盖塔病毒论文-江朝源,李飞,曾喻兵,彭珂楠,张儒博

盖塔病毒论文-江朝源,李飞,曾喻兵,彭珂楠,张儒博

导读:本文包含了盖塔病毒论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:猪,盖塔病毒,分离鉴定,序列分析

盖塔病毒论文文献综述

江朝源,李飞,曾喻兵,彭珂楠,张儒博[1](2019)在《四川省猪源盖塔病毒的分离鉴定及遗传进化分析》一文中研究指出目的对检测到的疑似盖塔病毒进行分离鉴定和全基因序列遗传进化分析。方法从四川某猪场1例混合感染猪繁殖与呼吸综合征的仔猪血液中,进行RT-RCR检测,检测到GETV阳性。对样品进行无菌处理后,接种至BHK21细胞,连续传代培养,通过细胞病变、蚀斑纯化、RT-RCR扩增和全基因序列测定鉴定细胞培养物。结果我们成功分离到四川首株猪盖塔病毒,并将其命名为SC201807;对该病毒全基因扩增测序并进行序列分析,发现SC201807与GenBank中上传的35株GETV序列相似性为99.0%~96.1%,E2序列高度保守仅在E310(天冬氨酸→谷氨酸)发生突变。全基因组核苷酸以及E2氨基酸序列遗传进化分析显示SC201807株与中国猪源HNJZ-S2及日本蚊源15-I-752、15-I-1105、14-I-605-C2、14-I-605-C1、12IH26亲缘关系最近,处于同一进化分支。结论 SC201807株扩充了猪源GETV的感染谱,对其致病性、感染和传播机制、环境微生物学及公共卫生等相关研究提供素材。(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2019年09期)

刘帅,加帕尔·哈斯木,薛新梅,丁梦玥,马晓菁[2](2017)在《新疆库蠓源性盖塔病毒的分离与鉴定》一文中研究指出为了解新疆尉犁县库蠓体内携带病毒情况,从该县采集18 000只库蠓,50只为一组研磨后分别接种于BHK-21、C6/36、Vero细胞,盲传5代,一组样品使BHK-21出现CPE,先用5-氟尿核苷药敏试验鉴定为RNA病毒,之后用虫媒RNA病毒引物扩增,鉴定为甲病毒,疑似盖塔病毒,最后用中和试验、免疫电镜观察和盖塔病毒C基因特异性引物PCR等方法鉴定分离毒株为盖塔病毒。本研究首次从新疆库蠓体内分离到盖塔病毒,该毒株与2005年日本分离株相似性高达98%,推测可能是由于引进日本带病种公畜或精液有关,提示在进出口畜牧贸易活动中,应加强盖塔病毒的检疫工作。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2017年10期)

