马铃薯StCYP734A1基因克隆、表达模式及生物信息学分析

论文摘要

CYP734As作为失活油菜素内酯（BRs）的关键基因,调节植物生长发育,可未见马铃薯CYP734As基因的相关报道。为探索CYP734As在马铃薯块茎生长发育中发挥的功能,本试验以RT-PCR技术从马铃薯品种‘费乌瑞它’中克隆到StCYP734A1基因全长序列,并对其进行生物信息学分析;利用Real-time PCR技术分析不同组织及块茎不同贮藏时期基因表达模式。结果显示,该序列开放阅读框（ORF）为1 644 bp,编码547个氨基酸,蛋白质相对分子质量约62.07 kD,理论等电点（pI） 9.31,在7～26位氨基酸存在一个跨膜区,亚细胞定位预测主要在线粒体和细胞核,系统进化分析表明与番茄LeCYP734A8亲缘关系最近。荧光定量分析马铃薯StCYP734A1在不同组织和块茎不同贮藏时期基因表达量,根中StCYP734A1表达量最高,其次是茎、叶、花、果实。随着贮藏时间的延长,马铃薯StCYP734A1表达量升高,打破休眠时,该基因表达量显著降低。本试验结果为进一步研究马铃薯StCYP734A1基因的功能提供了依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 提取的RNA质量良好
•   1.2 马铃薯CYP734A1基因的克隆
•   1.3 StCYP734A1理化性质分析
•   1.4 蛋白质结构预测分析
•   1.5 信号肽、跨膜区、亚细胞定位预测
•   1.6 StCYP734A1氨基酸序列多重比对
•   1.7 StCYP734A1蛋白系统进化树分析
•   1.8 StCYP734A1基因组织表达分析
•   1.9 StCYP734A1基因在马铃薯块茎不同贮藏时期的表达分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 实验材料
•   3.2 不同的块茎贮藏时期和组织取样
•   3.3 马铃薯StCYP734A1基因CDS克隆
•   3.4 StCYP734A1蛋白的生物信息学分析
•   3.5 qRT-PCR分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张杰,邓孟胜,蔡诚诚,冉爽,余丽萍,杨翠芹,王西瑶

关键词: 马铃薯,基因克隆,表达分析,生物信息学分析

来源: 分子植物育种 2019年15期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 四川农业大学马铃薯研究与开发中心,四川农业大学作物科学国家级实验教学示范中心

基金: 现代农业产业技术体系四川薯类创新团队项目(川农业函[2014] 91号)资助

分类号: S532;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.004883

页码: 4883-4893

总页数: 11

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