导读:本文包含了蛋白质组差异分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:蛋白质,电泳,巴马,双向,免疫,蛋白,叶绿体。
蛋白质组差异分析论文文献综述
周玉成,郭梦楠,程世鹏,张海威,周曼莉[1]（2019）在《布鲁菌16M感染后宿主免疫相关蛋白质泛素化修饰的差异分析》一文中研究指出为探究布鲁菌感染宿主细胞早期泛素化修饰蛋白质组表达变化并筛选出影响免疫应答的关键调控蛋白,通过Label-free和泛素化富集技术以及高分辨率LC-MS/MS联用的定量蛋白质组学研究策略,对布鲁菌16M感染11 h (感染5 h,胞内复制6 h)后的巨噬细胞和未感染布鲁菌16M的巨噬细胞进行了泛素化蛋白质组学定量研究,数据库检索分析了16M感染后的巨噬细胞和未感染的巨噬细胞差异表达的泛素化位点对应的蛋白质,并应用生物信息学方法筛选出16M感染巨噬细胞后可造成宿主免疫抑制的关键蛋白质。结果显示,共鉴定出349个蛋白质上580个泛素化位点。布鲁菌16M感染组相对于未感染组167个蛋白质上259个位点泛素化修饰水平发生上调,212个蛋白质上321个位点泛素化修饰水平发生下调(差异倍数>1.5,P<0.05);35个泛素化修饰差异表达的蛋白质可能与布鲁菌感染后宿主的免疫应答有关,其中27个泛素化修饰的下调蛋白质(如Bcap31、Btk、Faf1和Akap31等),1个泛素化修饰上调蛋白质Ubqln1可能是布鲁菌感染宿主后造成免疫抑制的关键蛋白。本研究筛选获得了布鲁菌16M感染宿主细胞免疫相关差异表达的泛素化修饰蛋白质,初步揭示布鲁菌能够调控宿主免疫信号通路、自噬和凋亡等免疫应答过程中相关蛋白质的泛素化修饰,为进一步研究布鲁菌感染后调节宿主泛素化修饰进而形成免疫逃逸的分子机制提供理论基础。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年11期）
李舒欣,张秀莲,赵卉,许世泉[2]（2019）在《人参根、茎、叶蛋白质含量差异分析》一文中研究指出采用杜马斯燃烧法,研究人参不同部位蛋白质含量的差异。用杜马斯定氮仪以EDTA作为标品测定6年生人参根、茎、叶中蛋白质含量。结果发现,人参根、茎、叶中蛋白质含量的平均值分别为14.600%、6.549%、12.339%,人参不同部位的蛋白质含量存在显着差异,表现为根>叶>茎。本研究为人参根、茎、叶产品的开发提供理论依据。(本文来源于《特产研究》期刊2019年03期）
曹雪妍,刘瑛,杨梅,杨宁,梁肖娜[3]（2019）在《牛初乳和牛常乳乳清N-糖蛋白质的差异分析》一文中研究指出为阐明牛乳蛋白质N-糖基化,采用糖蛋白质组学技术,在牛初乳和牛常乳乳清中共鉴定到154个N-糖蛋白和246个糖基化位点,其中,牛初乳鉴定到117个N-糖蛋白和183个糖基化位点;牛常乳鉴定到109个N-糖蛋白和145个糖基化位点。初乳中丛生蛋白(P17697)糖基化位点N-283表达量最高,常乳中α-乳白蛋白糖基化位点N-93表达量最高。考虑定量差异及有无差异,在牛初乳和牛常乳乳清中共鉴定到129个糖蛋白的190个差异表达糖基化位点。基因本体论功能注释表明,差异表达糖蛋白参与的生物学过程是生物调节、刺激性反应、多细胞生物过程、定位、免疫系统过程等;主要分布为细胞外区域和细胞器;主要的分子功能是结合作用、催化活性和分子功能调节。差异表达糖蛋白参与的代谢通路主要是补体与凝血级联、金黄色葡萄球菌感染和溶酶体等。此外,通过蛋白互作分析,找到一些具有高连接度的重要糖蛋白。本研究丰富了牛乳N-糖蛋白质组成及其糖基化位点信息,阐明了牛乳乳清N-糖基化的功能,为评价和改善牛乳品质、研发婴幼儿配方乳中糖蛋白质的改良及功能食品的生产提供了理论依据。(本文来源于《食品科学》期刊2019年12期）
