几种常见节肢动物种群内DNA条形码变异

几种常见节肢动物种群内DNA条形码变异

论文摘要

现阶段研究中能影响DNA条形码鉴定的主要因素有cox1片段的进化速率差异、地域差异、胞内共生菌Wolbachia、线粒体假基因-Numts和线粒体异质性。本研究选用了15种常见的节肢动物,每个物种选用的个体数都超过了5头以上,并且每个物种的个体都来自于同一个种群,以此研究种群内DNA条形码的差异,以及DNA条形码是否可以很好的鉴定物种,是否会因差异过大而出现隐存种的假象造成生物种类的高估。经过研究可以得出以下结论:一、15个物种中,黄粉虫(Tenebrio molitor)和普通卷甲虫(Armadillidium vulgare)物种内的DNA条形码差异超过了2%,种间最大遗传距离分别可达4.0%与6.2%,可能影响DNA条形码的准确性,这两个物种占所有物种数的13.3%。二、黄粉虫种群内差异可以排除胞内共生菌Wolbachia感染和Numts的影响,但同一母本的不同子代之间却没有差异。三、普通卷甲虫种群内差异是由于线粒体异质性引起的,在同一个个体内可检测到两种单体型的存在,同时该虫的同一母本不同子代之间也有6%的差异。通过qPCR的方法得到Sanger测序所得序列仅来自于含量较高的单体型,而未反映出低频次单体型的存在。四、黄粉虫在线粒体的其他基因上也表现出有不同程度的差异,但整个线粒体基因组差异小于条形码序列的差异。

论文目录

  • 摘要
  • abstract
  • 第1章 序言
  •   1.1 DNA条形码概述
  •     1.1.1 DNA条形码出现的紧迫性
  •     1.1.2 DNA条形码概念与原理
  •     1.1.3 DNA条形码片段的选择
  •     1.1.4 DNA条形码研究的一般流程
  •   1.2 DNA条形码的贡献与限制因素
  •     1.2.1 DNA条形码的贡献
  •     1.2.2 影响DNA条形码的因素
  •   1.3 研究目的和意义
  •   1.4 黄粉虫和普通卷甲虫
  • 第2章 材料与方法
  •   2.1 材料
  •     2.1.1 人工饲养类物种
  •     2.1.2 野外采集类物种
  •   2.2 实验仪器
  •   2.3 样品DNA的提取
  •   2.4 DNA条形码扩增和分析
  •   2.5 黄粉虫的物种验证
  •   2.6 黄粉虫和普通卷甲虫种群内差异原因分析
  •   2.7 黄粉虫和普通卷甲虫的饲养
  •   2.8 普通卷甲虫异质性检测
  •   2.9 黄粉虫线粒体基因组扩增及分析
  • 第3章 研究结果
  •   3.1 DNA条形码分析
  •   3.2 黄粉虫的种群内差异
  •     3.2.1 黄粉虫DNA条形码单体型间差异
  •     3.2.2 黄粉虫物种的分子鉴定
  •     3.2.3 黄粉虫种群内差异原因分析
  •   3.3 普通卷甲虫种群内差异
  •     3.3.1 普通卷甲虫DNA条形码单体型间差异
  •     3.3.2 普通卷甲虫物种鉴定
  •     3.3.3 普通卷甲虫种群内差异原因
  •   3.4 黄粉虫和普通卷甲虫同一母本不同子代之间的差异
  •   3.5 普通卷甲虫异质性检测
  •     3.5.1 普通卷甲虫个体内两种单体型的相对定量
  •   3.6 黄粉虫线粒体基因组差异
  •     3.6.1 黄粉虫线粒体基因组基本特征
  •     3.6.2 蛋白编码基因差异分析
  •     3.6.3 非蛋白编码基因的遗传进化分析
  • 第4章 讨论
  • 第5章 结论和展望
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 攻读学位期间取得的科研成果
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 李天楚

    导师: 黄大卫,唐婷

    关键词: 条形码,线粒体异质性,种群差异,黄粉虫基因组

    来源: 河北大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 河北大学

    分类号: Q963

    总页数: 77

    文件大小: 3722K

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