荸荠多酚氧化酶基因的克隆及其在鲜切荸荠贮藏过程中的表达分析

荸荠多酚氧化酶基因的克隆及其在鲜切荸荠贮藏过程中的表达分析

论文摘要

利用RACE技术首次从荸荠中克隆得到PPO基因全长cDNA序列,并分析其在鲜切荸荠贮藏过程中的表达变化。克隆得到的荸荠PPO基因cDNA序列全长为2 006 bp,开放阅读框长度为1 734 bp,编码577个氨基酸,命名为CwPPO(登录号:MG702489)。预测分析表明,CwPPO编码蛋白质的分子量为64.86 ku,分子式为C2891H4417N795O873S18,理论等电点为6.50,属亲水性蛋白。CwPPO蛋白可能定位于线粒体基质空间,具有3个典型的保守结构域和2个铜离子结合域。此外,预测发现CwPPO有20个丝氨酸磷酸化位点、7个苏氨酸磷酸化位点及6个酪氨酸磷酸化位点,其二级结构以不规则卷曲为主。系统发育分析显示,CwPPO蛋白与菠萝、油棕有较近的亲缘关系。荧光定量分析发现,CwPPO在鲜切荸荠中的初始表达水平较低,但在贮藏后期表达量快速提高。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 原料及处理
  •   1.2 试剂
  •   1.3 试验方法
  •     1.3.1 荸荠果肉总RNA提取
  •     1.3.2 荸荠果肉PPO基因克隆
  •     1.3.3 荸荠PPO基因生物信息学分析
  •     1.3.4 荸荠PPO基因的表达分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 荸荠果肉PPO基因cDNA全长序列克隆
  •   2.2 CwPPO基因生物信息学分析
  •   2.3 CwPPO蛋白序列多重比对和进化树构建
  •   2.4 CwPPO在鲜切荸荠贮藏过程中的表达分析
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 宋慕波,帅良,方方,陈振林,张志,段振华

    关键词: 鲜切荸荠,多酚氧化酶,基因克隆,表达分析

    来源: 江苏农业科学 2019年17期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 贺州学院食品科学与工程技术研究院,广西果蔬保鲜和深加工人才小高地

    基金: 广西自然科学基金(编号:2017GXNSFAA198082,2015GXNSFBA139082),贺州学院博士启动基金(编号:HZUBS201402,HZUBS201405),广西特聘专家专项经费

    分类号: Q78;TS255.3

    DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.17.011

    页码: 46-50

    总页数: 5

    文件大小: 791K

    下载量: 109

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