李勤,程晓梅,李永迪,杨培迪,黄建安[4]（2019）在《白叶1号白化过程中叶绿体蛋白质组差异分析》一文中研究指出白叶1号是一种温度敏感型白化茶树品种,叶绿体的变化是其产生阶段性白化现象的关键因素。本研究以白叶1号鲜叶叶绿体为研究对象,采用双向电泳、质谱鉴定结合生物信息学分析,研究阶段性白化过程中叶绿体蛋白的表达差异,探讨白叶1号阶段性白化现象的分子机制。结果表明,在白叶1号白化前期、白化期和复绿期叶绿体中分别识别726、748、718个蛋白质,其中差异表达的蛋白59个,质谱成功鉴定22个差异表达蛋白。生物信息学分析表明,差异表达蛋白直接或间接参与了光合作用、应激响应、核酸代谢、物质代谢和未知功能等,其中与光合作用相关的差异表达蛋白最多,占31.82%,表明阶段性白化现象可能与这些生理功能相关。通过荧光定量PCR分析发现,差异蛋白的基因表达与蛋白表达存在一定差异,这可能是由于蛋白质翻译后加工及修饰造成的。上述研究为进一步揭示白叶1号阶段性白化现象产生的分子机制奠定了理论基础。(本文来源于《茶叶科学》期刊2019年03期）
唐敏[5]（2019）在《抑郁/焦虑敏感性相关的大鼠海马蛋白质组差异分析》一文中研究指出研究背景慢性应激事件被证明为抑郁症和焦虑症的一个重要原因。然而,这些疾病在病理生理学基础上共有的和特异的应激诱导分子机制仍不清楚。方法采用慢性温和刺激(CMS)大鼠模型将抑郁敏感、焦虑敏感和应激抵抗大鼠进行分组。采用质谱和同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术,以及生物信息学分析和相应的免疫印迹验证,对海马组织进行差异蛋白质组分析。结果在2593个定量的蛋白质中,367个异常表达,这些候选海马蛋白质可能与应激诱导的抑郁或焦虑的敏感性和抵抗性有关。它们提供了参与各种代谢途径的潜在蛋白质系统作为新的研究蛋白靶点。此外,免疫印迹分析显示,Esd、Por和Idh2在抑郁敏感组中特异表达;G6pdx、Glo1、Dld和Aldh2在焦虑敏感组中特异表达;Dlat、Ogdhl、Anxa1、Tpp2和Sdha在应激抵抗组中差异表达,表明CMS对大鼠海马的线粒体和代谢过程影响不同。结论总之,观察到的海马蛋白丰度的变化为CMS大鼠模型中的应激调节机制提供了重要的新的见解。这可能是进一步研究的分子基础,有助于更好地理解应激诱导的抑郁或焦虑和应激抵抗的病理生理机制的共性和特异性。(本文来源于《重庆医科大学》期刊2019-05-01）
时俊帅,谷瑞,陈双林,章超,郭子武[6]（2019）在《不同海拔的高节竹笋蛋白质营养品质差异分析》一文中研究指出海拔是多个环境因子的综合反映,对竹子生长和竹笋品质有重要影响。为揭示海拔对高节竹笋蛋白质营养价值的影响,为高节竹高品质竹笋培育提供参考。选择了经营措施和经营水平基本一致的3个海拔高度(110,370,560 m)的试验高节竹林,分别采集露土10 cm左右的竹笋进行蛋白质、必需氨基酸含量的测定,对不同海拔高度竹笋蛋白质、必需氨基酸含量和必需氨基酸评分(AAS)、比值系数(RC)、化学评分(CS)及必需氨基酸指数(EAAI)、必需氨基酸比值系数分(SRC)及功能性氨基酸含量进行了比较分析。结果表明:随海拔的升高,除苯丙氨酸+酪氨酸外,高节竹笋其他种类必需氨基酸含量及EAAI、SRC、AAS、RC和CS均呈减小趋势,但对竹笋蛋白质含量并无显着影响。高节竹笋必需氨基酸含量相对不足,苏氨酸为高竹节笋第一限制氨基酸。发现不同海拔的高节竹笋蛋白质营养价值存在较明显的差异。其中,低海拔的高节竹笋在氨基酸营养价值、利用率、平衡程度以及与模式氨基酸的接近程度等方面相对较好,即蛋白质营养价值较高。(本文来源于《江西农业大学学报》期刊2019年02期）
