邻苯二甲酸二（2-乙基己基）酯对罗非鱼肝脏转录组影响研究

论文摘要

邻苯二甲酸二（2-乙基己基）酯（DEHP）作为生产量和使用量最多的一种邻苯二甲酸酯类化合物,其对水生生物具有多种毒性.本研究选用中国南方地区最重要的经济鱼类尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）作为实验对象,研究DEHP（50mg/kg bw）作用下罗非鱼肝脏组织内转录组的响应特征.利用IlluminaTM HiSeq 4000测序平台对DEHP处理组和对照组尼罗罗非鱼肝脏RNA样品分别进行转录组测序.对照组和DEHP暴露组分别获得30.10Mb和30.16Mb待分析数据（clean reads）,对转录组数据进行组装并去冗余后得到58,585个Unigene.将DEHP处理组和对照组的转录组数据进行比较一共获得5,008个差异表达基因,其中上调表达基因和下调表达基因分别为3,217个和1,791个.通过GO和KEGG功能分析后发现这些差异表达基因主要为机体免疫、生殖内分泌以及脂类代谢相关基因,这表明DEHP对尼罗罗非鱼肝脏毒性主要表现为免疫毒性、生殖毒性和脂类代谢紊乱.另外,实时荧光定量PCR验证结果发现转录组分析数据基本可靠.上述结果为在转录组水平筛选DEHP生物标志物,解析DEHP对罗非鱼毒性作用的分子机制提供了科学参考.

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 实验样品及处理
•   1.2 RNA提取和转录组测序
•   1.3 Unigenes功能注释
•   1.4 差异表达基因筛选及分析
•   1.5 实时荧光定量PCR验证 （RT-PCR）
• 2 结果
•   2.1 罗非鱼肝脏转录组的测序与组装
•   2.2 尼罗罗非鱼肝脏Unigenes功能注释
•   2.3 DEHP暴露尼罗罗非鱼肝脏差异表达基因的筛选
•   2.4 差异表达基因GO和KEGG富集分析
•   2.5 q RT-PCR验证
• 3 讨论
•   3.1 DEHP暴露对尼罗罗非鱼免疫系统的影响
•   3.2 DEHP暴露对尼罗罗非鱼内分泌生殖系统的影响
•   3.3 DEHP暴露对尼罗罗非鱼脂类代谢的影响
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张林宝,胡莹,陈海刚,贾晓平,蔡文贵

关键词: 邻苯二甲酸二乙基己基酯,尼罗罗非鱼,肝脏,转录组,差异表达基因

来源: 中国环境科学 2019年01期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 环境科学与资源利用

单位: 中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室

基金: 中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费资助专项(2015TS01,2017YB09和2016TS19),国家自然科学基金资助项目(41306113)

分类号: X592;X503.225

DOI: 10.19674/j.cnki.issn1000-6923.2019.0048

页码: 386-396

总页数: 11

文件大小: 815K

下载量: 169