黄淮海地区玉蜀黍黑粉菌群体遗传结构分析

论文摘要

利用17个多态性ISSR引物对2017年在我国黄淮海地区采集的41株玉蜀黍黑粉菌Ustilago maydis样本进行了种群遗传结构分析。基于UPGMA法和贝叶斯模型对玉蜀黍黑粉菌群体遗传结构分析显示,采集的样本可以分为两大群,且种群的划分表现出了与来源地理纬度的一致性。因此按照各样本所属地理纬度将样本分为北纬33°–34°、北纬35°–36°、北纬37°–38°3大种群。结果表明,分离自北纬33°–34°地区的玉蜀黍黑粉菌遗传多样性最丰富,Nei’s基因多样性(H)为0.2216,Shannon指数(I)为0.3300。分子方差分析(AMOVA)显示,变异中来自种群内部的变异为86%,种群间变异14%(φpt=0.141)。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 玉蜀黍黑粉菌的分离
•   1.2 玉蜀黍黑粉菌DNA的提取和鉴定
•   1.3 多态性ISSR引物的筛选
•   1.4 ISSR数据分析
•     1.4.1 群体遗传结构的分析:
•     1.4.2 基因型多样性分析:
•     1.4.3 分子方差分析:
• 2 结果与分析
•   2.1 玉蜀黍黑粉菌样本的获得与鉴定
•   2.2 ISSR引物的筛选
•   2.3 玉蜀黍黑粉菌菌株群体结构分析
•     2.3.1 基于距离聚类的玉蜀黍黑粉菌群体结构分析:
•     2.3.2 基于模型聚类的玉蜀黍黑粉菌群体结构分析:
•   2.4 玉蜀黍黑粉菌地理种群基因型多样性
•   2.5 玉蜀黍黑粉菌地理种群遗传多样性水平
•   2.6 各地理种群间遗传分化
• 3 讨论
•   3.1 黄淮海地区玉蜀黍黑粉菌地理种群遗传多样性分析
•   3.2 黄淮海地区不同纬度间玉蜀黍黑粉菌的遗传分化
•   3.3 黄淮海地区玉蜀黍黑粉菌群体结构分析

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张家齐,马红霞,郭宁,张海剑,石洁

关键词: 玉蜀黍黑粉菌,黄淮海,遗传结构

来源: 菌物学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

单位: 河北省农林科学院植物保护研究所河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室

基金: 国家现代化农业产业技术体系(CARS-02),国家重点研发计划(2018YFD0200602)~~

分类号: S432.44

DOI: 10.13346/j.mycosystema.180236

页码: 210-221

总页数: 12

文件大小: 1555K

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