导读:本文包含了高通量分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:通量,高通,量测,多样性,群落,真菌,微生物。
高通量分析论文文献综述
龙驭云,李孝东,汤欣欣,尹婷,杨舒婷[1]（2019）在《基于高通量测序技术的稽留流产绒毛遗传学分析》一文中研究指出目的应用高通量测序技术检测稽留流产绒毛染色体,探讨稽留流产与染色体异常的关系,为患者的下一次妊娠提供临床指导。方法借助高通量测序技术,对111例稽留流产绒毛进行染色体检测,统计染色体异常的类型及所占比例,并将检测结果与临床诊断指征结合,做进一步分析。结果 111例稽留流产绒毛样本检测成功率100. 0%;高通量测序结果显示:111例稽留流产绒毛样本中染色体正常46例(41. 4%);染色体异常65例,异常率为58. 6%。其中以染色体数目异常占比最高,有50例(45. 0%);染色体结构异常15例(13. 5%);初次流产患者组31例,染色体异常率为54. 8%(17/31),两次及两次以上流产患者组73例,染色体异常率为61. 6%(45/73),7例患者信息不详,排除在外。结论染色体异常是孕妇稽留流产的主要危险因素,其中最主要为染色体数目异常;流产次数与稽留流产绒毛染色体异常之间无相关性;高通量测序技术检测绒毛染色体具有高效、快速、准确及可以实现全基因组覆盖等优点,能检测出稽留流产组织的染色体异常具体情况,对孕妇的再次妊娠具有重要的临床指导意义。(本文来源于《中国妇幼保健》期刊2019年24期）
李琼琼,范一灵,宋明辉,秦峰,杨美成[2]（2019）在《基于高通量测序的6类中药饮片污染微生物群落特征分析》一文中研究指出目的:研究6类中药饮片中污染微生物的群落特征,为中药饮片微生物限度标准制定提供依据。方法:参照《中华人民共和国药典》2015年版,对6类中药饮片共60批样品进行耐胆盐革兰阴性菌和沙门菌检查,采用VITEK生化鉴定系统对选择性分离平板上的微生物菌落进行鉴定,并基于16S rRNA高通量测序方法研究中药饮片中污染微生物的群落特征。结果:共有28批样品检出耐胆盐革兰阴性菌,不同类别饮片中耐胆盐革兰阴性菌的检出率差异较大,而沙门菌均未检出;菌株生化鉴定结果表明,6类中药饮片中污染的微生物均属于变形菌门,分布于14个属,其中包含阪崎克罗诺杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、奇异变形杆菌、鲍氏不动杆菌等致病菌或条件致病菌;16S rRNA高通量测序微生物多样性分析结果表明,中药饮片污染微生物主要分布于6个门、27个属,不同类别中药饮片中的优势菌属具有明显差异。结论:16S rRNA高通量测序方法比传统培养法能够获得更加全面的中药饮片中污染微生物群落信息,不同类别中药饮片中污染微生物群落的组成具有一定差异,多种致病菌的检出提示中药饮片污染微生物具有一定的致病风险。(本文来源于《药物分析杂志》期刊2019年11期）
宋伦,吴景,李楠,孙明,杜静[3]（2019）在《基于高通量测序的真核微藻多样性质控分析》一文中研究指出利用测序数据质量、序列聚类水平、测序数据量的合理性探讨,对辽东湾真核微藻进行高通量测序,比较不同序列聚类水平对真核微藻多样性研究的影响,以期进一步优化真核微藻的分子鉴定技术。结果发现,辽东湾17个站位每个样品获得的高质量序列数均超过87%,用于注释的序列数中碱基占比超过97%,表明测得的数据准确可靠。97%序列聚类水平对目标物种丰度的鉴定准确度较高,也会降低对物种多样性的高估。利用稀释曲线和等级聚类曲线可评估测序数据量的合理性,当曲线趋向平坦,说明测序数据量渐进合理,增加测序数据量浪费时间和成本,辽东湾的测序量无论站位评估还是组内评估均达到合理水平。根据高通量测序结果,整理了种水平辽东湾浮游植物名录、分布及特性,名录包含90种藻类,其中7种可导致鱼类死亡,25种引发过赤潮或褐潮,21种含有毒素。(本文来源于《水产科学》期刊2019年06期）
