DHPLC法快速检测动物源大肠埃希菌gyrA、gyrB基因突变的研究

DHPLC法快速检测动物源大肠埃希菌gyrA、gyrB基因突变的研究

论文摘要

利用PCR结合变性高效液相色谱法快速检测大肠埃希菌喹诺酮耐药决定区gyrA基因和gyrB基因突变。方法:对22株喹诺酮耐药大肠埃希菌进行2种基因的PCR扩增,产物经DNA杂交形成同源和异源双链后进行变性高效液相色谱法检测和序列测定。结果:20株试验菌gyrA基因出现异常峰型,14株试验菌gyrB基因出现异常峰型。测序证实所有异常峰型的样本均存在突变位点,正常单峰则无突变位点。其中gyrA基因存在Ser83Leu和Asp87Asn突变,突变率分别为90.9%和86.4%;gyrB基因存在Glu185Asp突变,突变率为4.5%,两种基因均存在多个位点的同义突变。结论:DHPLC方法可用于快速检测大肠埃希菌gyrA和gyrB基因突变。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 试验菌株:
  •     1.1.2 仪器与试剂:
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 模板制备。
  •     1.2.2 PCR扩增。
  •     1.2.3 DNA杂交:
  •     1.2.4 DHPLC检测:
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PCR产物电泳结果
  •   2.2 DHPLC检测结果
  •   2.3 测序结果
  •   2.4 DNA序列与DHPLC图谱相关性
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 姜芹,孙冰清,王晓旭,张文刚

    关键词: 变性高效液相色谱,动物源大肠埃希菌,喹诺酮类耐药,基因突变

    来源: 上海畜牧兽医通讯 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 上海市动物疫病预防控制中心

    基金: 上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2015)第6-3-1号)

    分类号: S852.61

    DOI: 10.14170/j.cnki.cn31-1278/s.2019.02.005

    页码: 20-22

    总页数: 3

    文件大小: 535K

    下载量: 97

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