新疆石河子部分地区猪流行性腹泻病毒遗传变异分析

论文摘要

为分析猪流行性腹泻病毒（PEDV）遗传变异情况,从石河子的3个地区已确诊PED猪场采集病料,分别获得了3株PEDV S基因序列和ORF3基因序列,将其进行序列比对及遗传进化分析。根据3株S基因序列分析表明,XJ-SHZ148、XJ-SHZ146株与韩国QIAP1401株（KX793713）序列相似性最高,达到97.4%和98.7%;XJ-SW株与广东GD-03 2012株（KP870115）序列相似性最高,达到98.5%。3个分离株与PEDV疫苗株AF353511（CV777）性序列相似性分别为94.5%、94.2%和94.1%。系统进化分析表明,XJ-SHZ148、XJ-SHZ146与韩国的KPV1406（KM108353）)、QIAP1401（KX793713）)同为一群。XJ-SW株与广东GD/03/2012（（KP870115））、GD/2011株（KP870115）同为一群;3株PEDV ORF3基因序列与疫苗株（CV777）序列比对多个位点存在突变,序列相似性较低。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样本来源
•   1.2 试剂与材料
•   1.3 猪流行性腹泻病毒S基因、ORF3基因扩增
•     1.3.1 扩增猪流行性腹泻病毒S基因和ORF3基因引物
•     1.3.2 样本的处理及病毒总RNA的提取
•     1.3.3 PEDVS基因扩增
•     1.3.4 PEDV ORF3基因扩增
•   1.4 序列分析
• 2 结果
•   2.1 扩增PEDV S、ORF3基因片段的结果
•   2.2 测序结果分析
•   2.3 根据PEDV S基因序列的系统进化分析
•   2.4 根据PEDV ORF3序列分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 黄新,吴桐忠,韩猛立,张星星,何延华,钟发刚

关键词: 猪流行性腹泻病毒,遗传进化,基因,新疆石河子

来源: 中国兽医杂志 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 新疆农垦科学院/省部共建新疆绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室

基金: 新疆农垦科学院科技引导计划(63YYD201311)

分类号: S852.651

页码: 17-20

总页数: 4

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