极旱荒漠地区黑顶麻雀种群遗传结构研究

极旱荒漠地区黑顶麻雀种群遗传结构研究

论文摘要

种群遗传结构是指种群遗传变异在时间和空间上的分布格局。通过研究动物种群遗传变异及其时空分布的变化,可以探讨动物生活史策略对生态因子的适应、行为对环境变动的进化响应。本研究于2017年至2018年,在甘肃安西极旱荒漠国家级自然保护区的北桥子村,分4个季节共采集黑顶麻雀种群506个样本,利用12个微卫星位点,对荒漠区不同季节黑顶麻雀种群遗传多样性变化和繁殖期黑顶麻雀种群小尺度空间遗传结构进行分析,以揭示黑顶麻雀种群遗传结构在时间和空间上的变化规律,分析其遗传结构的主要影响因素,探讨荒漠区雀形目鸟类种群遗传特征与生活史及行为的关系。主要研究结果如下:1.黑顶麻雀种群遗传多样性特点该荒漠区黑顶麻雀种群的观察杂合度(Ho)变化范围为0.281~0.776,平均观察杂合度是0.484;期望杂合度(He)为0.726~0.920,平均期望杂合度为0.810;近交系数(FIS)为0.157~0.641,平均近交系数FIS是0.407。群体内遗传多样性水平低。同时,12个微卫星位点均显著偏离哈温-平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium),群体内存在明显的近亲繁殖现象。2.不同季节黑顶麻雀种群的遗传多样性杂合度、等位基因丰富度、香农信息指数等均表明夏季黑顶麻雀种群遗传多样性最高,其次是春季种群,冬季种群遗传多样性最低。4个季节的种群间遗传分化结果表明,黑顶麻雀季节间种群遗传变异主要来自于种群内部。贝叶斯聚类分析结果表明,虽然夏季种群与春季种群遗传结构相似,秋季种群与冬季种群遗传背景相似,但不同季节黑顶麻雀种群之间仍具有一定的基因相似性,种群遗传结构在时间上的变化不显著。3.繁殖期黑顶麻雀种群小尺度空间遗传结构空间自相关分析结果表明繁殖期黑顶麻雀种群在小尺度上存在正的空间遗传结构,即巢间距离越近,繁殖个体间亲缘度越大。黑顶麻雀的这种小尺度空间遗传结构无明显的性别差异,但雄性的空间结构比雌性的稍显著。该荒漠区黑顶麻雀种群繁殖期小尺度空间遗传结构表明雌雄个体都倾向于亲缘关系近的在一起,形成亲缘群体的结构特征,这也使得近亲繁殖的风险加大,是造成种群遗传多样性低的主要原因;空间遗传结构还表明黑顶麻雀有一定程度的偏雌扩散。黑顶麻雀季节间种群遗传多样性变化与该物种生活史过程及扩散行为特征有关,在繁殖期开始之前有一次较明显的扩散,从而使繁殖期(夏季)群体的遗传多样性达到最高。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  •   1.1 种群遗传多样性
  •     1.1.1 等位基因数
  •     1.1.2 杂合度
  •     1.1.3 等位基因丰富度
  •     1.1.4 F-统计量
  •     1.1.5 Nei’s基因分化系数
  •   1.2 种群遗传结构研究
  •     1.2.1 种群遗传结构的时间变化
  •     1.2.2 种群遗传结构的空间变化
  •   1.3 种群小尺度空间遗传结构
  •   1.4 微卫星分子标记及其在群体遗传学中的应用
  •     1.4.1 微卫星分子标记在群体遗传学中的应用
  •   1.5 黑顶麻雀研究现状
  •   1.6 本论文研究目的和意义
  • 第二章 材料与方法
  •   2.1 研究区域概况
  •   2.2 实验材料、仪器与试剂
  •     2.2.1 实验标本的采集、保存
  •     2.2.2 实验仪器
  •     2.2.3 实验试剂
  •     2.2.4 实验溶液配制
  •   2.3 室内实验方法
  •     2.3.1 总DNA的提取
  •     2.3.2 微卫星DNA的扩增实验
  •   2.4 数据统计与分析
  •     2.4.1 遗传分型数据统计
  •     2.4.2 遗传多样性分析
  •     2.4.3 HWE检验
  •     2.4.4 种群遗传分化分析
  •     2.4.5 繁殖期黑顶麻雀空间遗传结构
  • 第三章 结果与分析
  •   3.1 样本量
  •   3.2 种群遗传多样性分析
  •     3.2.1 微卫星位点的等位基因频率
  •     3.2.2 黑顶麻雀总体遗传多样性水平
  •   3.3 种群在不同季节间的遗传变异
  •     3.3.1 不同季节黑顶麻雀种群遗传多样性
  •     3.3.2 遗传分化与基因流分析
  •     3.3.3 Nei’s基因分化系数
  •     3.3.4 遗传距离与遗传一致度
  •     3.3.5 Amova分子方差分析
  •     3.3.6 贝叶斯聚类分析
  •   3.4 黑顶麻雀空间遗传结构
  •     3.4.1 空间自相关分析
  •     3.4.2 Mantel检验
  • 第四章 讨论
  •   4.1 黑顶麻雀种群遗传多样性特点
  •   4.2 黑顶麻雀不同季节种群遗传多样性分析
  •   4.3 黑顶麻雀不同季节种群间遗传分化水平
  •   4.4 黑顶麻雀种群的空间遗传结构
  • 第五章 结论与展望
  •   5.1 结论
  •   5.2 展望
  • 参考文献
  • 在学期间的研究成果
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 贾碧云

    导师: 包新康

    关键词: 黑顶麻雀,遗传多样性,遗传结构,小尺度空间遗传结构,扩散

    来源: 兰州大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 兰州大学

    分类号: Q953

    总页数: 60

    文件大小: 3413K

    下载量: 58

    相关论文文献

    • [1].黑顶麻雀的巢址选择[J]. 四川动物 2011(06)

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    极旱荒漠地区黑顶麻雀种群遗传结构研究
    下载Doc文档

    猜你喜欢