异源四倍体鲫鲤论文_谭星君

导读:本文包含了异源四倍体鲫鲤论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:四倍,基因,单倍体,蛋白,变异性,遗传物质,生长激素。

异源四倍体鲫鲤论文文献综述

谭星君[1](2015)在《异源四倍体鲫鲤中基因组以及转录水平的重组现象的发现》一文中研究指出异源四倍体鲫鲤(4n AT)是世界上首例培育成功的两性可育的四倍体动物群体,是通过红鲫(Carassius auratus red var.,2n=100,RCC,♀)和湘江野鲤(Cyprinus carpio L,2n=100,CC,♂)的人工远缘杂交获得,具有雌雄两性可育和遗传性状稳定的特点,代代相传,已经具备了形成一个染色体数目为200的新型的鱼种的前提条件。研究异源四倍体鲫鲤在基因组和转录水平的重组现象对研究远缘杂交过程中的进化具有重要作用。本论文在验证转录组数据的基础上,通过对4个基因不同个体的全长测序初步分析了异源四倍体鲫鲤的重组现象,另外通过与其他物种构建发育进化树进行了比较研究。1.验证转录组数据库在转录组数据库中随机挑选出7个拼接后显示有重组现象的基因,进行大量的测序,共测了至少473条DNA序列、867条cDNA序列。结果显示有4个基因不管是基因组还是转录水平都真的具有重组现象,这四个基因即slc10a3、slc25a20、Tab1、Mrpl1。还有3个基因虽然目前没有验证到重组现象,但也有可能是测序太少的原因。总之,这一结果在很大程度上证明了转录组数据库的真实性和准确性。2.亲子代之间或同一物种不同个体之间核苷酸含量分析通过对鲤鱼、红鲫和异源四倍体鲫鲤的核苷酸含量分析,同一物种不同个体之间同一基因相同核苷酸含量差异较小,基本上不会超过0.4%。异源四倍体鲫鲤做了3个个体,每个个体的A、G、C、T含量在不同基因各有波动,与亲本没有固定规律。亲子代之间同一基因的相同核苷酸含量差异不大,基本上不会超过1%。异源四倍体鲫鲤的slc10a3和slc25a20基因的gc含量在鲤鱼和红鲫之间,均大于50%,大量的研究表明接近60%的启动子附近都伴随有cpg岛,而cpg岛的出现会导致gc含量的提高,所以gc含量大于50%的基因很有可能是功能基因,序列较稳定;异源四倍体鲫鲤的tab1和mrpl1基因的gc含量和鲤鱼、红鲫的含量关系存在波动,但均小于50%,就是说at含量均大于50%,有研究表明at含量较高时,序列的稳定性可能降低,这可能就是这两个基因核苷酸含量与亲本含量关系存在波动的重要原因。3.pcr和测序结合法进行snp的筛选本论文通过大量的克隆测序,找出snp位点并确定碱基替换类型。研究表明,在这些具有重组现象的基因中,c-t和g-a转换的概率明显要大于其他碱基的颠换,在tab1基因中甚至超过2/3的概率。转换的概率如此高,可能是因为人类基因组中最易发生突变的位点是cpg二核苷酸上的c,c常为甲基化,可自发地脱去氨基而形成t。异源四倍体鲫鲤的snp位点明显多于其亲本鲤鱼和红鲫的。slc10a3基因中,异源四倍体鲫鲤的snp位点高达104个,远远多于亲本鲤鱼的21个和红鲫的10个;slc25a20基因中,异源四倍体鲫鲤的snp位点为51个,而亲本鲤鱼和红鲫分别只有4个和3个;tab1基因中,异源四倍体鲫鲤的snp位点为45个,其亲本则都是11个。根据这些snp位点可以鉴定重组。4.重组类型的分类和dna序列的基本特征本论文中的四个基因不管在基因组还是转录水平上都有重组现象,将测得的原始杂交序列分类,然后在能分为母本序列和父本序列的情况下,仍然能发现重组序列的存在,就说明重组确实是存在的。异源四倍体鲫鲤中这四个基因的重组序列属于“遗传变异型”,这些序列从分子水平上证明了异源四倍体鲫鲤群体在进化过程中与其亲本相比产生了很大的遗传变异。重组序列从两个方面进行分类,一是根据snp位点;二是根据与亲本同源序列的组成模式,其中“h-l”类型和“l-h”类型最为常见。这四个基因在鲤鱼、红鲫和异源四倍体鲫鲤中外显子长度没有差异,只有个别核苷酸位点表现出差异,表现出较高的保守性,而这些基因中能检测出内含子的dna序列均有片段的缺失、插入,且这些都存在于内含子部分,即内含子表现出与外显子不同的保守性。5.系统发育分析利用mega5.1软件,对鲤鱼、红鲫、异源四倍体鲫鲤以及其他物种绘制ml系统发育进化树。在四个基因的进化树中,异源四倍体鲫鲤始终与亲本鲤鱼、红鲫处于同一分枝上,与其他物种相比,鲤鱼、红鲫和异源四倍体鲫鲤之间分化程度不高。且这叁种鱼始终都与斑马鱼聚集在同一枝上。另外,亲缘关系较近的鱼类始终聚集在同一大的分枝上,同属于哺乳动物的荷兰猪、家鼠等也始终聚集在同一大的分枝上,这在一定程度上证明了本文构建的系统发育树的准确性。总之,四倍体鲫鲤群体在基因组和转录水平上都有重组现象的发生,且重组在进化中可能具有很重要的作用。(本文来源于《湖南师范大学》期刊2015-05-01)

