导读:本文包含了置换系论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:染色体,水稻,抽穗期,性状,片段,苗期,小麦。
置换系论文文献综述
杨思晴,胡鑫,王中秋,缪娜娜,胡乐佳[1]（2019）在《普通小麦-野生二粒小麦4AL染色体臂置换系抽穗期基因遗传定位》一文中研究指出【研究背景】小麦抽穗期主要受环境与基因的双重影响,已知调控小麦抽穗期的基因主要有叁大类,分别为光周期基因(Ppd)、春化基因(Vrn)和自身早熟性基因(Eps)。目前已定位到许多与抽穗期相关的QTL,并克隆到一些调控抽穗期的关键基因。尽管如此,对于调控抽穗期的分子基础了解的仍很有限,需要进行进一步的研究。本实验室前期的研究表明,在普通小麦-野生二粒小麦染色体臂置换系中,正常秋播条件下CASL4AL比CS迟熟18-20天。【材料与方法】以迟熟材料CASL4AL及中国春(CS)为亲本材料,构建杂交分离群体,对其后代进行BSR_seq试验,开发分子标记,进行QTL的精细定位。并对亲本CASL4AL进行重测序,鉴定小麦染色体片段置换系材料的染色体组成。【结果与分析】通过BSR试验,得到2个共定位区间,分别为4A染色体588931944 bp-665864699 bp和2B染色体44274361 bp-44352759 bp。在此区间设计引物扫描群体,用QTL IciMapping V4.0软件对SSR标记进行连锁分析,构建遗传连锁图谱,并利用完备区间作图法对抽穗期进行QTL分析。在4A染色体638-685Mb处定位到一个LOD值为5的QTL;在4A染色体的691-692Mb处定位到一个LOD值为10的QTL。在2B染色体的短臂55Mb到59Mb处定位到一个LOD为52的QTL。分析转录组和重测序数据可知,CASL4AL的SNP分布比较复杂,除集中在4A的40-745 Mb, 7B的0-570Mb以及5B的410-675Mb外,还在1A、2A、3A、7A、2B、2D、5D、6D、7D染色体上成簇分布,表明该材料除在预期的染色体4A上保留TTD140的大片段外,还在其它其他染色体上可能残留许多TTD140小片段,这有可能是DNA突变造成的。【结论】CASL4AL的抽穗期可能既受到4A染色体上抽穗期基因的影响,在2B染色体上也存在着抽穗期基因影响着该置换系的抽穗期。CASL4AL染色体片段置换系材料除了在置换臂有较高的TTD140大片段,在其他染色体上也存在着TTD140小片段。(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27）
缪娜娜,丁明全,杨思晴,戎均康[2]（2019）在《转录组测序技术在鉴定小麦染色体臂置换系染色体组成上的应用》一文中研究指出为给染色体片段置换系的快速鉴定提供新的技术手段,用3个以普通小麦品种中国春(Chinese Spring,CS)为背景的野生二粒小麦(TTD140)染色体臂置换系(chromosome arm substitution line,CASL)进行转录组测序,并结合SNP分析,获得纯合的SNP,用于鉴定CASL材料中TTD140的置换区段。结果发现,CASL3AL的SNP主要分布在染色体3A的108～750 Mb区段;CASL7BS的SNP分布于染色体7B的0～536 Mb和5A的22～482 Mb区段;CASL4AL的SNP分布比较复杂,除集中在4A的40～745 Mb、7B的0～570 Mb以及5B的410～675 Mb外,还在1A、2A、3A、7A、2B、2D、5D、6D和7D染色体上成簇分布,表明该材料除在预期的染色体4A上保留TTD140的大片段外,还在其他染色体上残留许多TTD140小片段。通过97对多态性SSR标记验证CASL3AL的染色体组成,发现84对标记能检测到TTD带型,其分布范围与转录组数据鉴定结果基本一致。对SNP富集区域的320 bp PCR产物直接测序,发现CASL3AL与CS之间存在7个SNP位点,但与TTD140以及Zavitan参考序列一致。因此,本研究利用转录组测序技术能够有效鉴定小麦染色体片段置换系材料的染色体组成,且比传统的分子标记技术准确、方便、快捷。(本文来源于《麦类作物学报》期刊2019年10期）