薛丽京,刘志辉,杨瑜,徐宁,刘燕[7]（2019）在《结核肺组织与正常肺组织蛋白质组双向电泳图谱的差异分析》一文中研究指出目的对结核肺组织与正常肺组织双向电泳图谱进行比较分析,筛选差异表达蛋白质。方法利用双向电泳分离结核组及正常组总蛋白质,并通过计算机图像分析软件分析电泳图谱。结果在结核肺组织中检测有效蛋白点数为(190±11)个,正常肺组织中检测有效蛋白点数为(179±5)个。发现两者间共有15个差异蛋白点,蛋白点分子量(Mr)主要分布于15kD～80kD,PI为3～10。4个点在病灶组织中表达上调,11个点在病灶组织中表达下调。结论通过双向凝胶电泳和图像分析技术对结核肺组织及正常肺组织蛋白质组进行研究,获得了结核组与正常组的差异蛋白点,为进一步利用质谱分析技术做差异蛋白质鉴定奠定了基础,并为肺结核的早期诊断、发病机制探索、病情监测提供依据。(本文来源于《现代医院》期刊2019年01期）
吴延军[8]（2018）在《STZ和食物诱导的广西巴马小型猪T2DM模型肝脏转录组和蛋白质组差异分析》一文中研究指出合理的动物模型对2型糖尿病(Type 2 Diabetes mellitus,T2DM)的研究至关重要。链脲佐菌素(Streptozotocin,STZ)对胰腺组织β细胞具有特异毒性作用,因此被广泛应用于糖尿病动物模型的制作。高脂高糖食物联合低剂量STZ诱导T2DM模型具有造模时间短,成模率高和造模成本低等特点,是目前应用最广泛的造模方法,但是人类T2DM的发生与STZ没有直接的关系,目前最理想的T2DM模型制作方法仍为高脂高糖自然食物诱导。本研究旨在通过构建高脂高糖食物联合低剂量STZ诱导和单纯高脂高糖食物诱导的广西巴马小型猪T2DM模型,分别进行模型猪肝脏组织转录水平和蛋白水平的差异分析,并完成差异候选基因在细胞表达水平和小鼠T2DM模型中的表达验证,为T2DM动物模型的合理应用提供科学的理论依据。主要试验结果如下:1、STZ和食物诱导的广西巴马小型猪T2DM模型构建选取22头20-22 kg雌性巴马小型猪用于T2DM模型制作。随机分为4组:第一组(n=4)用基础饲料饲喂10个月(Control,Ctrl);第二组(n=10)高脂高糖饲料饲喂10个月(DM1_HH);第叁组(n=4)先高脂高糖饲料饲喂6个月后按60 mg/kg耳缘静脉注射STZ,接着高脂高糖饲喂至10个月(DM2_HS);第四组(n=4)先基础日粮饲喂6个月后按60 mg/kg给予耳缘静脉注射STZ接着高脂高糖饲喂至10个月(DM3_SH)。DM2_HS组和DM3_SH组小型猪全部达到T2DM标准,DM1_HH组有4头小型猪造模成功(4/10)。其中,先高脂高糖饲喂后注射STZ(DM2_HS)能够诱导出高血糖T2DM模型。组织病理分析发现长期高脂高糖饲喂组(DM1__HH,DM2__HS)肝脏发生严重的小泡性脂肪变;STZ处理组(DM2_HS,DM3_SH)小型猪胰腺组织受损严重。2、STZ和食物诱导的广西巴马小型猪T2DM模型肝脏转录组分析分别选取4组实验小型猪各3头用于肝脏转录组分析,同时达到|log2(Fold Change)|>1和校正p-value<0.05则被认定为差异表达基因,结果与DM1_HH组相比,DM2_HS组有17个差异表达基因,其中7个为上调基因,10个为下调基因;DM3_SH组有30个差异表达基因,其中16个为上调基因,14个为下调基因。与DM1_HH组相比,一共有4个共表达差异基因同时注释到DM2_HS组和DM3_SH组,分别为CYR61基因,RPL15基因,RGS1基因和一个未知非编码基因LOC102166695,其中CYR61基因,RPL15基因和RGS1基因均为下调表达基因。3、STZ和食物诱导的广西巴马小型猪T2DM模型肝脏蛋白质组分析分别选取T2DM模型组小型猪各3头用于肝脏蛋白组学分析,结果显示与高脂高糖自然食物诱导的DM1_HH组相比,一共有50个共表达差异蛋白同时注释到DM2_HS组和DM3_SH组。差异蛋白所涉及的代谢通路涵盖了氨基酸代谢,碳水化合物代谢和化学药物致癌等途径。差异蛋白分析显示,STZ处理组中的UGT2B31和UGT1A62个UGT家族下调蛋白同时参与了氨基酸,碳水化合物和化学药物致癌等通路,初步确定UGT蛋白参与STZ在肝脏中的代谢。