 LncRNA-NONMMUT131476.1负向调控PHEV复制增殖
•   2.4 LncRNA-NONMMUT131476.1靶基因的预测及功能分析
•   2.5 PHEV感染过程中Nlrc5 mRNA表达量上调
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 姜景夫,兰云刚,李姿,张竞,关继羽,赵魁,高丰,贺文琦,宋德光

关键词: 猪血凝性脑脊髓炎病毒

来源: 中国兽医学报 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 吉林大学动物医学学院

基金: 国家自然科学基金资助项目(31872446,31772704,31602018),吉林省科技攻关资助项目(20180101270JC,20170204033NY),吉林省杰出青年基金资助项目(20160520033JH),中国博士后科学基金资助项目(2018M640285)

分类号: S852.651

DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2019.04.23

页码: 739-744

总页数: 6

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