王凤华,周毅,刘少军,钟欢,张纯[2](2012)在《异源四倍体鲫鲤及亲本ApoE的克隆及组织表达分析》一文中研究指出载脂蛋白E(Apolipoprotein E,ApoE)作为胆固醇代谢过程中的关键因子,参与脂蛋白转运和性腺发育。为进一步了解该基因的作用,本实验克隆并测序了异源四倍体鲫鲤及其父母本ApoE基因的全长序列。异源四倍体鲫鲤、红鲫和鲤的ApoE全长分别为1393 bp、1384 bp和1396 bp,均编码281个氨基酸。序列对比表明,异源四倍体鲫鲤ApoE与父本鲤更为相似。另外有2个氨基酸位点发生了与父母本均不同的变异,证明异源四倍体鲫鲤除了有杂交特征外也产生了变异。通过Mega软件构建的哺乳动物ApoE进化树与系统分类相一致:鲤科鱼类的ApoE聚类在一起而分离于其它物种。Real time PCR分析表明,ApoE基因在3种鱼中的组织表达模式基本一致,所有组织均有表达,而在脾脏中表达最高。(本文来源于《水产学报》期刊2012年05期)

冯浩,傅永明,骆剑,吴慧,刘筠[3](2011)在《转青鱼生长激素基因异源四倍体鲫鲤》一文中研究指出生态安全性是转基因鱼走向市场的瓶颈,通过转基因四倍体鱼同转基因二倍体鱼杂交获得不育的转基因叁倍体鱼是解决该问题的有效途径之一.本研究构建了青鱼β-actin基因启动子和青鱼生长激素(GH)基因精确连接的"全鱼"基因pbcAbcGHc;并采用显微注射法将pbcAbcGHc导入异源四倍体鲫鲤受精卵.对照养殖结果表明,150日龄的转基因异源四倍体鲫鲤原代(P0)的体重及体长明显大于对照组.选择60尾P0代转基因异源四倍体鲫鲤,采用PCR方法检测出外源青鱼GH基因在P0代转基因四倍体尾鳍基因组DNA中的整合率为90%;对20尾雄性P0代转基因四倍体精液样本的PCR检测发现,13个样本具有外源青鱼GH基因的整合.在一尾生长速度显着的P0代转基因四倍体鲫鲤的肌肉、肝脏、肾脏和卵巢组织中可检测到外源青鱼GH基因的转录.本研究成功获得了具有明显生长优势的P0代转青鱼GH基因异源四倍体鲫鲤,为建立转青鱼GH基因异源四倍体鲫鲤纯系和研制不育的转基因叁倍体鱼奠定了基础.(本文来源于《中国科学:生命科学》期刊2011年03期)