STRING数据库在线分析发现RPL家族有3个蛋白(14、15、35A)通过GMPR2 还原酶与 GPT2、ME3、AGXT、HACL1、RDH11、AKR1A1、CBR3 和 UGT2B31(ENSSSCG00000024213)存在互作关系。蛋白质组学和转录组学联合分析发现,STZ诱导的小型猪T2DM模型肝脏组织中RPL15基因在转录水平和蛋白水平均呈现下调表达模式,证明STZ在诱导糖尿病的发生过程中能够下调RPL15基因在肝脏中的表达,Western Blot试验验证了这一结果。4、候选基因RPL15的克隆和细胞水平的功能验证克隆广西巴马小型猪RPL15基因,发现RPL15基因具有高度的保守性,与NCBI公布的猪(Sus scrofa)的RPL15基因同源性高达99.8%,在CDS区第339位点发生G/A同义突变,未引起氨基酸序列的改变。通过在HEPG2肝脏细胞中分别进行干扰和过表达RPL15试验,初步确定RPM15基因与AGXT、RPL14、AKR1A1、GMPR2和UGT2B31存在稳定的互作关系。过表达RPL15可促进癌基因DLK1、HTA、MXR7和抑癌基因P53的表达,同时抑制抑癌基因PTEN的表达;干扰RPL15基因可促进抑癌基因PTEN、NDRG1的表达。5、候选基因RPL15在小鼠T2DM模型中的表达分析通过高脂高糖饲料联合低剂量STZ(60 mg/kg每天单次腹腔注射,连续注射3d)分别构建昆明小鼠T2DM模型。T2DM模型小鼠组织表达分析发现,RPK15基因在小鼠肌肉、肾脏和肝脏组织中表达较高。与单纯高脂高糖饲喂诱导的mHH组相比,高脂高糖饲喂联合低剂量STZ诱导的mHS组和mSH组小鼠心脏、肝脏、肌肉和肾脏中RPL15基因均呈现下调表达趋势。模型小鼠肝脏中RPL15基因在mHH组中的表达高于mHS组和mSH组,与巴马小型猪T2DM模型研究结果相同。综上所述,本研究成功构建STZ和食物诱导的广西巴马小型猪T2DM模型,完成了模型猪肝脏转录组和蛋白质组的差异分析,并获得肝脏转录水平和蛋白水平的差异表达基因,确定STZ在诱导T2DM的发生过程中下调肝脏中RPK15基因的表达。(本文来源于《广西大学》期刊2018-11-01）
史艳梅,黄笑含,杨铁柱,许国绿,沈和定[9]（2019）在《瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异分析》一文中研究指出从蛋白质水平探讨瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异表达,为完善石磺科贝类从海洋到陆地进化的研究以及解释两种石磺不同的环境适应性提供蛋白质依据。应用Label-free非标定量蛋白质组学技术,结合软件Sequest HT和Proteome Discoverer (Thermo),对瘤背石磺和里氏拟石磺的背部皮肤进行蛋白质组搜库鉴定及定量分析,其中瘤背石磺中鉴定到1 491个蛋白质,里氏拟石磺中鉴定到1 030个蛋白质;用Pfind软件对表达图谱进行同源序列的鉴定及定量分析,检测到928个同源蛋白表达量有差异,瘤背石磺较里氏拟石磺上调表达406个(p<0.05, FC>1.5),下调表达339个(p<0.05, FC<0.5)。适应水下生活的里氏拟石磺背部皮肤角质化程度较低,差异同源蛋白序列分析显示与角质形成、细胞凋亡相关蛋白在里氏拟石磺背部皮肤中高表达,与皮肤保湿性能相关的神经酰胺类物质在瘤背石磺中高表达;KEGG分析显示,嘌呤代谢通路中存在的差异蛋白最多,共73个,其中瘤背石磺较里氏拟石磺上调表达22个,下调表达21个。蛋白组差异分析显示关键酶尿素酶在陆栖性较强的瘤背石磺中高表达,与前人所做动物从水生到陆生进化过程中尿素酶基因完全丢失的研究结论有所出入,属于特殊物种。