田佳,吴楠,解诗雨,黄志伟,原尚奇[4]（2019）在《基于高通量测序的土壤中ermF基因宿主细菌多样性分析》一文中研究指出为探究土壤环境中抗生素抗性基因宿主微生物的多样性,本研究以天津地区的农田土壤为研究对象,利用高通量测序技术对土样中大环内酯类抗性基因ermF的宿主细菌在不同分类水平的多样性进行了评估。土样中宿主细菌种类覆盖9个门,39个科,42个属。4个土样之间所共有的OTUs只占总OTUs数目的 0.5%,说明样品间宿主细菌群落的差异性显着,可能主要与采样地点不同有关。在所有土样中,ermF基因的优势宿主细菌在门的水平上均为拟杆菌门(Bacteroidetes,相对丰度50.3%～87.7%);同时检测到少量的变形菌门(Proteobacteria),放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),占比均小于4.2%。土样中ermF优势宿主细菌在科水平上都为拟杆菌科(Bacteroidaceae,相对丰度50.3%～87.5%),在属水平上都为拟杆菌属(Bacteroides,相对丰度50.3%～87.5%),其中相对丰度大于0.1%的ermF的宿主菌属有14种。(本文来源于《天津农业科学》期刊2019年11期）
谢丹,刘晓燕,毕远林,宋明发,梁芳芳[5]（2019）在《基于高通量测序分析刺梨果渣自然发酵过程中细菌群落结构及多样性》一文中研究指出为分析刺梨果渣自然发酵过程中各阶段的细菌群落结构及多样性,利用MiSeq高通量测序技术检测自然发酵刺梨果渣中细菌的16S rDNA基因V3～V4高变区序列,比较发酵6～60 d(每隔6 d取一次样)时细菌群落的差异。结果显示:10个不同发酵时期样本中共检测而出26个门类、40个纲类群、74个目类群、162个科类群、373个属类群。在整个发酵过程中,主要以葡糖杆菌属和醋酸杆菌属为主。发酵结束后,在门相对水平丰度值依次是变形菌门(Proteobacteria,99.85%)、厚壁菌门(Firmicutes,0.03%)、放线菌门(Actinobacteria,0.02%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,0.02%),在整个发酵过程中变形菌门占主要地位;在属相对水平丰度值排前面的葡糖杆菌属(Gluconobacter,65.37%)和醋酸杆菌属(Acetobacter,33.66%)为刺梨果渣发酵过程中绝对的优势菌;发酵后期细菌群落趋于稳定,表明刺梨果渣自然发酵过程中微生物群落结构变化是相对稳定的。(本文来源于《食品工业科技》期刊2019年22期）
王珍妮,龚唯鸣,吴意,唐红[6]（2019）在《高通量二代测序对感染性新生儿高胆红素血症病原菌的分析》一文中研究指出目的探讨高通量二代测序技术在筛选感染性新生儿高胆红素血症病原菌中的应用价值。方法运用高通量二代测序技术筛选22例感染性新生儿高胆红素血症患者的病原菌,同时进行传统细菌培养鉴定,比较二者的区别。结果高通量二代测序技术检测病原菌阳性率为100.00%,传统细菌培养检测阳性率为0.00%。高通量二代测序技术筛选出的感染性新生儿高胆红素血症主要病原菌为Anoxybacillus kestanbolensis、Geobacillus vulcani、Klebsiella oxytoca和Acinetobacter guillouiae。结论高通量二代测序技术具有高通量、高特异性、高准确度和快速等特点,适合临床患者病原菌的检测。(本文来源于《中国微生态学杂志》期刊2019年11期）
陈坚,郑伟文,郑益平,陈彬,郑斯平[7]（2019）在《水生植物小叶满江红内生真菌与古菌的发现及基于高通量测序的群落组成分析》一文中研究指出水生植物满江红(Azolla)是一种具代表性的植物和蓝细菌的共生体。利用常规技术,可以发现固氮蓝细菌和众多细菌栖居于满江红的叶腔中。本研究旨在应用扫描电镜(scanning electron microscopy,SEM),荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization, FISH)和高通量测序技术探讨满江红微生物群落的遗传多样性,尤其揭示叶腔中真菌和古菌的存在。以新鲜健康的小叶满江红(A. microphylla, IRRI accesion No. 4018)萍体为材料,对从120个叶腔中分离到的250个微生物样本进行荧光显微镜和电镜的镜检,在230个样本中发现了真菌状的结构特征,包括了菌丝,子囊,子囊孢子,分生孢子和担子等结构。