单链构象多态分析论文_于璐,孟存仁,张朝霞

导读:本文包含了单链构象多态分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:多态性,毛细管,电泳,分枝,基因,杆菌,基因突变。

单链构象多态分析论文文献综述

于璐,孟存仁,张朝霞[1](2014)在《聚合酶链反应-单链构象多态性检测rpoB基因突变对结核分支杆菌耐利福平诊断价值的Meta分析》一文中研究指出目的系统评价聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)对结核分支杆菌rpoB基因突变耐利福平的诊断价值。方法计算机检索PubMed、Web of Science、h e Cochrane Library(2014年第2期)、CBM、VIP和WanFang Data,查找PCR-SSCP与金标准(常规体外药敏试验结果)比较检测结核分支杆菌rpoB基因突变的诊断性研究,检索时限均为从建库至2014年1月。由2位评价员按照纳入与排除标准独立筛选文献、提取资料和方法学质量评价后,采用Meta-DiSc 1.4和Stata 12.0软件进行Meta分析。结果最终纳入10个研究,包括1 229例标本。Meta分析结果显示:①SEN合并=0.92[95%CI(0.90,0.94),P=0.019 3]、SPE合并=0.97[95%CI(0.95,0.98),P<0.000 1]、+LR合并=23.68[95%CI(8.71,64.37),P<0.000 1]、–LR合并=0.10[95%CI(0.06,0.15),P=0.023 1]和DOR合并=257.16[95%CI(96.82,683.02),P=0.020 0],SROC曲线下面积(AUC)为0.971 5,Q*指数0.922 3。②分别剔除样本量<100例、中文研究以及QUADAS评分>10分的研究行敏感性分析,结果显示剔除文献后各诊断结果稳定,提示结论较为可靠。结论 PCR-SSCP检测rpoB基因突变诊断结核分支杆菌耐利福平具有较高的临床应用价值。(本文来源于《中国循证医学杂志》期刊2014年06期)

孙景昱,张丽华,傅桂莲,李明成,刘洋[2](2014)在《聚合酶链式反应偶联单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术用于鹿鞭线粒体DNA指纹的研究》一文中研究指出目的建立一种快速、简便、准确的分子生物学方法,用来鉴别鹿鞭真伪及品种。方法应用柱色谱法提取梅花鹿鞭、马鹿鞭、牛鞭以及市售鹿鞭线粒体DNA;根据GenBank中鹿类动物线粒体细胞色素b基因序列,设计一对引物用于线粒体DNA的聚合酶链式反应(PCR)特异性扩增;应用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对聚合酶链式反应产物进行单链构象多态分析(single strand conformation polymorphism,SSCP)。结果梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭可显示清晰且迁移率不同的片段;对照组伪品鹿鞭及部分市售鹿鞭无特异性显示。结论柱色谱法提取线粒体DNA所需时间短,DNA纯度高,DNA分子的破坏性较小,为特异性聚合酶链式反应扩增提供一级结构保证;单链构象多态分析法可以清晰显示正品梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭单链片段,其一级结构中的碱基差别为正品梅花鹿鞭、马鹿鞭的不同迁移率提供依据,也为药源市场鹿鞭的鉴别提供一种可以直接进行亚种间鉴别的快速、简便、准确的可行性方法。(本文来源于《中国药学杂志》期刊2014年09期)

孔庆鑫,邱丽华,韦凌娅,倪晓平[3](2013)在《淡色库蚊乙酰胆碱酯酶Ι基因单链构象多态性分析》一文中研究指出为了解不同地区淡色库蚊样本乙酰胆碱酯酶Ι基因(ace1)多态性,探讨单链构象多态性分析(SS-CP)技术在蚊虫抗性分子监测中应用的可行性,本文采集浙江省杭州、舟山、湖州、金华等市区淡色库蚊样本,对其进行ace1基因PCR扩增及SSCP分析。结果显示,浙江省淡色库蚊现场品系以及敏感品系ace1基因片段共存在2个SSCP型,分别命名为ace1-A型(杭州、舟山、湖州现场品系以及敏感品系)和ace1-B型(金华现场品系)。经序列测定,SSCP型ace1-A和ace1-B之间存在两个碱基的差异。实验证明PCR-SSCP可快速高效分析淡色库蚊ace1基因的多态性,适于蚊虫抗性分子监测使用。(本文来源于《中国预防医学杂志》期刊2013年08期)

谢希晖,王荣,贾正平,谢华,张爱梅[4](2011)在《毛细管电泳-单链构象多态分析检测胃癌中p16基因突变》一文中研究指出目的:建立快速高效检测胃癌患者胃癌组织及癌旁正常组织中p16基因突变的方法。方法:采用PCR扩增p16基因第二外显子易发生突变片段,扩增样品纯化后经95℃变性;以毛细管电泳(CE)分析法结合单链构象多态性(SSCP)对60例胃癌患者p16基因突变情况进行分析。结果:分析结果表明只有3例低分化腺癌患者存在基因突变,测序表明p16基因第二外显子碱基序列AGAC发生碱基A丢失。结论:p16基因突变可能导致胃癌的发生,但不起主导作用;CE-SSCP分析方法具有快速、灵敏、准确的特点,可用于胃癌组织中p16基因的突变分析。(本文来源于《生物技术通讯》期刊2011年06期)