刘良国,颜金鹏,刘少军,刘东,尤翠平[4](2009)在《基于ISSR,AFLP分子标记和cyclins基因克隆的异源四倍体鲫鲤进化分析》一文中研究指出为了解两性可育、遗传性状稳定的异源四倍体鲫鲤基因组的进化情况,用ISSR,AFLP分子标记及cyclin A1和B1基因克隆的方法,从多倍体基因组和单个基因在多倍体形成前后的变化两个角度对上述问题进行了探讨分析.研究结果表明,异源四倍体鲫鲤经过连续15代培育,仍然保持了原始亲本遗传性状的稳定性,但基因组的遗传相似性及cyclins基因的碱基变异水平都说明异源四倍体鲫鲤具有明显的偏母性遗传特性.ISSR和AFLP分析表明,在异源四倍体鲫鲤基因组中,除了新产生的、原始亲本中没有的DNA条带外,还发生了原始亲本的DNA带纹消失,而且消失的带纹倾向于父本基因组.cyclins基因序列分析表明,在异源四倍体鲫鲤不同于原始亲本的核苷酸变异位点中,由于存在密码子单个碱基的非同义突变导致了异源四倍体鲫鲤新的氨基酸位点的产生.异源四倍体鲫鲤上述基因组的非加性变化,可能是应对杂交和多倍化冲击而使其趋于遗传稳定的一种适应性变化.(本文来源于《科学通报》期刊2009年14期)

颜金鹏,刘少军,刘筠[5](2007)在《异源四倍体鲫鲤雌核发育后代及其亲本RAPD分析》一文中研究指出异源四倍体鲫鲤是湖南师范大学鱼类发育生物学实验室和湖南湘阴县东湖渔场在红鲫(♀)和湘江野鲤(♂)的杂交后代中选育出来的四倍体鱼,目前已连续繁殖14代(F3-F16),已形成一个四倍体性能代代相传、遗传性状稳定的四倍体鱼群体,这是世界上唯一人工培育的两性可(本文来源于《水生生物学报》期刊2007年06期)

刘良国,陶敏,段巍,刘少军,刘东[6](2007)在《异源四倍体鲫鲤及其原始父母本细胞周期蛋白B基因克隆与分子遗传分析》一文中研究指出细胞周期蛋白(cyclin)B是真核细胞周期运转中调控G2期至M期转化的关键因子.本实验根据斑马鱼细胞周期蛋白B1基因的剪切方式,设计3对特异于金鱼和银鲫细胞周期蛋白B基因外显子区兼并引物,首次扩增出异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫和鲤鱼细胞周期蛋白B基因2条大小分别约为2.4kb和2.1kb的片段.测序及比对分析表明:这3种鱼的细胞周期蛋白B基因2个片段均包含8个外显子和7个内含子.内含子剪切位点符合GT-AG规则,推测细胞周期蛋白B基因2个片段可能是细胞周期蛋白B基因的2种存在形式.异源四倍体鲫鲤与其原始父母本细胞周期蛋白B基因片段序列的比较结果表明:无论是外显子区还是内含子区,异源四倍体鲫鲤与其原始亲本都具有较高的遗传相似性,在1025bp的外显子序列中相同的碱基位点数达963个,为异源四倍体鲫鲤来源于红鲫和鲤鱼提供了分子证据;同时,异源四倍体鲫鲤与其原始亲本差异碱基位点的存在又表明这一独特的多倍体物种与其原始亲本存在着进化上的变异.此外,还分别以细胞周期蛋白B基因外显子和内含子序列构建了包括异源四倍体鲫鲤及其原始父母本在内的系统进化树.结果初步表明:对于亲缘关系较近的物种,用外显子和内含子序列构建的系统进化树与传统的物种进化树一致;而对于亲缘关系较远的物种,用内含子序列构建的进化树与传统的物种进化顺序存在较大差异.(本文来源于《中国生物化学与分子生物学报》期刊2007年10期)

