骨骼肌特异转录调控因子MyoD通过相分离机制调控基因表达

骨骼肌特异转录调控因子MyoD通过相分离机制调控基因表达

论文摘要

转录调控因子,也被称为序列特异的DNA结合因子,通常包含一个或者多个DNA结合结构域,通过结合某个基因的DNA序列,进而调控一系列特定基因表达,在各种组织器官的谱系命运决定中发挥着重要作用。转录因子是基因编码的蛋白产物,随着基因组研究的不断扩大,人们发现一个基因会受到多个不同的转录因子的调控,越来越多的转录因子被发现,这使得转录因子家族逐渐成为人们的研究热点。目前来看,关于转录因子的研究,主要涉及生物体的发育过程,例如组织和器官的发育、细胞内信号转导等胞内的生物学过程、免疫应答及感官知觉等应激响应、代谢紊乱综合征或组织器官之间的互作以及细胞组织定位研究等诸多方面。但是关于转录因子通过相分离机制调控基因表达的研究较少,同时转录因子和长非编码RNA通过相分离共同调控基因表达的机制并不清楚。肌源性细胞的特异性和分化是由关键转录调控因子MyoD和其他肌源性调控因子共同决定的。本研究团队发现MyoD可以和长非编码RNALinc-RAM结合,募集染色质重塑复合物到生肌相关基因位点,调控生肌相关基因的表达和细胞分化。但是MyoD的转录活性是否受到相分离机制的调控以及Linc-RAM是否同样参与到这个过程目前还不清楚。本研究提出并探究的科学问题是:MyoD的转录活性是否受到相分离机制的调控?MyoD是否与其他蛋白或者RNA分子通过相分离的方式共同调控染色质高级结构?Linc-RAM是否会作为MyoD的cofactor,参与MyoD相分离机制的过程中呢?我们通过研究发现:MyoD主要定位于核基质中,并呈点状分布,通过对MyoD氨基酸序列分析发现其C端包含大量内在无序序列,体外液滴实验证明MyoD有相分离的现象。另外,根据之前实验室的研究结果,MyoD和骨骼肌特异表达的长非编码RNA Linc-RAM在体外结合,提示我们Linc-RAM可能作为MyoD的cofacor参与到其通过相分离机制所介导的基因表达调控过程。通过进一步研究发现,Linc-RAM和MyoD两者在细胞内有共定位的现象,同时Linc-RAM和MyoD C端的IDR区域在体外结合,以上结果提示我们Linc-RAM有可能是一个潜在的MyoD的 cofacor。综上所述,我们发现MyoD有相分离的现象,该现象的发生是否受其他蛋白或者RNA分子,尤其是Linc-RAM的调控需要我们进一步探究,对MyoD的深入研究与解读除了进一步丰富转录因子转录调控进程,同时有望通过相分离的全新理念揭示基因表达调控新机制,为该领域的研究提供理论基础。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第1章 前言
  •   一、骨骼肌谱系命运决定
  •     1.1 肌源性调节因子
  •     1.2 MRF家族介导骨骼肌谱系特异性及细胞分化
  •   二、转录因子的结构与功能
  •     2.1 转录因子的结构特征
  •     2.2 MRF家族蛋白的结构特征
  •     2.3 MyoD调控生肌相关基因表达
  •   三、长非编码RNA研究进展
  •     3.1 长非编码RNA的结构与分类
  •     3.2 长非编码RNA的作用机制
  •     3.3 骨骼肌特异表达的长非编码RNA
  •   四、相分离参与调控基因表达
  •     4.1 相分离的生物学定义
  •     4.2 相分离小体的物理特征
  •     4.3 相分离相关蛋白的特征
  •     4.4 相分离相关RNA的研究
  •     4.5 相分离参与基因调控
  •   五、科学问题及意义
  •   六、研究内容及策略
  • 第2章 材料方法
  •   一、实验材料
  •   二、实验方法
  • 第3章 实验结果
  •   一、MyoD蛋白在体外具有相分离的现象
  •     1.1 MyoD C端包含一段较长的IDR区域,且富含甘氨酸,丝氨酸和脯氨酸
  •     1.2 MyoD主要定位于核基质中并呈点状分布
  •     1.3 筛选表达GFP-MyoD融合蛋白的稳定细胞株
  •     1.4 MyoD-IDR蛋白在体外液滴实验中有相分离的现象
  •   二、Linc-RAM和MyoD在细胞内有共定位现象
  •     2.1 Linc-RAM在C2C12细胞的细胞核和细胞质中均有定位
  •     2.2 Linc-RAM在骨骼肌干细胞的细胞核和细胞质中均有定位
  •     2.3 Linc-RAM和MyoD在细胞内共定位
  •     2.4 Linc-RAM与MyoD的N端有较强的结合,与C端结合较弱
  • 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 第4章 miR-378转基因小鼠脂肪组织的代谢表型分析
  •   参考文献(References)
  • 致谢
  • 个人简历
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 汪瑞婷

    导师: 张勇

    关键词: 转录因子,相分离,内在无序序列,基因表达

    来源: 北京协和医学院

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 北京协和医学院

    分类号: Q78

    DOI: 10.27648/d.cnki.gzxhu.2019.000382

    总页数: 82

    文件大小: 5217K

    下载量: 88

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