李根银,王效京,曹宁贤,刘宏,张维军[5](2010)在《5个猪种DECR1基因外显子2单链构象多态性的群体遗传学分析》一文中研究指出试验利用PCR-SSCP技术检测了山西马身猪、山西白猪、长白猪、大白猪和杜洛克猪5个品种共490头猪的DE-CR1基因外显子2的多态性。结果显示,DECR1基因外显子2位点存在多态性,表现出AA、BB和AB 3种基因型。群体遗传学分析结果表明,5个猪种都是等位基因B为优势基因;Hardy-Weinberg平衡检验结果显示,山西白猪和杜洛克猪处于平衡状态,山西马身猪、长白猪和大白猪处于非平衡状态;各品种猪的多态信息含量均为中度多态。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2010年07期)

张爱梅,王荣[6](2010)在《毛细管电泳单链构象多态性分析检测胃癌p53基因282位密码子的突变》一文中研究指出p53基因点突变在胃癌的发生过程中起重要作用,基因点突变的检测将有助于临床准确诊断胃癌。本实验用PCR扩增包含282位密码子的胃癌及癌旁正常组织p53基因,扩增样品经95℃变性,以CE-SSCP对其突变情况进行检测。(本文来源于《西北地区第六届色谱学术报告会甘肃省第十一届色谱年会论文集》期刊2010-06-01)

刘春江,夏涵,黄君富,府伟灵[7](2009)在《毛细管电泳-单链构象多态性分析技术》一文中研究指出毛细管电泳-单链构象多态性分析技术(CE-SSCP)是进行基因突变分析、细菌鉴定、抗菌活性分析、单核苷酸多态性(SNP)分型和mRNA定量的强有力工具。近些年来,随着分子生物学技术的不断发展,其应用也愈加广泛。本文就该技术的基本原理及影响参数,如筛分介质、检测器、温度、缓冲液组成及pH值等进行了综述,并对其应用作了简要介绍。(本文来源于《生命的化学》期刊2009年04期)

李娟,白逢彦[8](2009)在《26S rDNA单链构象多态性分析在临床酵母菌菌种鉴定中的应用》一文中研究指出【目的】探讨酵母菌临床分离株26S rDNA D1/D2区序列种内相似性和种间差异性的快速检测方法,为临床酵母菌菌种鉴定方法的改进奠定基础。调查北京地区临床酵母菌的种群多样性,为国内酵母菌感染的流行病学研究提供新的基础数据。【方法】用5种常见临床酵母菌种的模式和权威菌株作为标准参考菌株,从北京四家综合性医院收集临床酵母菌260余株,PCR扩增其26SrDNAD1/D2区,对扩增产物进行单链构象多态性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析和序列测定分析。【结果】常见病原酵母菌26SrDNAD1/D2区的SSCP图谱具有明显的种间差异性和种内相似性,可以通过该方法对菌株进行初步的菌种鉴定。D1/D2-SSCP和序列分析相结合,对260余株临床酵母菌进行了菌种鉴定,共鉴定有10个属20个种,优势属为念珠菌属(Candida),优势种及其所占比例分别是:C.albicans(57.7%),C.parapsilosis(10.0%),C.tropicalis(9.2%),C.glabrata(6.7%)和C.krusei(5.8%),并发现过去从未或很少报道致病的酵母菌种,愈来愈多地出现在临床分离菌株中。【结论】26S rDNA D1/D2区的SSCP图谱分析为临床酵母菌株的快速鉴定提供了新的方法;北京地区酵母菌临床分离株呈种群多样性分布,C.albicans虽然仍占优势,但其它念珠菌种的比例已达42%。(本文来源于《微生物学报》期刊2009年08期)

姜鹏,毛福荣,崔晶,李峰,张玺[9](2009)在《不同地理株旋毛虫细胞色素氧化酶Ⅰ基因多态性的PCR-单链构象多态性分析》一文中研究指出目的:观察不同地理株旋毛虫细胞色素氧化酶Ⅰ(COXⅠ)基因片段的多态性。方法:根据旋毛虫mtD-NACOXⅠ设计引物,应用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对我国7个猪源旋毛虫(Trichinella spiralis,T1)地理株(河南、湖北、云南、西安、天津、黑龙江同江及哈尔滨株)与1个波兰猪源旋毛虫(T1,编号ISS3)地理株进行COXⅠ基因片段多态性进行分析。结果:我国7个猪源旋毛虫地理株与波兰地理株COXⅠ基因均扩增出约400bp的片段,PCR扩增产物经SSCP检测发现有3种基因型(AA、AB和BB),波兰地理株为AA型,黑龙江同江、哈尔滨、西安、云南、湖北及河南株均为AB型,天津株为BB型,其中以AB基因型频率最高(0.75),AA与BB基因型均为0.125;A和B等位基因频率均为0.5;旋毛虫不同地理株COXⅠ基因的多态性信息含量为0.375,为中度多态性。结论:8个不同地理株猪源旋毛虫的COXⅠ基因为中度多态性。(本文来源于《郑州大学学报(医学版)》期刊2009年03期)

