植物三萜皂苷代谢中达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的生物信息学分析

论文摘要

搜集4种植物的10条达玛烷合成酶及22种植物的30条β-香树脂合成酶,利用生物信息学工具对这2种三萜皂苷代谢关键酶的理化性质、蛋白特性及进化亲缘关系等进行分析。理化性质分析显示,这2种酶的氨基酸序列在氨基酸数目、组成、分子量、理论pI和脂肪指数等方面均表现出较强的一致性;同时,这2种酶的糖基化位点具有高度的保守性,并且大豆（2）、绿玉树、木榄这3条β-香树脂合成酶序列有极大的可能性有糖基化位点;信号肽预测分析表明,这2种酶没有明确的信号肽;α-螺旋和无规则卷曲是多肽链中主要存在的二级结构元件;系统进化树显示序列间差异较小,并且聚类结果与序列的科属特性相一致。不同植物的达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶蛋白特性差别不大,进化距离也比较近,说明这2种酶具有较高的保守性和稳定性。这有助于理解达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的保守结构域及进化变异,为研究这2种酶的酶学特征及三萜皂苷代谢提供帮助。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
• 2 结果与分析
•   2.1 不同植物达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶氨基酸序列的理化性质分析
•     2.1.1 不同植物的达玛烷合成酶氨基酸序列的理化性质
•     2.1.2 不同植物的β-香树脂合成酶氨基酸序列的理化性质
•   2.2 不同植物达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶糖基化位点分析
•     2.2.1 不同植物达玛烷合成酶糖基化位点分析
•     2.2.2 不同植物β-香树脂合成酶糖基化位点的预测分析
•   2.3不同植物达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶蛋白质信号肽分析
•     2.3.1 不同植物达玛烷合成酶信号肽分析
•     2.3.2 不同植物β-香树脂合成酶信号肽分析
•   2.4 不同植物达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶二级结构分析
•     2.4.1 不同植物达玛烷合成酶二级结构分析
•     2.4.2 不同植物β-香树脂合成酶二级结构分析
•   2.5 不同植物达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶系统进化树构建
•     2.5.1 不同植物达玛烷合成酶系统进化树构建
•     2.5.2 不同植物β-香树脂合成酶系统进化树构建
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 赵志新,王星星

关键词: 达玛烷合成酶,香树脂合成酶,生物信息学分析,三萜皂苷,理化性质,蛋白特性,进化亲缘关系,糖基化位点,保守结构域,酶学特征

来源: 江苏农业科学 2019年18期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学,生物医学工程

单位: 商洛学院生物医药与食品工程学院,西藏阿里地区中等职业技术学校

基金: 国家级大学生创新创业训练计划(编号:201811396018X)

分类号: Q946;Q811.4

DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.18.018

页码: 86-92

总页数: 7

文件大小: 1383K

下载量: 133