王中秋,吴雅露,汤孟玲,方春,缪娜娜[3]（2019）在《不同环境温度下普通小麦-野生二粒小麦染色体臂置换系的农艺性状差异分析》一文中研究指出以普通小麦品种中国春(chinese spring,简称CS)为遗传背景的野生二粒小麦染色体臂置换系(chromosome arm substitution lines,简称CASLs)为材料,在小麦全生育期内利用大棚模拟气温升高,以大田栽培环境为对照,研究温度升高对不同置换系穗部和籽粒性状形成的影响。结果表明:在2个生长环境对比下,各置换系材料的性状均有不同变化,材料间存在着显着的差异。各置换系的籽粒性状对温度的敏感性不同,粒长和千粒质量受大棚环境的影响较大,以2BS和4AL置换系的千粒质量增幅最大,分别为23.9%、30.6%;对于穗部性状,各置换系穗长和小穗数受温度的影响变化较大,所以小穗密度也呈现出较大的变化幅度,其中2BS置换系的增幅最大,高达42.5%,1AL置换系次之,为15.0%。因此可见不同置换系材料的籽粒和穗部性状对不同环境温度的敏感性不同。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年10期）
许睿[4]（2019）在《基于染色体置换系的普通野生稻（O.rufipogon Griff.）耐盐性QTL定位》一文中研究指出普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)是栽培稻改良的一级资源库,发掘其在驯化过程中丢失的优异等位基因,将为水稻育种提供重要的基因资源。本研究对普通野生稻和栽培稻(93-11)构建的染色体片段置换系(CSSL)进行耐盐鉴定,利用重测序与分子标记检测进行关联分析,定位耐盐QTL,发掘新的耐盐种质资源。获得以下结果:1.染色体置换系和分子标记筛选:通过对214个野生稻CSSL进行简化基因组测序获得13022个SNP位点,评估CSSL间的差异程度(IBS)。根据CSSL与亲本93-11(0.8<IBS<1)和各CSSL之间(IBS<1)的差异度,筛选出200个具有大小适中置换片段的CSSL,用于后续研究。同时,根据野生稻和栽培稻之间丰富的遗传变异,筛选出2880个覆盖所有染色体且随机分布的遗传标记,包括2722个SNP、98个SSR和60个InDel,将其用于CSSL的QTL定位。2.芽期耐盐鉴定及QTL定位:使用1.3%NaCl溶液对200个CSSL进行芽期盐胁迫处理,与对照相比CSSL群体发芽率降低了25.77%-100%。通过2880个分子标记的连锁分析共定位到4个与芽期耐盐相关的QTL位点,分别位于4、7、11号染色体,贡献率为4.59%-12.45%。其中,CSSL72在盐处理下其发芽率高达74.23%,包含3个芽期耐盐QTL(qGR7.1、qGR11.1、qGR11.2)。3.苗期耐盐鉴定及QTL定位:使用0.7%NaCl溶液对CSSL群体进行苗期盐胁迫处理,结合苗期耐盐评价指标,共定位到18个QTL,包括7个苗期存活天数相关QTL,5个苗期存活率相关QTL,4个地下部干重相关QTL以及3个苗期耐盐等级相关QTL。其中苗期存活率相关QTL qSSR5.1、苗期耐盐等级相关QTL qSSG5.1均被定位于S5_27886769,该位点对苗期存活率、苗期耐盐等级均具有增效作用,贡献率分别为6.36%、8.13%。在此QTL候选基因内OsDi19-1与非生物胁迫相关。经序列比对发现,OsDi19-1启动子区域在两亲本间存在较大差异,且植物受到盐胁迫时该基因表达量上升。CSSL23、CSSL153在盐处理下其苗期存活率仍能保持在80%以上,存活天数显着高于其他株系。结合耐盐生理数据发现CSSL23、CSSL153通过减少K~+流失,增加体内POD、SOD两种过氧化物酶含量,以提高苗期耐盐性。4.全生育期耐盐鉴定及QTL定位:在山东东营盐碱地中对CSSL群体进行全生育期耐盐性检测,根据CSSL群体存活率,定位到5个与全生育期存活率相关位点,分别是qWSR1.1、qWSR2.1、qWSR5.1、qWSR7.1和qWSR10.1。本研究通过对200个染色体置换系不同生育期的耐盐性鉴定,共发掘4个与芽期耐盐相关的QTL,18个与苗期耐盐性相关的QTL,以及5个与全生育期耐盐性相关的QTL,但不同时期耐盐性QTL位点均不相同。同时,鉴定出水稻芽期耐盐的优异种质资源CSSL72、苗期耐盐的优异种质资源CSSL23、CSSL153,为水稻育种中耐盐性的改良提供了新的种质资源。(本文来源于《中国农业科学院》期刊2019-04-01）