段巍,覃钦博,陈松,刘少军,王静[7](2007)在《用雄核发育方法制备改良异源四倍体鲫鲤群体》一文中研究指出用UV照射金鱼的卵子使其卵核的遗传物质失活,再与异源四倍体鲫鲤(AT)产生的二倍体精子受精,在无雄核染色体加倍处理情况下,成功地获得了两性可育的二倍体雄核发育鱼(A0).Ⅱ龄性成熟的A0自交形成了雄核发育鱼自交子一代(A1).本研究对10月龄A1的染色体数目、性腺的显微和亚显微结构以及外型特征进行了观察,实验结果表明:(ⅰ)A1中包含有四倍体(A1-4n)、叁倍体(A1-3n)以及二倍体后代(A1-2n),他们所占比例分别为85%,10%和5%,其染色体数目分别为4n=200,3n=150和2n=100.其中四倍体和叁倍体的形成证明二倍体A0能产生二倍体配子.二倍体雄核发育鲫鲤杂交鱼产生二倍体配子的原因与早期生殖细胞的核内复制机制有关.(ⅱ)A1-4n的性腺为两性型且发育正常.其中雄性个体能挤出白色精液,其中的二倍体精子头部明显比红鲫的单倍体精子头部大.这些二倍体精子具有正常结构,由头部和尾部组成,头部与尾部交接处有多个线粒体,精子尾巴的中央轴有典型的"9+2"微管结构.A1-4n雌性个体的卵巢发育饱满,其中含有大量Ⅱ,Ⅲ和Ⅳ时相的卵母细胞.在Ⅳ时相卵母细胞的放射膜上能观察到受精孔.同时期的A1-2n,A1-3n的性腺发育异常,均表现为不育.A1-2n的不育性与其为远源杂交二倍体有关,A1-3n的不育性与其为远源杂交叁倍体有关.(ⅲ)与AT相比,A1-4n不仅具有生长速度快、抗逆性强的优点,而且在外型上具有体背高、尾柄短、头部小等优良性状.本实验说明运用雄核发育技术不仅能获得两性可育的四倍体鱼,而且能对异源四倍体鲫鲤进行有效的遗传改良,这在细胞遗传研究和鱼类育种方面都具有重要意义.(本文来源于《中国科学(C辑:生命科学)》期刊2007年05期)

刘季芳,李伟,刘少军,陶敏,龙昱[8](2007)在《异源四倍体鲫鲤Sox4基因部分序列及其5′端调控区启动子片段的克隆与分析》一文中研究指出通过PCR技术从异源四倍体鲫鲤基因组DNA中分离到Sox4基因部分基序.序列分析表明,其5′端调控区具有多种启动子所特有的序列元件,如TATA框,CAAT框等,据此推测,它具有启动子活性.采用高保真PCR方法克隆了异源四倍体鱼Sox4基因5′端调控区600bp启动子片段,将其插入启动子缺失的增强绿色荧光蛋白(EGFP)表达载体pEGFP-1中,构建重组载体pAtsox4EGFP-1.通过瞬时转染HeLa细胞,在倒置荧光显微镜下可检测到绿色荧光.结果表明,克隆的Atsox4基因5′端调控区具有启动子活性,并成功构建了含四倍体鱼Sox4基因启动子片段的报告基因载体,为以后研究Sox4基因表达调控的分子机制奠定了基础.(本文来源于《自然科学进展》期刊2007年09期)