80%的真菌状结构可以定位于第七片至第十五片叶的叶腔中,且叶龄越大,被检出的真菌数量越多。86%的样本检测为古菌阳性,但其丰度与叶龄无关。随后通过高通量测序,对其群落组成进行分析。结果表明,满江红体内有子囊菌门(Ascomycota)(67.39%),拟杆菌门(Phragmoplastophyta)(31.72%),担子菌门(Cordycipitaceae)(0.56%),虫菌门(Entomophthoromycota)(0.33%) 4个真菌门和广古菌门(Euryarchaeota)(99.68%)为主的两2个古菌门共存。本研究结果表明满江红体内的微生态系统比我们原先想象的复杂得多,也再次证明满江红是植物-微生物相互作用研究颇具价值的模式植物。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年11期）
毛海萍,袁开,金仁耀,冯俊丽,戴志远[8]（2019）在《基于传统分离培养和高通量测序分析市售咸鳓鱼中微生物多样性》一文中研究指出以6种浙东地区市售咸鳓鱼为对象,采用分离培养的方法结合16S rDNA V4可变区高通量测序较为全面地探究其中微生物多样性,并且分析分离菌株氨基酸脱羧酶基因及常见抗生素耐药基因携带情况。试验共分离获得151株可培养细菌,16S rDNA测序将其鉴定至14个属和23个种,其中芽孢杆菌数量最多(98株,64.90%);葡萄球菌其次(20株,13.25%);嗜冷杆菌次之(13株,8.61%)。132株分离菌株携带组氨酸脱羧酶基因,占比高达87.42%;鸟氨酸脱羧酶基因和赖氨酸脱羧酶基因的携带比例分别为46.36%和45.03%。耐药基因携带率处于较低水平。高通量测序研究结果表明,门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)是市售咸鳓鱼中主要优势微生物。碱杆菌属(Alkalibacillus)、慢性芽孢杆菌属(Lentibacilus)、狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)、梭菌属(Clostridiaceae)等分别在不同样品中占据较高比例,不同来源样品中微生物多样性呈现出较大的差异。(本文来源于《食品研究与开发》期刊2019年21期）
郭涛,罗文龙,陈淳,王慧,陈志强[9]（2019）在《基于高通量测序的水稻航天诱变频谱分析和突变基因挖掘》一文中研究指出【研究背景】航天诱变技术是种质资源创新的有效途径,但航天诱变的分子机理仍不明确。本研究通过对多个航天诱变水稻突变体进行高通量测序,从全基因组水平解析航天诱变的频谱;结合隐性群体连锁分析和序列变异分析,快速鉴定与突变表型相关的功能基因。【材料与方法】水稻品种航恢173、Francis经航天搭载、γ射线和C离子束辐照后,筛选出34个不同类型突变体。利用高通量测序对34个突变体进行基因组测序和对比分析,解析航天诱变的分子频谱;通过遗传分离群体构建和突变基因功能预测,对2个突变体的突变基因进行挖掘。【结果与分析】(1)基于illumina高通量测序,以检出的碱基突变进行估算,航天诱变突变体的突变频率在10-4至10-5;其他诱变方式获得的31个突变体,突变频率都在10-7至10-8。(2)利用SMRT测序对航天诱变突变体H153、H398和H399进行验证,检出突变的假阳性比率很低(<5%),表明本研究对illumina测序数据采用的突变检测和过滤方法是准确可靠的。(3)航天诱变、γ射线和C离子束辐照诱发的突变都以SNV和小于5 bp的Indel为主,但航天诱变突变体存在较多大于50 bp的结构变异。可视化分析发现,SNV集中地散布在结构变异的周围,从而使这些突变体的局部区域呈现明显的成簇性突变。(4)对航天诱变检出的突变进行效应预测,发现可能导致Highimpact的突变数量和突变数量的之比平均为1.98%。(5)通过对航天诱变突变体H399(白转绿)和H404(颖花异常)受到High impact的基因进行连锁分析,发现两个突变体均为基因功能缺失型(Loss-of-function)突变体,H399的一个C>T SNV引起突变基因转录的提前终止,而H404是由于8bp缺失造成致变基因发生移码突变。【结论】航天诱变的碱基变异频率高于伽马射线及C离子束辐照,并且变异的分布呈现明显的成簇分布,可能与空间环境的极端条件有关;结合连锁分析和碱基突变功能预测,可以快速获得与性状有关的突变基因。(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27）