李元元[3](2017)在《盖塔病毒分子特征及其感染的相关研究》一文中研究指出目的:测定新分离病毒株(YN12031,YN12042)的全基因组序列,验证其是否为盖塔病毒(Getah virus,GETV),研究新分离病毒株(YN12031)的生物学表型和分子遗传学特征;构建盖塔病毒基因序列分析数据集,对盖塔病毒的种群特征和时空动力学进行分析;最后分析盖塔病毒在中国大陆的感染情况。方法:第一部分将新分离的病毒株(YN12031)接种在BHK-21细胞上观察细胞病变效应(CPE),并在透射电子显微镜下鉴定该病毒的形态,用噬斑测定法检测病毒增殖的动态变化。设计用于扩增和测定全基因组序列的引物,使用PCR方法进行基因序列扩增。使用DNASTAR软件包中的Seqman软件对测序结果进行拼接和质量分析,使用Clustal X 1.8软件进行序列比对,使用MEGA 6.0进行系统发育和分子进化分析。第二部分在基因库中下载盖塔病毒序列,结合新分离的盖塔病毒(YN12031,YN12042病毒株)基因序列,以及15株本实验室此前在中国分离和鉴定、但未在Gen Bank登录的盖塔病毒毒株基因序列信息,用生物信息学方法构建GETV序列分析数据集。采用蒙特卡洛马尔科夫链(MCMC)统计算法分析盖塔病毒数据集。利用BEAET软件包进行碱基替换速率、最近共同祖先(Time of most recent Ancestor,t MRCA)以及种群动态分析(Beast skyride plot,BSP);采用BEAST v 1.8.1软件包里的Bayesian Stochastic Search Variable Selection(BSSVS)程序进行盖塔病毒的空间动力学研究;使用VMD软件和YASARA软件分析GETV E2蛋白的结构。第叁部分利用空斑减少中和实验的方法检测人和多种动物(鸡、鸭、牛、猪、马)血清标本盖塔病毒中和抗体水平。结果:第一部分YN12031病毒株感染BHK-21细胞32小时出现明显的细胞病变。病毒粒子呈圆形,直径70nm左右,有包膜,表面有纤突。分子遗传分析显示,YN12031病毒与甲病毒属病毒如基孔肯雅病毒,辛德毕斯病毒密切相关,并与GETV原型株MM2021处于同一进化分枝中,盖塔病毒E2基因和Capsid基因序列的系统进化分析进一步显示,YN12031病毒与俄罗斯分离盖塔病毒处于同一进化分枝,此外盖塔病毒编码区基因及E2基因同源性分析显示,YN12031病毒与俄罗斯分离盖塔病毒同源性关系最近。第二部分盖塔病毒E2基因的氨基酸差异分析显示,与1955年马来西亚原始株(MM2021)相比,其他盖塔病毒分离株均存在7个共同的氨基酸差异位点,这7个共同位点的突变,导致GETV流行株与原始毒株在结构和电荷分布有差异。盖塔病毒最早出现在距今约145年前,随后逐渐演化出四个明显的进化种群,Group III进化种群是目前国际上在多种蚊虫和宿主动物中流行的,并能引起动物疾病的优势病毒进化种群。盖塔病毒种群进化动态分析显示,盖塔病毒种群动态经过平缓—增长—下降—平缓的种群变化过程。盖塔病毒的播散存在频繁的迁徙事件,马来西亚、日本和云南是盖塔病毒的重要迁徙源泉地区,迁徙事件也是盖塔病毒重要的分布分化机制。第叁部分共检测了中国大陆895份人、畜动物血清标本,其中发热患者血清中GETV中和抗体阳性率为8.4%(37/443);禽类动物GETV中和抗体阳性率明显低于猪、马;同样为牛(cattle),奶牛和菜牛对GETV中和抗体阳性率存在巨大差异。发热患者血清标本GETV中和抗体水平从1:10至1:320不等;鸡、鸭和奶牛血清标本中仅可以检测到低滴度(1:10至1:20)盖塔病毒中和抗体;而绝大多数猪、马、菜牛血清标本可以检测到1:640至大于1:2560滴度的盖塔病毒中和抗体。结论:1测定了新分离病毒株YN12031,YN12042的全基因组序列,并证实了病毒株为GETV;生物学表型显示:GETV(YN12031分离株)可引起明显的细胞病变,病毒粒子呈圆形,直径70nm左右,有包膜,表面有纤突;分子遗传分析显示:YN12031病毒与俄罗斯分离盖塔病毒同源性关系最近。2成功构建了GETV序列分析数据集,生物信息学分析显示:GETV流行株和原始株之间存在结构和电荷的变化;GETV最早出现在距今约145年前,随后逐渐演化出四个明显的进化种群,Group III进化种群是主要的优势病毒进化种群;GETV种群动态经过平缓—增长—下降—平缓的种群变化过程;马来西亚、日本和云南是盖塔病毒的重要迁徙源泉地区。3中国大陆人和多种动物血清标本中存在盖塔病毒中和抗体,并且马、猪和菜牛盖塔病毒中和抗体水平显着高于人和其它动物,提示中国大陆人、畜动物存在盖塔病毒的感染,猪、马和菜牛很可能是GETV的扩增宿主。(本文来源于《山西医科大学》期刊2017-06-07)