刘季芳[9](2007)在《异源四倍体鲫鲤Sox基因及黄鳝类固醇激素合成酶研究》一文中研究指出Sox基因家族是在动物中发现的一类新的编码转录因子的基因家族,其产物具有一个HMG基序保守区,参与诸如性别决定、骨组织的发育、血细胞生成、神经系统的发育、晶状体的发育等多种早期胚胎发育过程。世界上首次培育成功的两性可育异源四倍体鲫鲤新种群的获得为研究多倍体鱼的性别决定及分化机制提供了非常重要的实验材料。本文主要对异源四倍体鲫鲤Sox基因进行研究,旨在为鱼类性别决定及分化的分子机制、Sox基因的进化等研究提供新的资料和观点。同时,我们对天然性逆转黄鳝类固醇激素合成酶如P_(450)arom,P_(450)11β,P_(450)SCC和P_(450)C_(17)及潜在的参与雄性性别发育相关基因的表达进行了初步研究。这不仅有利于揭示黄鳝性别决定及性反转的机制,而且对经济动物性别的人为控制、进一步丰富鱼类性别决定和分化的理论等具有积极意义。本论文的主要研究结果如下:1.对异源四倍体鲫鲤精巢型Sox9b基因进行了克隆及表达分析。Sox9b在精巢宏量表达,在心脏和脑微量表达,而在卵巢不表达。其次,我们首次在硬骨鱼中发现2个表达模式相同的Sox9转录子,大小分别为2.1kb和1.7kb。由此可见,Sox9b可能参与雄性四倍体鱼的性腺发育。而且,Sox9b的组织表达多样性为进一步证明硬骨鱼中某些古老基因,如Sox9基因的复制及功能的分化有利于不同谱系鱼类的分歧提供了重要的分子生物学证据。2.对异源四倍体鲫鲤及其原始亲本Sox9基因HMG保守区内含子遗传变异性进行了分析。结果表明,四倍体鱼及其原始亲本Sox9基因HMG基序内含子不仅具有长度多态性,而且内含子之间存在遗传变异性,这为进一步探讨异源四倍体鲫鲤的起源和进化提供了重要的分子生物学证据,同时也为正确掌握内含子的位置信息,功能和起源进化有着十分重要的作用。3.克隆了四倍体鱼Sox4基因部分序列,并对其5′端调控区启动子片段的活性进行了初步研究。实验结果显示,克隆到的异源四倍体鲫鲤Sox4基因600bp启动子能够指导外源增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)的表达,这为进一步研究四倍体鱼Sox4基因在转录和翻译过程中的调控机制和以及此过程所涉及的调控因子具有极其重要的意义。4.对叁个不同发育时期即雌性、间性和雄性黄鳝性腺中4种类固醇激素合成酶及3个潜在的参与雄性性腺发育相关基因的表达进行了初步研究,这将为揭示黄鳝性反转的机制提供重要的分子生物学依据。5.对雌激素合成酶P_(450)芳香化酶(P_(450)arom)及雌激素受体α(ERα)在卵子发生中的表达进行了研究,并探讨了它们之间的关系及其调控机制,为进一步揭示雌激素在黄鳝卵子发生中的作用提供重要的实验数据。(本文来源于《湖南师范大学》期刊2007-05-01)

