几种常见节肢动物种群内DNA条形码变异

论文摘要

现阶段研究中能影响DNA条形码鉴定的主要因素有cox1片段的进化速率差异、地域差异、胞内共生菌Wolbachia、线粒体假基因-Numts和线粒体异质性。本研究选用了15种常见的节肢动物,每个物种选用的个体数都超过了5头以上,并且每个物种的个体都来自于同一个种群,以此研究种群内DNA条形码的差异,以及DNA条形码是否可以很好的鉴定物种,是否会因差异过大而出现隐存种的假象造成生物种类的高估。经过研究可以得出以下结论:一、15个物种中,黄粉虫（Tenebrio molitor）和普通卷甲虫（Armadillidium vulgare）物种内的DNA条形码差异超过了2%,种间最大遗传距离分别可达4.0%与6.2%,可能影响DNA条形码的准确性,这两个物种占所有物种数的13.3%。二、黄粉虫种群内差异可以排除胞内共生菌Wolbachia感染和Numts的影响,但同一母本的不同子代之间却没有差异。三、普通卷甲虫种群内差异是由于线粒体异质性引起的,在同一个个体内可检测到两种单体型的存在,同时该虫的同一母本不同子代之间也有6%的差异。通过qPCR的方法得到Sanger测序所得序列仅来自于含量较高的单体型,而未反映出低频次单体型的存在。四、黄粉虫在线粒体的其他基因上也表现出有不同程度的差异,但整个线粒体基因组差异小于条形码序列的差异。

论文目录

• 摘要
• abstract
• 第1章 序言
•   1.1 DNA条形码概述
•     1.1.1 DNA条形码出现的紧迫性
•     1.1.2 DNA条形码概念与原理
•     1.1.3 DNA条形码片段的选择
•     1.1.4 DNA条形码研究的一般流程
•   1.2 DNA条形码的贡献与限制因素
•     1.2.1 DNA条形码的贡献
•     1.2.2 影响DNA条形码的因素
•   1.3 研究目的和意义
•   1.4 黄粉虫和普通卷甲虫
• 第2章 材料与方法
•   2.1 材料
•     2.1.1 人工饲养类物种
•     2.1.2 野外采集类物种
•   2.2 实验仪器
•   2.3 样品DNA的提取
•   2.4 DNA条形码扩增和分析
•   2.5 黄粉虫的物种验证
•   2.6 黄粉虫和普通卷甲虫种群内差异原因分析
•   2.7 黄粉虫和普通卷甲虫的饲养
•   2.8 普通卷甲虫异质性检测
•   2.9 黄粉虫线粒体基因组扩增及分析
• 第3章 研究结果
•   3.1 DNA条形码分析
•   3.2 黄粉虫的种群内差异
•     3.2.1 黄粉虫DNA条形码单体型间差异
•     3.2.2 黄粉虫物种的分子鉴定
•     3.2.3 黄粉虫种群内差异原因分析
•   3.3 普通卷甲虫种群内差异
•     3.3.1 普通卷甲虫DNA条形码单体型间差异
•     3.3.2 普通卷甲虫物种鉴定
•     3.3.3 普通卷甲虫种群内差异原因
•   3.4 黄粉虫和普通卷甲虫同一母本不同子代之间的差异
•   3.5 普通卷甲虫异质性检测
•     3.5.1 普通卷甲虫个体内两种单体型的相对定量
•   3.6 黄粉虫线粒体基因组差异
•     3.6.1 黄粉虫线粒体基因组基本特征
•     3.6.2 蛋白编码基因差异分析
•     3.6.3 非蛋白编码基因的遗传进化分析
• 第4章 讨论
• 第5章 结论和展望
• 参考文献
• 附录
• 致谢
• 攻读学位期间取得的科研成果

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 李天楚

导师: 黄大卫,唐婷

关键词: 条形码,线粒体异质性,种群差异,黄粉虫基因组

来源: 河北大学

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 河北大学

分类号: Q963

总页数: 77

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