李元元,刘红,李晓龙,付士红,高晓艳[4](2017)在《盖塔病毒分子进化及其迁徙》一文中研究指出目的了解世界各地分离盖塔病毒分子进化特征及其时空迁徙。方法用Clustal X1.83、MegaAlign和Gene DOC软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用MEGA 6.0软件绘制系统发生树,采用BEAST v 1.8.1软件包里的Bayesian Stochastic Search Variable Selection(BSSVS)程序进行盖塔病毒的空间动力学分析。结果盖塔病毒E2基因全长均为1 266nt,编码422aa,其核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5%~100%和96.4%~100%。病毒分子进化分析发现,盖塔病毒不存在蚊虫,马匹和猪等宿主动物和媒介的种属和地域分布差异。生物信息学分析结果显示,盖塔病毒起源于马来西亚,此后依次传播至日本、中国、韩国以及蒙古国和俄罗斯等地。结论自1955年首次分离盖塔病毒至2014年间分离的盖塔病毒E2基因序列较为稳定,未发现病毒基因组之间存在种属及地域分布差异,并且该病毒已经从热带地区传播到欧亚大陆多个国家和地区,因此加强盖塔病毒及人畜动物感染的检测和监测至关重要。(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2017年04期)

冯云,李胜国,张海林,付士红,康显虎[5](2014)在《云南腾冲县新分离乙型脑炎和盖塔病毒的分子生物学特征》一文中研究指出目的分析云南省腾冲县新分离流行性乙型脑炎病毒(JEV)和盖塔病毒(GETV)的分子生物学特征。方法2007年7月在中缅边境地区腾冲县采集蚊虫标本,用BHK-21和C6/36细胞分离病毒,阳性分离物用RT-PCR方法进行鉴定,用相关生物学软件进行分子生物学特征分析。结果从腾冲县采集的4属25种26 702只蚊虫中分离到20株JEV,1株GETV。系统进化分析表明,新分离20株JEV均属于基因Ⅰ型,与邻近省份和东南亚流行株亲缘关系较近;PreM和E基因核苷酸同源性和氨基酸位点分析表明,这20株JEV之间及其与国内外流行株间均存在一定差异,但它们的抗原和毒力位点未发生明显改变。本次分离的GETV的Capsid基因和E2基因与其他国内外分离株的同源性较高。结论首次证实云南省西部地区存在基因Ⅰ型JEV和GETV流行,这些流行株具有较为稳定的遗传特征和地域特征。(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2014年04期)

孙洁,张海林[6](2012)在《盖塔病毒研究状况》一文中研究指出盖塔病毒(Getah virus,简称GETV)在分类上属于披膜病毒科甲病毒属成员,能在各种脊椎动物和节肢动物体内增殖[1]。已证实该病毒可引起家畜的疾病,人群中也存在该病毒感染。根据血清动物流行病学研究,GETV在欧亚大陆至东南亚,远到东亚,太平洋岛屿和澳大利亚等地区都有分布[2]。(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2012年01期)

周晓芳,冯子良,胡挺松,邱薇,范泉水[7](2012)在《云南白纹伊蚊盖塔病毒的分离鉴定》一文中研究指出目的:对我国云南省边境线获得的未知病毒进行分离鉴定。方法:将样本进行随机聚合酶链式反应,纯化链接到载体中进行序列的测定,确定病毒为甲病毒属类盖他病毒,然后用特异性引物进行衣壳蛋白基因和3'UTR区序列进行DNA测序,分析比较该病毒的分子生物学遗传特征,绘制系统发育树。结果:该病毒为盖塔病毒。结论:该病毒与韩国分离株和河北两株亲缘关系较近,而与MM2021马来西亚原始毒株亲缘关系较远。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2012年01期)

张雨,司炳银,常国辉,刘伯华,杨银辉[8](2011)在《WJBC株盖塔病毒基因组序列测定及与其他甲病毒的系统进化关系》一文中研究指出目的对WJBC株盖塔病毒(GETV)进行基因组序列测定,阐明其与已报道的GETV及其他甲病毒的关系。方法将GETV基因组编码区分12段分别进行RT-PCR扩增,将扩增产物直接进行测序,非编码区采用RACE法进行扩增,扩增产物纯化后连入pGEM-T easy载体,经转化DH5α感受态细胞,挑取阳性克隆鉴定后测序,应用DNAStar软件将测序结果拼接获得基因组序列。结果与结论 GETV基因组核苷酸共11 696 nt,编码3721个氨基酸,非结构基因编码2468个氨基酸,结构基因编码1253个氨基酸,结构基因和非结构基因之间有44 nt的连接区为非翻译区。病毒基因组5'端和3'端分别有78、411 nt的非编码区。序列同源性分析结果表明,此株病毒与M1株盖塔病毒同源性最高,两者核苷酸序列同源性为99.8%,氨基酸序列同源性为99.2%。(本文来源于《军事医学》期刊2011年12期)