丁膺宾,张莉珍,许睿,王艳艳,郑晓明[5]（2018）在《基于染色体片段置换系的野生稻粒长QTL——qGL12的精细定位》一文中研究指出【目的】利用野生稻染色体片段置换系以及次级群体,精细定位与水稻粒长相关的QTL,发掘野生稻中影响粒长的新基因,为水稻育种提供遗传材料和基因资源。【方法】利用中国农业科学院作物科学研究所野生稻实验室已构建的野生稻染色体片段置换系群体,定位到一个与粒长相关的QTL——qGL12。在此基础上,选择粒长与受体亲本9311差异显着,且携带qGL12片段的置换系CSSL141与9311回交构建次级分离群体,设计区间内分子标记引物,筛选交换单株,结合粒型表型分析与基因型鉴定,对qGL12进行精细定位。通过扫描电子显微镜检测颖壳细胞,观察细胞的长宽变化,对定位区间内的基因进行基因注释以及测序分析,预测候选基因。【结果】根据整套置换系多个环境下的表型鉴定,qGL12初定位于第12染色体标记RM28621附近;选取携带qGL12的置换系CSSL141作为精细定位的亲本,CSSL141携带4个野生稻导入片段,在多年多点的田间试验中,CSSL141粒长、粒宽、粒重均明显高于9311;利用构建的CSSL141/9311 F2群体将qGL12定位于第12染色体标记RM5479与RM28621之间,影响粒长、粒宽以及粒重,对粒长的贡献率最高,为44.61%。在定位区间内设计了7个多态性分子标记引物,选择目标区间基因型杂合的植株种植F3,通过筛选交换单株,结合交换单株的基因型与表型,将qGL12定位于RM5479与RM28586之间50 kb区间内,为进一步缩短定位区间,在此区间内设计了4个多态性分子标记引物,选择交换单株种植下一代,筛选后得到20株交换单株,结合交换单株基因型与籽粒表型,最终将qGL12定位到第12染色体15.69 kb区间,该区间内有3个候选基因,其中Os12g39650编码一种微管蛋白,Os12g39660编码一种质膜钙转运ATP酶,Os12g39670尚未有明确功能,通过测序分析发现,Os12g39650、Os12g39660在编码区内存在变异;对亲本以及后代交换单株的颖壳细胞进行电镜扫描,发现9311颖壳细胞的长度与宽度均比CSSL141小,CSSL141/9311 F4代群体中,目标区间为野生稻基因型的交换单株颖壳细胞的长度与宽度均比目标区间为9311基因型的交换单株大,表明qGL12通过调控颖壳细胞的大小影响水稻粒长。【结论】利用野生稻染色体片段置换系,将野生稻粒长QTL——qGL12定位于第12染色体15.69 kb区间内,通过调控水稻颖壳细胞的大小影响粒长。该区间内有3个基因。来自野生稻的Os12g39650与Os12g39660与栽培稻等位基因相比,存在自然变异,确定为qGL12的候选基因。(本文来源于《中国农业科学》期刊2018年18期）
李静,孙妍,齐兰,苏龙,丁膺宾[6]（2018）在《基于染色体置换系的野生稻抽穗期及紫色性状QTL的鉴定》一文中研究指出利用一套以9311为背景的普通野生稻染色体片段置换系群体为研究材料,进行野生稻相关QTL的定位与基因的鉴定。在多年多点的抽穗期调查数据基础上,结合200多个分子标记引物的基因型鉴定结果,定位到11个与抽穗期相关的QTL;选取携带相关QTL导入片段的两个置换系进一步研究,发现2个抽穗期主效QTL均为已克隆基因的等位基因。利用叶鞘、稃尖、柱头颜色与9311差异显着的一个单片段置换系定位到来自野生稻的紫色性状基因Or C,初步鉴定与栽培稻的等位基因功能不同。这些结果再次表明染色体片段置换系是行之有效的QTL定位以及基因发掘的遗传群体。通过对抽穗期、紫色性状相关QTL的定位与基因的鉴定,为进一步的功能研究提供了基因资源。(本文来源于《植物遗传资源学报》期刊2018年03期）