李斌,胡俊杰,张兰兰,李绍亮,李学思[10]（2019）在《基于高通量测序浓香型和芝麻香型白酒酒曲真菌群落结构的分析》一文中研究指出该研究应用高通量测序(HTS)技术研究浓香型白酒中高温酒曲和芝麻香型白酒高温酒曲的真菌菌群结构,分析酒曲中真菌的种类、相对丰度和功能。结果表明,浓香型白酒中高温酒曲的优势真菌群(相对丰度≥1%)主要有假丝酵母(Candida)、嗜热子囊菌属(Thermoascus)、根毛霉属(Rhizomucor)等。芝麻香型白酒高温酒曲的优势真菌群主要有假丝酵母(Candida)、曲霉属(Aspergillus)、威克汉姆酵母(Wickerhamomyces)等。随着浓香型白酒中高温酒曲贮存时间的延长,假丝酵母(Candida)的相对丰度逐渐增加,其在两种酒曲中都是优势真菌,此属中许多种具有酒精发酵能力。HTS技术为建立浓香型和芝麻香型白酒酒曲微生物信息数据库、优化酒曲的发酵工艺和提升品质提供了理论依据。(本文来源于《中国酿造》期刊2019年10期）
高通量分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:研究6类中药饮片中污染微生物的群落特征,为中药饮片微生物限度标准制定提供依据。方法:参照《中华人民共和国药典》2015年版,对6类中药饮片共60批样品进行耐胆盐革兰阴性菌和沙门菌检查,采用VITEK生化鉴定系统对选择性分离平板上的微生物菌落进行鉴定,并基于16S rRNA高通量测序方法研究中药饮片中污染微生物的群落特征。结果:共有28批样品检出耐胆盐革兰阴性菌,不同类别饮片中耐胆盐革兰阴性菌的检出率差异较大,而沙门菌均未检出;菌株生化鉴定结果表明,6类中药饮片中污染的微生物均属于变形菌门,分布于14个属,其中包含阪崎克罗诺杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、奇异变形杆菌、鲍氏不动杆菌等致病菌或条件致病菌;16S rRNA高通量测序微生物多样性分析结果表明,中药饮片污染微生物主要分布于6个门、27个属,不同类别中药饮片中的优势菌属具有明显差异。结论:16S rRNA高通量测序方法比传统培养法能够获得更加全面的中药饮片中污染微生物群落信息,不同类别中药饮片中污染微生物群落的组成具有一定差异,多种致病菌的检出提示中药饮片污染微生物具有一定的致病风险。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
高通量分析论文参考文献
[1].龙驭云,李孝东,汤欣欣,尹婷,杨舒婷.基于高通量测序技术的稽留流产绒毛遗传学分析[J].中国妇幼保健.2019
[2].李琼琼,范一灵,宋明辉,秦峰,杨美成.基于高通量测序的6类中药饮片污染微生物群落特征分析[J].药物分析杂志.2019
[3].宋伦,吴景,李楠,孙明,杜静.基于高通量测序的真核微藻多样性质控分析[J].水产科学.2019
[4].田佳,吴楠,解诗雨,黄志伟,原尚奇.基于高通量测序的土壤中ermF基因宿主细菌多样性分析[J].天津农业科学.2019
[5].谢丹,刘晓燕,毕远林,宋明发,梁芳芳.基于高通量测序分析刺梨果渣自然发酵过程中细菌群落结构及多样性[J].食品工业科技.2019
[6].王珍妮,龚唯鸣,吴意,唐红.高通量二代测序对感染性新生儿高胆红素血症病原菌的分析[J].中国微生态学杂志.2019
[7].陈坚,郑伟文,郑益平,陈彬,郑斯平.水生植物小叶满江红内生真菌与古菌的发现及基于高通量测序的群落组成分析[J].农业生物技术学报.2019
[8].毛海萍,袁开,金仁耀,冯俊丽,戴志远.基于传统分离培养和高通量测序分析市售咸鳓鱼中微生物多样性[J].食品研究与开发.2019
[9].郭涛,罗文龙,陈淳,王慧,陈志强.基于高通量测序的水稻航天诱变频谱分析和突变基因挖掘[C].2019年中国作物学会学术年会论文摘要集.2019
[10].李斌,胡俊杰,张兰兰,李绍亮,李学思.基于高通量测序浓香型和芝麻香型白酒酒曲真菌群落结构的分析[J].中国酿造.2019
论文知识图