里氏拟石磺的皮肤辅助呼吸能力和血窦数目均高于瘤背石磺,且背部皮肤中肌纤维更加粗壮,此生理现象在蛋白质组上的表现为两种石磺能量代谢及氧离子运输相关蛋白的差别较大;瘤背石磺背部皮肤中对环境污染反应灵敏的谷胱甘肽S转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶的表达量高于里氏拟石磺,推测其与瘤背石磺较强的皮肤免疫能力和环境适应性相关。蛋白表达谱中928个差异表达同源序列为两种石磺表现差异和环境适应的分子机制研究提供了有意义的蛋白质组的基础数据。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年04期）
孙天骅,李佳,王涛,牛宁,徐继忠[10]（2018）在《抗病与感病苹果叶片应答轮纹病菌侵染的蛋白质表达差异分析》一文中研究指出从‘鸡冠’与‘富士’苹果的杂交后代中选择对轮纹病抗病的材料1-1-24和感病材料1-2-34的叶片为试材,在叶片正面主脉两侧各针刺一处,分别接种长有轮纹病菌(Botryosphaeria berengeriana f.sp.piricola)菌丝和蘸有无菌蒸馏水的PDA培养基饼。通过对接菌前和接菌后24 h的叶片总蛋白进行2-DE分离筛选和质谱检测鉴定,共获得27个差异蛋白,其中9个为胁迫应答蛋白,1个与防御反应相关,17个参与叶绿体光合作用、细胞代谢、核糖体、羧酸等相关合成或未知反应。对β–1,3–葡聚糖酶、酸性内切几丁质酶和AP15基因进行实时定量PCR分析,结果表明:β–1,3–葡聚糖酶和酸性内切几丁质酶是苹果叶片应答轮纹病胁迫的关键蛋白,抗病和感病的苹果叶片在接菌前关键蛋白含量的显着差异可能是导致抗病性不同的原因之一。(本文来源于《园艺学报》期刊2018年03期）
蛋白质组差异分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
采用杜马斯燃烧法,研究人参不同部位蛋白质含量的差异。用杜马斯定氮仪以EDTA作为标品测定6年生人参根、茎、叶中蛋白质含量。结果发现,人参根、茎、叶中蛋白质含量的平均值分别为14.600%、6.549%、12.339%,人参不同部位的蛋白质含量存在显着差异,表现为根>叶>茎。本研究为人参根、茎、叶产品的开发提供理论依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
蛋白质组差异分析论文参考文献
[1].周玉成,郭梦楠,程世鹏,张海威,周曼莉.布鲁菌16M感染后宿主免疫相关蛋白质泛素化修饰的差异分析[J].畜牧兽医学报.2019
[2].李舒欣,张秀莲,赵卉,许世泉.人参根、茎、叶蛋白质含量差异分析[J].特产研究.2019
[3].曹雪妍,刘瑛,杨梅,杨宁,梁肖娜.牛初乳和牛常乳乳清N-糖蛋白质的差异分析[J].食品科学.2019
[4].李勤,程晓梅,李永迪,杨培迪,黄建安.白叶1号白化过程中叶绿体蛋白质组差异分析[J].茶叶科学.2019
[5].唐敏.抑郁/焦虑敏感性相关的大鼠海马蛋白质组差异分析[D].重庆医科大学.2019
[6].时俊帅,谷瑞,陈双林,章超,郭子武.不同海拔的高节竹笋蛋白质营养品质差异分析[J].江西农业大学学报.2019
[7].薛丽京,刘志辉,杨瑜,徐宁,刘燕.结核肺组织与正常肺组织蛋白质组双向电泳图谱的差异分析[J].现代医院.2019
[8].吴延军.STZ和食物诱导的广西巴马小型猪T2DM模型肝脏转录组和蛋白质组差异分析[D].广西大学.2018
[9].史艳梅,黄笑含,杨铁柱,许国绿,沈和定.瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异分析[J].基因组学与应用生物学.2019
[10].孙天骅,李佳,王涛,牛宁,徐继忠.抗病与感病苹果叶片应答轮纹病菌侵染的蛋白质表达差异分析[J].园艺学报.2018
论文知识图