孙妍,苏龙,乔卫华,郑晓明,齐兰[7]（2018）在《基于染色体片段置换系的野生稻粒宽QTL-qGW8.1的精细定位》一文中研究指出利用以栽培稻9311为受体、普通野生稻为供体的染色体单片段置换系CSSL182,检测到一个与粒宽相关的QTL。CSSL182与受体亲本9311粒型性状差异显着,且只在8号染色体有一个野生稻导入片段。构建CSSL182/9311的F_2次级分离群体,将粒宽QTL初定位在8号染色体的标记RM447和RM264之间,贡献率达22.49%,将该QTL命名为qGW8.1。随后进一步设计区间内多态性分子标记引物,检测F_2群体的2000株分离个体以及F_(2∶3)群体交换单株,结合后代表型验证,最终将qGW8.1精细定位到8号染色体10 kb区间内。该区间内含有3个候选基因,基因测序发现这3个基因在双亲之间均含有丰富的变异。对双亲子粒颖壳细胞电镜扫描观察发现,CSSL182的颖壳细胞宽度比9311减少16.7%。这一结果表明qGW8.1中来自野生稻的等位基因通过改变颖壳细胞形状影响粒型。(本文来源于《植物遗传资源学报》期刊2018年01期）
林静,张所兵,张云辉,汪迎节,方先文[8]（2017）在《利用染色体片段置换系定位水稻苗期耐盐QTLs（英文）》一文中研究指出[目的]解决盐碱化土地水稻生产,缓解粮食供求矛盾。[方法]以籼稻品种9311和粳稻品种日本晴为亲本培育的高代回交置换系为材料,在0.5%NaCl盐胁迫条件下,以存活率为耐盐指标,进行水稻苗期耐盐性QTL定位。[结果]采用QTL IciMapping v3.1软件对存活率进行QTL分析,在第3染色体相邻标记RM1350附近检测到1个苗期耐盐相关QTL(QSst3),所在遗传区间为113.2 cM~132.8 cM,贡献率17.75%,加性效应10.9,说明来自供体亲本日本晴相应QTL使苗期耐盐性变强。[结论]该研究有利于水稻耐盐性种质资源的筛选。(本文来源于《Agricultural Science & Technology》期刊2017年12期）
林静,张所兵,张云辉,汪迎节,方先文[9]（2017）在《利用染色体片段置换系定位水稻苗期耐盐QTLs》一文中研究指出【目的】挖掘水稻耐盐新基因,为水稻耐盐性遗传改良奠定基础。【方法】本研究以籼稻品种9311和粳稻品种日本晴为亲本培育的高代回交置换系为材料,在0.5%Na Cl盐胁迫条件下,以存活率为耐盐指标,对水稻苗期耐盐性QTL进行定位。采用QTL Ici Mapping v3.1软件对存活率进行QTL分析。【结果】在第3染色体相邻标记RM1350附近检测到1个苗期耐盐相关QTL(QSst3),所在遗传区间为113.2~132.8 c M,贡献率17.75%,加性效应10.9。【结论】来自供体亲本日本晴相应QTL使苗期耐盐性变强。(本文来源于《西南农业学报》期刊2017年07期）
叶伟震[10]（2017）在《甜瓜染色体片段置换系的初步构建及种子相关性状QTL分析》一文中研究指出甜瓜(Cucumis melo L.2n=24)作为葫芦科作物之一,是人们日常生活常用的水果之一,甜瓜果肉含有很多营养物质且药用价值很高。种子是植物繁殖后代,延续遗传物质的载体,是物种延续不可或缺的组成部分,种子的大小关系到营养物质的储存以及种子的萌发,因此,研究及定位控制甜瓜种子相关性状的基因,对甜瓜遗传育种及其种子相关生物学研究具有重要意义。染色体片段置换系具有遗传背景纯合、能够稳定遗传、QTL分析及定位准确等优点,是作物QTL及品种选育的理想材料。本研究的内容主要分为两个部分,一方面结合分子标记辅助选择,利用回交群体进行染色体片段置换系的初步构建,主要内容为:以厚皮抗病甜瓜品种MR-1为母本材料,以普通栽培薄皮甜瓜品种M1-15为父本材料,通过杂交获得F1代单株,以MR-1为轮回亲本,进行了两代回交分别获得了BC1P1和BC2P1代群体,结合MAS技术,利用对父母本全基因组重测序的数据设计开发CAPS分子标记然后对每代回交群体进行分子标记辅助选择,构建染色体片段置换系。另一方面,利用BC1P1代群体的基因组和种子的相关性状构建遗传连锁图谱并对甜瓜种子长度、宽度、百粒重以及种腔宽度等性状进行了QTL分析。从而为培育甜瓜优良品种及分子辅助育种提供更理想的育种材料。主要研究结果如下:以高通量测序技术为基础,在两亲本间共开发出600对CAPS引物,经引物筛选后共获得具有多态性的CAPS标记240对,多态率为40%,利用240对分子标记,以及叁个群体(包含两个BC1P1群体和一个BC2P1群体)构建了3张不同的图谱,分别包含197,209和180对分子标记覆盖基因组长度分别为2231.09c M、1829.55c M和1264.70c M。通过对两个回交世代染色体片段置换系初步构建的结果统计观察与分析,得出BC1P1群体和BC2P1群体中母本条带和杂合条带的数量基本符合1:1和3:1的比例,并计算出两个回交世代中各单株的导入率,分别为接近于25%和12.5%。