刘季芳,刘少军,陶敏,李伟,刘筠[10](2007)在《异源四倍体鲫鲤及其原始亲本Sox9基因HMG保守区内含子遗传变异性分析》一文中研究指出参照不同物种中Sox基因HMG保守区序列设计简并引物,扩增了异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫(Carassius carassiusred var.)和鲤鱼(Cyprinus carpioL.)的Sox基因.对不同片段大小的Sox基因测序,结果表明,四倍体鱼中存在两个Sox9基因(Atsox9a和Atsox9b),红鲫和鲤鱼中只发现一个Sox9基因(Rcsox9a和Ccsox9b).这4个Sox9基因在HMG盒中均含有内含子,大小分别为413bp,703bp,401bp和714bp,其插入位点遵守GT-AG法则.其中Atsox9a与Rcsox9a,Atsox9b与Ccsox9b的内含子序列都具有很高的一致性,分别为94.4%和97.8%,这表明内含子序列变异率较低.有趣的是,根据它们的外显子所推导的氨基酸序列一致性均为100%.因此,四倍体鱼及其原始亲本Sox9基因HMG基序内含子不仅具有长度多态性,而且内含子之间存在遗传变异性,这为进一步探讨异源四倍体鲫鲤的起源和进化提供了重要的分子生物学证据,同时也为正确掌握内含子的位置信息,功能和进化起源有着十分重要的作用.(本文来源于《自然科学进展》期刊2007年03期)

异源四倍体鲫鲤论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

载脂蛋白E(Apolipoprotein E,ApoE)作为胆固醇代谢过程中的关键因子,参与脂蛋白转运和性腺发育。为进一步了解该基因的作用,本实验克隆并测序了异源四倍体鲫鲤及其父母本ApoE基因的全长序列。异源四倍体鲫鲤、红鲫和鲤的ApoE全长分别为1393 bp、1384 bp和1396 bp,均编码281个氨基酸。序列对比表明,异源四倍体鲫鲤ApoE与父本鲤更为相似。另外有2个氨基酸位点发生了与父母本均不同的变异,证明异源四倍体鲫鲤除了有杂交特征外也产生了变异。通过Mega软件构建的哺乳动物ApoE进化树与系统分类相一致:鲤科鱼类的ApoE聚类在一起而分离于其它物种。Real time PCR分析表明,ApoE基因在3种鱼中的组织表达模式基本一致,所有组织均有表达,而在脾脏中表达最高。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

异源四倍体鲫鲤论文参考文献

[1].谭星君.异源四倍体鲫鲤中基因组以及转录水平的重组现象的发现[D].湖南师范大学.2015

[2].王凤华,周毅,刘少军,钟欢,张纯.异源四倍体鲫鲤及亲本ApoE的克隆及组织表达分析[J].水产学报.2012

[3].冯浩,傅永明,骆剑,吴慧,刘筠.转青鱼生长激素基因异源四倍体鲫鲤[J].中国科学:生命科学.2011

[4].刘良国,颜金鹏,刘少军,刘东,尤翠平.基于ISSR,AFLP分子标记和cyclins基因克隆的异源四倍体鲫鲤进化分析[J].科学通报.2009

[5].颜金鹏,刘少军,刘筠.异源四倍体鲫鲤雌核发育后代及其亲本RAPD分析[J].水生生物学报.2007

[6].刘良国,陶敏,段巍,刘少军,刘东.异源四倍体鲫鲤及其原始父母本细胞周期蛋白B基因克隆与分子遗传分析[J].中国生物化学与分子生物学报.2007

[7].段巍,覃钦博,陈松,刘少军,王静.用雄核发育方法制备改良异源四倍体鲫鲤群体[J].中国科学(C辑:生命科学).2007

[8].刘季芳,李伟,刘少军,陶敏,龙昱.异源四倍体鲫鲤Sox4基因部分序列及其5′端调控区启动子片段的克隆与分析[J].自然科学进展.2007

[9].刘季芳.异源四倍体鲫鲤Sox基因及黄鳝类固醇激素合成酶研究[D].湖南师范大学.2007

[10].刘季芳,刘少军,陶敏,李伟,刘筠.异源四倍体鲫鲤及其原始亲本Sox9基因HMG保守区内含子遗传变异性分析[J].自然科学进展.2007

论文知识图

异源四倍体鲫鲤的不同个体Tab...2 转青鱼生长激素基因异源四倍体鲫鲤引物S129对雌(11—20)、雄(1—10)异引物S128和S42对异源四倍体鲫鲤(...异源四倍体鲫鲤的不同个体slc...异源四倍体鲫鲤、金鱼、叁倍体...

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