渤海湾两株H2亚型禽流感病毒的遗传进化分析

渤海湾两株H2亚型禽流感病毒的遗传进化分析

论文摘要

野鸟是禽流感病毒的自然储存库,病毒可以随着宿主的迁徙传播给其他野鸟与家禽。渤海湾是鸟类南北迁徙的重要停歇地,也是东亚-澳大利西亚鸟类迁徙通道的重要组成部分,每年有大量水鸟在渤海湾停歇,促进了禽流感病毒的传播。为了解渤海湾地区禽流感病毒的传播及进化与水鸟迁徙的相关性,2018年春季鸟类迁徙期间的4和5月份,在渤海湾采集鸻鹬类粪便样品2120份,对样品进行检测,分离出2株H2亚型禽流感病毒。对这2株H2亚型禽流感病毒进行了分子特征及遗传进化分析,并结合渤海湾水鸟的环志回收数据,对H2亚型病毒的重组及遗传进化与水鸟迁徙的联系进行了分析。结果表明,2株分离株的HA蛋白裂解位点符合低致病性禽流感病毒的分子特征,它们的8个基因片段同源性均不高,其中879-H2N7的8个基因片段分别与我国福建和澳大利亚的毒株同源性最高,遗传关系最近;854-H2N8的8个基因片段分别与我国湖南以及日本、韩国、孟加拉国和越南的毒株同源性最高,遗传关系最近。渤海湾水鸟的环志回收数据分析表明,879-H2N7随着野鸟的迁徙在渤海湾、福建沿海和澳大利亚之间进行传播与扩散;854-H2N8可能跨越东亚-澳大利西亚和中亚-印度两条通道之间进行基因重组和进化,并会随着鸟类迁徙进行传播和扩散。

论文目录

  • 1材料与方法
  •   1.1实验方法
  •     1.1.1样品的采集、处理及病毒的分离
  •     1.1.2病毒RNA提取
  •     1.1.3禽流感全基因片段扩增
  •     1.1.4 DNA片段的回收、纯化和序列测定
  •     1.1.5序列比较分析
  •   1.2环志回收数据处理
  • 2结果
  •   2.1禽流感病毒分离与鉴定结果
  •   2.2分子特征分析
  •   2.3遗传进化分析
  •   2.4鸟类环志回收数据分析
  • 3讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孟维悦,张国钢,陆军,孟德荣

    关键词: 禽流感病毒,亚型,遗传进化,鸟类迁徙,渤海湾

    来源: 动物学杂志 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所全国鸟类环志中心国家林业和草原局生物多样性重点实验室,沧州师范学院生命科学学院

    基金: 国家林业和草原局野生动物疫病监测和预警系统维护项目

    分类号: S852.65

    DOI: 10.13859/j.cjz.201905015

    页码: 736-745

    总页数: 10

    文件大小: 3210K

    下载量: 66

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