对GGT2.0软件计算结果进行统计,得到在两个回交世代中均有初步建成的单片段置换系,数量分别为54和190。对BC1P1群体的种子长度、宽度、百粒重及种腔宽度进行QTL分析,共获得6个QTL位点,分布于1、2、5、8号染色体上,其中1号染色体M1-14和M1-16两个标记之间同时存在分别和种子长度及种子百粒重相关的两个QTL位点;与种子宽度、种子长度相关的两个QTL位点均位于5号染色体上M5-16与M5-17两标记之间;种腔宽度共获得两个QTL位点位于2号以及8号染色体上。四个性状的定位距离分别为1.19cM、1.12cM、1.12c M、2.39c M、4.20c M、2.59c M,贡献率均在9.86%-13.52%之间。(本文来源于《东北农业大学》期刊2017-06-01）
置换系论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为给染色体片段置换系的快速鉴定提供新的技术手段,用3个以普通小麦品种中国春(Chinese Spring,CS)为背景的野生二粒小麦(TTD140)染色体臂置换系(chromosome arm substitution line,CASL)进行转录组测序,并结合SNP分析,获得纯合的SNP,用于鉴定CASL材料中TTD140的置换区段。结果发现,CASL3AL的SNP主要分布在染色体3A的108～750 Mb区段;CASL7BS的SNP分布于染色体7B的0～536 Mb和5A的22～482 Mb区段;CASL4AL的SNP分布比较复杂,除集中在4A的40～745 Mb、7B的0～570 Mb以及5B的410～675 Mb外,还在1A、2A、3A、7A、2B、2D、5D、6D和7D染色体上成簇分布,表明该材料除在预期的染色体4A上保留TTD140的大片段外,还在其他染色体上残留许多TTD140小片段。通过97对多态性SSR标记验证CASL3AL的染色体组成,发现84对标记能检测到TTD带型,其分布范围与转录组数据鉴定结果基本一致。对SNP富集区域的320 bp PCR产物直接测序,发现CASL3AL与CS之间存在7个SNP位点,但与TTD140以及Zavitan参考序列一致。因此,本研究利用转录组测序技术能够有效鉴定小麦染色体片段置换系材料的染色体组成,且比传统的分子标记技术准确、方便、快捷。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
置换系论文参考文献
[1].杨思晴,胡鑫,王中秋,缪娜娜,胡乐佳.普通小麦-野生二粒小麦4AL染色体臂置换系抽穗期基因遗传定位[C].2019年中国作物学会学术年会论文摘要集.2019
[2].缪娜娜,丁明全,杨思晴,戎均康.转录组测序技术在鉴定小麦染色体臂置换系染色体组成上的应用[J].麦类作物学报.2019
[3].王中秋,吴雅露,汤孟玲,方春,缪娜娜.不同环境温度下普通小麦-野生二粒小麦染色体臂置换系的农艺性状差异分析[J].江苏农业科学.2019
[4].许睿.基于染色体置换系的普通野生稻（O.rufipogonGriff.）耐盐性QTL定位[D].中国农业科学院.2019
[5].丁膺宾,张莉珍,许睿,王艳艳,郑晓明.基于染色体片段置换系的野生稻粒长QTL——qGL12的精细定位[J].中国农业科学.2018
[6].李静,孙妍,齐兰,苏龙,丁膺宾.基于染色体置换系的野生稻抽穗期及紫色性状QTL的鉴定[J].植物遗传资源学报.2018
[7].孙妍,苏龙,乔卫华,郑晓明,齐兰.基于染色体片段置换系的野生稻粒宽QTL-qGW8.1的精细定位[J].植物遗传资源学报.2018
[8].林静,张所兵,张云辉,汪迎节,方先文.利用染色体片段置换系定位水稻苗期耐盐QTLs（英文）[J].AgriculturalScience&Technology.2017
[9].林静,张所兵,张云辉,汪迎节,方先文.利用染色体片段置换系定位水稻苗期耐盐QTLs[J].西南农业学报.2017
[10].叶伟震.甜瓜染色体片段置换系的初步构建及种子相关性状QTL分析[D].东北农业大学.2017
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