基于激光光谱分析的RNA二级结构预测

论文摘要

基于副本交换的局部增强差分进化蛋白质结构预测方法,对RNA二级结构进行预测时,信息的筛选不够充分,预测性能差。提出基于激光光谱分析的RNA二级结构预测方法,采用基于激光光谱能量的动态划分算法搜索光谱能量最细微的光谱茎区,通过Hopfield网络算法预测RNA二级结构时,采用贪心算法获取待测RNA光谱茎区池,使用动态规则方法对RNA双光谱序列里光谱能量最细微的RNA光谱茎区和光谱茎区池区间隔进行比照,间隔过长的光谱茎区通过Hopfield神经网络的运算"变短"从而减少干扰,RNA光谱茎区池里的光谱茎区用其预测值进行更正,实现RNA光谱茎区池的改进,再通过贪心算法和Hopfield神经网络基于改进后的RNA光谱茎区池对RNA二级结构进行预测。实验表明,所提方法对RNA二级结果预测性能的最高均值是96. 98%,平均预测时间为6. 2 s,预测性能高。

论文目录

• 1 引言
• 2 基于激光光谱分析的RNA二级结构预测
•   2.1 基于激光光谱能量的RNA动态划分算法
•   2.2 Hopfield网络算法预测RNA二级结构
•     2.2.1 光谱茎区池的改进
•     2.2.2 预测流程
• 3 实验分析
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李熹,杨运煌

关键词: 激光光谱,二级结构,贪心算法,光谱茎区,光谱能量

来源: 激光杂志 2019年06期

年度: 2019

分类: 信息科技,基础科学

专业: 物理学,生物学,无线电电子学

单位: 广西民族大学软件与信息安全学院,中国科学院武汉物理与数学研究所

基金: 广西高校中青年教师基础能力提升项目(No.2017KY0177)

分类号: Q522;TN24

DOI: 10.14016/j.cnki.jgzz.2019.06.032

页码: 32-36

总页数: 5

文件大小: 491K

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