顺式作用元件论文_梁明丽,刘波,张伟

导读:本文包含了顺式作用元件论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:顺式,元件,基因组,转录,作用,维管束,因子。

顺式作用元件论文文献综述

梁明丽,刘波,张伟[1](2019)在《巴斯德毕赤酵母鼠李糖代谢基因LRA3功能及其启动子顺式作用元件的研究》一文中研究指出巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)由于具有遗传操作简单、重组蛋白高效分泌、高密度发酵和翻译后修饰等优点,常被用作表达宿主。其中基于甲醇诱导型强启动子P_(AOX1)的毕赤酵母表达系统是目前应用最广泛的表达系统,但该系统需使用易燃易爆有毒的甲醇作为诱导剂,极大地限制了其在食品酶和医药重组蛋白生产领域的应用,因而,开发无毒物质诱导的表达系统具有重要意义。前期研究预测了毕赤酵母鼠李糖代谢途径相关基因LRA1~LRA4,其中LRA3启动子P_(LRA3)可实现重组蛋白在毕赤酵母中的高效表达,但其在调控重组蛋白表达效果以及转录严谨性方面仍需进一步改进。基于此,通过敲除和回补实验证实了LRA3参与毕赤酵母鼠李糖代谢途径,并采用方便易行的环化RNA反转录PCR(circularized RNA reverse transcription polymerase chain reaction,CRRT-PCR)确定了P_(LRA3)的转录起始位点,预测了与转录密切相关的元件。研究结果为后期启动子的理性改造提供了理论依据。(本文来源于《生物技术进展》期刊2019年05期)

[2](2019)在《科学家完成普通小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定》一文中研究指出7月15日,Genome Biology期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与南京农业大学张文利研究组等合作完成的研究论文。该工作生成并绘制普通小麦精细的表观组图谱,以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定,并初步探索了其作用机制,为小麦基因调控机制解析研究提供了重要资源。广泛种植的六倍体普通小麦具有庞大而复杂的基因组,高质量的普通小麦全基因组序列于(本文来源于《江西饲料》期刊2019年04期)

[3](2019)在《科学家完成普通小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定》一文中研究指出7月15日,Genome Biology期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与南京农业大学张文利研究组等合作完成的研究论文。该工作生成并绘制普通小麦精细的表观组图谱,以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定,并初步探索了其作用机制,为小麦基因调控机制解析研究(本文来源于《中国食品学报》期刊2019年07期)

薛巨坤,王博,王莲萍,杨春雨,国会艳[4](2019)在《一个顺式作用元件的载体构建及与一个MYB转录因子的互作分析》一文中研究指出转录因子通过与下游基因启动子上的顺式作用元件的互作调控目标基因的表达,引起一系列的应答反应,从而增强植物的抗逆能力。在我们前期的研究中,通过酵母单杂交技术发现白桦的BplMYB46转录因子能够与一个核心序列为"TGTCGC"的顺式作用元件结合。在本研究中,"TGTCGC"顺式作用元件的每个碱基分别被突变后构建到表达载体pHIS2中,然后利用酵母单杂交技术与BplMYB46转录因子进行互作分析,结果显示,当"TGTCGC"的核心序列的第二个碱基为G/A、第六个碱基为C/G时,酵母单菌落能在叁缺培养基TDO/3AT上生长,表明与BplMYB46转录因子结合的顺式作用元件的特异性序列为T (G/A) TCG(C/G)。本研究为后续通过BplMYB46转录因子与这个顺式作用元件的结合,来分析BplMYB46转录因子与下游基因的调控以及为筛选优良下游基因改良白桦的遗传性状提供数据基础。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年05期)

王明阳,刘新春,陈虎臣,刘守安[5](2018)在《茶树脂氧合酶CsLOX3基因启动子的克隆及其顺式作用元件的分析》一文中研究指出启动子在调控基因转录中具有重要的作用,为探明茶树茉莉酸及挥发性绿叶气味合成途径关键基因脂氧合酶LOX的表达调控规律,应用染色体步移技术克隆了CsLOX3基因的5'侧翼序列1 050 bp。采用PLACE、PlantCARE在线启动子预测工具等分析表明:该序列包含启动子核心元件如TATA-box、CAAT-box,以及多种类型的激素应答作用元件、生物或非生物胁迫响应相关的元件,以及逆境胁迫相关的转录因子结合元件等。启动子上包含的这些顺式作用元件为深入研究茶树Cs LOX3基因的表达调控提供了参考。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年23期)

段肖肖,余振强,臧丹丹,张丹丹,陈韵如[6](2018)在《ThZFP1蛋白特异性结合的DNA顺式作用元件》一文中研究指出锌指蛋白(ZFP)是一类通过结合锌离子折迭成手指结构域的蛋白,在植物逆境胁迫中起重要作用。Th ZFP1需要结合一定的DNA序列来调控基因的表达,为了确定Th ZFP1结合的元件序列,利用自己开发的TFCentered Y1H技术,鉴定了Th ZFP1蛋白识别的核心序列,分别为DOF和ARR1AT。并进一步在植物体内验证了Th ZFP1蛋白与DOF和ARR1AT元件的互作。结果表明,Th ZFP1蛋白能够特异性地识别DOF和ARR1AT顺式作用元件来调控相关基因的表达。(本文来源于《东北林业大学学报》期刊2018年12期)

