绿尾虹雉(Lophophorus lhuysii)Toll样受体5基因的克隆和适应性进化分析

论文摘要

【目的】获得绿尾虹雉（Lophophorus lhuysii）Toll样受体5基因（TLR5）编码区序列,并对其编码区蛋白的特征及适应性进化进行分析。【方法】以绿尾虹雉基因组DNA为模板,采用PCR扩增克隆获得TLR5基因编码区序列。使用MEGA、PAML等软件对其序列特征及选择压力进行分析。【结果】绿尾虹雉TLR5基因编码区序列全长2 583 bp,共编码860个氨基酸,以亮氨酸含量最高（133/860）,色氨酸含量最低（11/860）。编码蛋白为典型的Ⅰ型跨膜结构,包括富含LRRs结构域的胞外区、跨膜区和胞内TIR结构域。绿尾虹雉TLR5基因极其保守,与雉鸡（P. colchicus）的同源性最高（97.75%）,与小白鹭（E. garzetta）同源性最低（85.17%）。采用位点-特异模型在胞外区共检测到3个正选择氨基酸位点（263F, 280K和645I）。【结论】绿尾虹雉TLR5基因编码区受到较强的纯净化压力,胞外区LRRs结构域可能为识别病原微生物的区域。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 绿尾虹雉基因组总DNA的提取
•   1.2 引物设计与合成
•   1.3 TLR5基因的PCR扩增
•   1.4 PCR产物克隆及序列测序
•   1.5 绿尾虹雉TLR5的分子特征与同源性分析
•   1.6 绿尾虹雉TLR5基因的系统发生分析
•   1.7 绿尾虹雉TLR5适应性进化分析
• 2 结果与分析
•   2.1 绿尾虹雉TLR5基因的分子特征
•   2.2 绿尾虹雉TLR5基因编码区序列同源性分析
•   2.3 绿尾虹雉TLR5基因的系统发育分析
•   2.4 TLR5基因的适应性进化分析
•     2.4.1 TLR5基因编码区进化模式分析
•     2.4.2 TLR5基因编码区选择压力分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 周明,李彪,欧阳菠,钟赟,杨建东

关键词: 绿尾虹雉,基因,克隆,适应性进化

来源: 四川农业大学学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 四川农业大学动物科技学院

基金: 四川省教育局创新研究小组计划项目(14TD0002)

分类号: Q953

DOI: 10.16036/j.issn.1000-2650.2019.02.013

页码: 232-240

总页数: 9

文件大小: 4361K

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