梁勇[9](2011)在《我国盖塔病毒研究概况与进展》一文中研究指出我国在1964-2006年共分离到10株盖塔病毒(GETV),它们分别是M1、HB0215-3、HB0234、SH05-6、SH05-15、SH05-16、SH05-17、YN0540、YN0542和GS10-2株。现就我国的这10株GETV分离、鉴定、分布和分子生物学研究结果,以及与国外GETV代表株和鹭山病毒等分子生物学比较结果进行综述。(本文来源于《中国媒介生物学及控制杂志》期刊2011年03期)

梁勇,张连山,刘永为,董运强,王峻巍[10](2010)在《涉县人群盖塔病毒感染状况研究》一文中研究指出目的了解涉县夏季正常人群和发烧样病人中盖塔病毒感染状况。方法采用抗体捕捉ELISA方法检测盖塔病毒IgM抗体和间接ELISA方法检测IgG抗体。结果正常人群IgM抗体阳性率为0.30%(1/300);IgG抗体阳性率为16.30%(49/300)。发烧样病人盖塔病毒IgM抗体阳性率0.63%(2/317)。结论正常人群对盖塔病毒易感,感染率较高,为16.67%;夏季发烧样病人中也存在盖塔病毒感染,但感染率比例很低。这具有重要的流行病学意义。(本文来源于《医学动物防制》期刊2010年12期)

盖塔病毒论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为了解新疆尉犁县库蠓体内携带病毒情况,从该县采集18 000只库蠓,50只为一组研磨后分别接种于BHK-21、C6/36、Vero细胞,盲传5代,一组样品使BHK-21出现CPE,先用5-氟尿核苷药敏试验鉴定为RNA病毒,之后用虫媒RNA病毒引物扩增,鉴定为甲病毒,疑似盖塔病毒,最后用中和试验、免疫电镜观察和盖塔病毒C基因特异性引物PCR等方法鉴定分离毒株为盖塔病毒。本研究首次从新疆库蠓体内分离到盖塔病毒,该毒株与2005年日本分离株相似性高达98%,推测可能是由于引进日本带病种公畜或精液有关,提示在进出口畜牧贸易活动中,应加强盖塔病毒的检疫工作。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

盖塔病毒论文参考文献

[1].江朝源,李飞,曾喻兵,彭珂楠,张儒博.四川省猪源盖塔病毒的分离鉴定及遗传进化分析[J].中国人兽共患病学报.2019

[2].刘帅,加帕尔·哈斯木,薛新梅,丁梦玥,马晓菁.新疆库蠓源性盖塔病毒的分离与鉴定[J].畜牧兽医学报.2017

[3].李元元.盖塔病毒分子特征及其感染的相关研究[D].山西医科大学.2017

[4].李元元,刘红,李晓龙,付士红,高晓艳.盖塔病毒分子进化及其迁徙[J].中国人兽共患病学报.2017

[5].冯云,李胜国,张海林,付士红,康显虎.云南腾冲县新分离乙型脑炎和盖塔病毒的分子生物学特征[J].中国人兽共患病学报.2014

[6].孙洁,张海林.盖塔病毒研究状况[J].中国人兽共患病学报.2012

[7].周晓芳,冯子良,胡挺松,邱薇,范泉水.云南白纹伊蚊盖塔病毒的分离鉴定[J].中国卫生检验杂志.2012

[8].张雨,司炳银,常国辉,刘伯华,杨银辉.WJBC株盖塔病毒基因组序列测定及与其他甲病毒的系统进化关系[J].军事医学.2011

[9].梁勇.我国盖塔病毒研究概况与进展[J].中国媒介生物学及控制杂志.2011

[10].梁勇,张连山,刘永为,董运强,王峻巍.涉县人群盖塔病毒感染状况研究[J].医学动物防制.2010

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