及晓宇,李子义,卢惠君,聂显光,王玉成[7](2018)在《刚毛柽柳Thb HLH1转录因子识别的顺式作用元件的鉴定》一文中研究指出[目的]本研究拟对Thb HLH1所识别的顺式作用元件进行鉴定,进一步揭示Thb HLH1调控抗逆基因表达的机理。[方法]利用以转录因子为中心的酵母单杂交系统鉴定Thb HLH1所识别的顺式作用元件;将元件与报告基因融合构建报告载体(p CAM-Cis),通过基因枪法将报告载体与效应载体35S∶Thb HLH1共转化烟草叶片,在盐、干旱胁迫下比较GUS酶活。[结果]鉴定出2段能够与Thb HLH1转录因子结合的DNA序列:分别为CCGAAA(LTRE1)和TGAC(WRKY710S)。[结论]在盐或干旱胁迫下,Thb HLH1通过与LTRE1或WRKY710S元件作用来激活基因表达。(本文来源于《林业科学研究》期刊2018年05期)

曹雄军,卢晓鹏,熊江,李静,谢深喜[8](2018)在《枳NLP转录因子响应干旱胁迫并与NRE顺式作用元件互作》一文中研究指出【目的】探讨枳氮素含量在干旱条件下的变化,以及氮代谢途径枳亚硝酸还原酶基因(NiR)和NLP转录因子的响应表达,分析确定枳NLP转录因子与NiR启动子区域硝酸盐响应顺式作用元件(nitrate-responsive cis-element,NRE)位点绑定互作。【方法】以一年生的砧木枳为试验材料,进行干旱处理直至植株叶片开始萎蔫,并设置对照。利用凯氏定氮仪检测干旱条件下枳叶片和侧根的全氮含量,并同步利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和2-ΔΔCT法分析PtNiR、PtNLP2、PtNLP4、PtNLP7及PtNLP8在枳叶片和侧根的表达情况。通过基因克隆并检索与比对分析,获取PtNiR启动子区域的硝酸盐响应顺式作用元件序列,之后利用同源克隆方法构建用于酵母单杂交的pHIS2-4×NRE和p GADT7-Rec-NLP载体,将构建的pHIS2-4×NRE和p GADT7-Rec-NLP载体质粒共同转化到酵母菌株Y187中,在氨基酸缺失培养基(SD/-Trp/-Leu,以及SD/-His/-Trp/-Leu/+120 mmol·L~(-1) 3-氨基叁唑)上30℃恒温培养3—5 d,观察酵母的生长情况,以确定枳NLP转录因子(PtNLP2、PtNLP4、PtNLP7及PtNLP8)与NRE的互作关系。【结果】受干旱的影响,枳叶片全氮含量表现出先升高再下降的趋势,而侧根中全氮含量则显着下降;在对照中,枳叶片和侧根全氮含量均显着上升。RT-qPCR分析表明,PtNiR的表达水平在叶片中先上调然后再显着下调,而在侧根中则随着干旱程度的增加显着下调;PtNLP2、PtNLP4及PtNLP7在枳叶片和侧根中的表达也均呈现不同程度的先上调然后再受到抑制的规律,而PtNLP8在枳叶片和侧根中的表达则在一定程度上受到干旱抑制。通过克隆测序分析,在枳NiR启动子区域-196至-154的位置发现了疑似NRE。酵母单杂交分析表明,转化pHIS2-4×NRE-HIS3载体和p GADT7-Rec-NLP载体的Y187酵母在对照培养基(-Trp/-Leu)和含有120 mmol·L~(-1) 3-氨基叁唑的叁缺培养基(-His/-Trp/-Leu)上均能正常生长。【结论】枳侧根中的全氮含量受干旱的影响而显着下降,以对照为参比,枳侧根和叶片中的全氮含量均随着干旱时间的延长而相对减少。氮代谢途径的枳NiR和NLP转录因子在叶片和侧根中的表达对干旱有不同程度的响应。PtNLP2、PtNLP4、PtNLP7及PtNLP8转录因子均能与PtNiR启动子中的硝酸盐响应顺式作用元件(NRE)位点绑定互作,从而激活下游基因的表达。(本文来源于《中国农业科学》期刊2018年17期)