陆军,李卫鹏,叶松[10](2008)在《用聚合酶链反应单链构象多态性分析技术检测结核分枝杆菌L型的rpoB基因突变》一文中研究指出目的:探索结核分枝杆菌L型的耐药基因rpoB突变与利福平耐药性的关系,以及聚合酶链反应单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术的临床应用价值。方法:收集结核分枝杆菌L型菌株52株,采用PCR-SSCP方法检测rpoB基因,与采用常规药敏试验法检测利福平耐药的结果进行对比分析。结果:采用常规法检测,52株临床分离株中有38株利福平耐药,耐药率为73.08%(38/52);PCR-SSCP方法对52株临床耐药株rpoB基因突变的检出率为65.38%(32/52),两种方法检测耐利福平的符合率为84.21%。结论:PCR-SSCP对利福平耐药的结核分枝杆菌L型菌株检出率较高,将其与常规药敏试验联合应用,是一种指导临床用药的好方法。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2008年03期)

单链构象多态分析论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的建立一种快速、简便、准确的分子生物学方法,用来鉴别鹿鞭真伪及品种。方法应用柱色谱法提取梅花鹿鞭、马鹿鞭、牛鞭以及市售鹿鞭线粒体DNA;根据GenBank中鹿类动物线粒体细胞色素b基因序列,设计一对引物用于线粒体DNA的聚合酶链式反应(PCR)特异性扩增;应用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对聚合酶链式反应产物进行单链构象多态分析(single strand conformation polymorphism,SSCP)。结果梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭可显示清晰且迁移率不同的片段;对照组伪品鹿鞭及部分市售鹿鞭无特异性显示。结论柱色谱法提取线粒体DNA所需时间短,DNA纯度高,DNA分子的破坏性较小,为特异性聚合酶链式反应扩增提供一级结构保证;单链构象多态分析法可以清晰显示正品梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭单链片段,其一级结构中的碱基差别为正品梅花鹿鞭、马鹿鞭的不同迁移率提供依据,也为药源市场鹿鞭的鉴别提供一种可以直接进行亚种间鉴别的快速、简便、准确的可行性方法。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

单链构象多态分析论文参考文献

[1].于璐,孟存仁,张朝霞.聚合酶链反应-单链构象多态性检测rpoB基因突变对结核分支杆菌耐利福平诊断价值的Meta分析[J].中国循证医学杂志.2014

[2].孙景昱,张丽华,傅桂莲,李明成,刘洋.聚合酶链式反应偶联单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术用于鹿鞭线粒体DNA指纹的研究[J].中国药学杂志.2014

[3].孔庆鑫,邱丽华,韦凌娅,倪晓平.淡色库蚊乙酰胆碱酯酶Ι基因单链构象多态性分析[J].中国预防医学杂志.2013

[4].谢希晖,王荣,贾正平,谢华,张爱梅.毛细管电泳-单链构象多态分析检测胃癌中p16基因突变[J].生物技术通讯.2011

[5].李根银,王效京,曹宁贤,刘宏,张维军.5个猪种DECR1基因外显子2单链构象多态性的群体遗传学分析[J].中国畜牧兽医.2010

[6].张爱梅,王荣.毛细管电泳单链构象多态性分析检测胃癌p53基因282位密码子的突变[C].西北地区第六届色谱学术报告会甘肃省第十一届色谱年会论文集.2010

[7].刘春江,夏涵,黄君富,府伟灵.毛细管电泳-单链构象多态性分析技术[J].生命的化学.2009

[8].李娟,白逢彦.26SrDNA单链构象多态性分析在临床酵母菌菌种鉴定中的应用[J].微生物学报.2009

[9].姜鹏,毛福荣,崔晶,李峰,张玺.不同地理株旋毛虫细胞色素氧化酶Ⅰ基因多态性的PCR-单链构象多态性分析[J].郑州大学学报(医学版).2009

[10].陆军,李卫鹏,叶松.用聚合酶链反应单链构象多态性分析技术检测结核分枝杆菌L型的rpoB基因突变[J].中国卫生检验杂志.2008

论文知识图

HLA-ⅡDR4位点单链构象多态分析一3病例3的EDA基因8个外显子PCR结果堵TYR-嫉毋外昆子2的fK:R扩堆产物电泳图...单链构象多态性分析和异源双链分析图...患儿的曲面断层片(A)及过早脱落牙齿牙...一2部分分离物抓夕2RT二PCR扩增产物的S...

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