谭艳平,叶莲,何福收,褚巍,邵敏敏[9](2018)在《烟草维管束发育相关基因Nvas启动子顺式作用元件鉴定》一文中研究指出为研究烟草维管束发育相关基因Nvas启动子顺式作用元件,将克隆得到的Nvas启动子ATG+1~-463区域分为10个不同长度的片段与GFP报告基因融合构建了植物表达载体并完成了5'端缺失分析.利用根癌农杆菌介导转化W38型烟草叶盘,得到了含有不同长度Nvas启动子片段的转基因烟草植株.体视显微镜下观察到含Nvas启动子-216~-463区域的转基因烟草均有绿色荧光蛋白的表达,表达部位集中在维管束组织.结果表明Nvas启动子能使外源基因在维管束组织中特异表达.该启动子活性高于Ca MV35S,在ATG+1~-216区域存在核心启动子元件,在-337~-379区域存在能增强启动子活性的元件.(本文来源于《中南民族大学学报(自然科学版)》期刊2018年02期)

叶莲[10](2018)在《烟草维管束发育相关基因sm-Nvas启动子顺式作用元件的鉴定》一文中研究指出启动子是基因工程中的一把关键的钥匙,它能够决定外源基因的转录方式,选择合适的启动子调控不同外源基因的表达在生物学研究中具有重要作用。组织特异性启动子能驱动外源基因在特定的部位高效表达,同时还能避免组成型启动子带来的营养浪费等缺陷。发掘合适高效的组织特异型启动子及其顺式作用元件的解析是启动子研究工作中的重点。前期本实验室从W38型烟草中克隆得到了sm-Nvas启动子区域的序列,生物信息学分析及转基因实验证实该启动子与维管束发育相关。本研究旨在分析sm-Nvas启动子的驱动活性,鉴定sm-Nvas启动子的顺式作用元件,发掘新的组织特异型高效启动子。本研究取得的结果主要有:(1)对sm-Nvas启动子进行5’端缺失分析,以起始密码ATG中的A为+1位点,将sm-Nvas启动子-799区域分为20个长度不同的5’端缺失片段,并替换p CAMBIA1301、p CAMBIA1302的35S启动子与报告基因融合,共构建20个5’端缺失片段-GUS重组载体和20个5’端缺失片段-GFP重组载体。通过农杆菌介导法分别将这40个重组载体遗传转化至W38型烟草中,得到阳性转基因烟草植株。(2)完成GUS组织化学染色及GFP荧光观察,结果进一步证实sm-Nvas启动子属于组织特异型启动子。所有得到的转基因植株均能检测到报告基因的表达,sm-Nvas启动子-216区域足以驱动外源基因在维管束组织中表达,-216区域内存在启动子核心元件和维管束组织特异表达元件。(3)报告基因表达量结果显示sm-Nvas启动子驱动活性远高于35S启动子,是一个维管束组织特异型强启动子。-402~-640区域表达量显着增高,且-640区域驱动活性最高,表明-402~-337区域存在一个能上调启动子活性的元件。-680~-640区域存在一个能下调启动子活性的元件,与上调启动子活性的元件相互拮抗。(本文来源于《中南民族大学》期刊2018-05-23)

顺式作用元件论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

7月15日,Genome Biology期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与南京农业大学张文利研究组等合作完成的研究论文。该工作生成并绘制普通小麦精细的表观组图谱,以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定,并初步探索了其作用机制,为小麦基因调控机制解析研究提供了重要资源。广泛种植的六倍体普通小麦具有庞大而复杂的基因组,高质量的普通小麦全基因组序列于

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

顺式作用元件论文参考文献

[1].梁明丽,刘波,张伟.巴斯德毕赤酵母鼠李糖代谢基因LRA3功能及其启动子顺式作用元件的研究[J].生物技术进展.2019

[2]..科学家完成普通小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定[J].江西饲料.2019

[3]..科学家完成普通小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定[J].中国食品学报.2019

[4].薛巨坤,王博,王莲萍,杨春雨,国会艳.一个顺式作用元件的载体构建及与一个MYB转录因子的互作分析[J].分子植物育种.2019

[5].王明阳,刘新春,陈虎臣,刘守安.茶树脂氧合酶CsLOX3基因启动子的克隆及其顺式作用元件的分析[J].分子植物育种.2018

[6].段肖肖,余振强,臧丹丹,张丹丹,陈韵如.ThZFP1蛋白特异性结合的DNA顺式作用元件[J].东北林业大学学报.2018

[7].及晓宇,李子义,卢惠君,聂显光,王玉成.刚毛柽柳ThbHLH1转录因子识别的顺式作用元件的鉴定[J].林业科学研究.2018

[8].曹雄军,卢晓鹏,熊江,李静,谢深喜.枳NLP转录因子响应干旱胁迫并与NRE顺式作用元件互作[J].中国农业科学.2018

[9].谭艳平,叶莲,何福收,褚巍,邵敏敏.烟草维管束发育相关基因Nvas启动子顺式作用元件鉴定[J].中南民族大学学报(自然科学版).2018

[10].叶莲.烟草维管束发育相关基因sm-Nvas启动子顺式作用元件的鉴定[D].中南民族大学.2018

论文知识图

蛋白与DRE探针结合的EMSA分析蛋白与DRE和mDRE探针结合的EMS...一Basic载体图谱"通过不同机制调控GATA1转录活性基因5’侧翼序列串联重复序列预...传统EMSA原理示意图(引自拉奇曼等,...

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