基因标记方法论文_朱慧,朱文侠,黄广智,马小娜

导读:本文包含了基因标记方法论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:基因,荧光,标记,转基因,拟南芥,转染,白粉病。

基因标记方法论文文献综述

朱慧,朱文侠,黄广智,马小娜[1](2019)在《携载增强型绿色荧光蛋白基因慢病毒标记小鼠脐带间充质干细胞示踪方法》一文中研究指出目的探讨慢病毒载体介导增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorecent protein,eGFP)转染小鼠脐带间充质干细胞(umbilical cord mesenchymal stem cells,UCMSCs)的最佳感染复数(multiplicity of infection,MOI)。方法通过组织贴壁法得到mUCMSCs;用生长增殖曲线、成骨、成软骨及成脂分化进行鉴定;以MOI为50、100、150、200携载eGFP的慢病毒载体介导转染mUCMSC,倒置显微镜下观察荧光表达,确定荧光表达率最高的MOI组。结果 eGFP慢病毒以MOI=150转染mUCMSC,效率较高,可直接用于体内示踪。结论用小鼠脐带可以分离出mUCMSCs,MOI=150时携载eGFP的慢病毒传染mUCMSCs效果最好。(本文来源于《延安大学学报(医学科学版)》期刊2019年03期)

金彦龙,李艳军,张新宇,孙杰,薛飞[2](2019)在《利用SLAF-Seq结合BSA方法分子标记‘小白冬麦’抗白粉病基因mlxbd》一文中研究指出白粉病严重威胁着小麦的产量和品质,地方品种‘小白冬麦’对白粉病具有良好的抗性。为进一步精细定位‘小白冬麦’抗白粉病基因,利用SLAF测序,结合BSA方法将抗病基因mlxbd定位在小麦7BL染色体上总长度19.26 Mb的候选区域内[参照小麦CSS(Chromosome survey sequence)基因组(IWGSC,2014)]。将候选区域对应到‘中国春’IWGSC RefSeq v1.0基因组(IWGSC,2018)7BL染色体上,位置为611 088 744~723 157 603。在抗感材料间,定位于染色体候选区间内的SNP和InDel分别有788个和47个。利用已经报道的与mlxbd和mlmz基因连锁标记,进一步将候选区域缩小,基因mlxbd进一步定位于染色体700 631 952~711 234 115。基因功能参照IWGSC RefSeq v1.0(IWGSC,2018)注释,筛选出9个含有NBS或者LRR抗病结构域的基因。利用已有小麦转录组数据库对候选基因分析发现,候选区域内有5个基因受小麦白粉病菌诱导。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年06期)

潘学文,刘元明[3](2018)在《基于主动标记支持向量机和太赫兹光谱的转基因物质检测方法研究》一文中研究指出为克服传统支持向量机需要事先对训练样本进行人为标记的缺点,提出了一种主动训练支持向量机模型。利用仿射传播聚类算法对未标记样本进行聚类分析,在迭代过程中不断更新现有支持向量机的训练数据,从而不仅可以减少人为标记样本所带来的误差,还能够最大限度地提高模型的识别准确率。本文以转基因棉花的太赫兹光谱数据为研究对象对该模型进行了验证,实验结果表明,本文提出的方法对总待测样品的种类的识别率为95.56%,较其他叁种方法有较少的误判和更高的识别率。基于仿射传播聚类的支持向量机较传统支持向量机有更高的识别率和更低的误判率,为转基因物质的检测提供了一种快速,无损的新方法。(本文来源于《光电子·激光》期刊2018年10期)

陈颖,严壮志,高欣[4](2017)在《基于基因影像学方法的肝细胞癌预后影像标记物研究》一文中研究指出目的通过肝细胞癌影像特征和基因模块关联的基因影像学方法,获取生物可解释的影像学标记物。方法从癌症基因组数据库获取371例肝细胞癌基因表达数据,其中37例有对应的术前增强CT数据。从勾画的肿瘤区域提取639维定量影像特征,基于一致性指数标准,筛选出12个影像特征。对肝细胞癌基因表达数据进行聚类,得到聚类基因模块,并与影像特征构建Spearman相关图,筛选出与基因模块关联的影像特征,最后用Cox回归模型评估其是否具有预后功能。结果 12个影像特征中,4个与预后的基因模块显着相关,3个与生存预后显着相关。其中,小波分量高灰度级小区域增强特征,与代表糖链生物合成的基因模块显着相关,且该影像特征与病人的总体生存周期(P=0.006,风险比=0.16)显着相关;低灰度级长游程增强纹理特征,与代表血管生成的基因模块显着相关,且与总体生存周期(P=0.049,风险比=3.21)显着相关。结论描述肿瘤小波频率和纹理的影像特征有可解释的生物学含义,并且与生存周期显着相关,这些特征可作为肝细胞癌潜在的影像学标记物。(本文来源于《航天医学与医学工程》期刊2017年06期)

车洁,赵晓菲,卢金星,李娟,陈霞[5](2017)在《MGB探针标记-实时荧光PCR方法检测细菌int1基因和ISCR1元件方法的建立》一文中研究指出目的建立一种快速、准确检测细菌中ISCR1复合型Ⅰ型整合子的MGB探针二重实时荧光PCR方法。方法根据ISCR1复合型Ⅰ型整合子中int1基因和ISCR1元件序列设计特异性引物和探针,在多种经常携带有2种多耐药相关基因元件的细菌中检测其特异性;使用含有2种基因元件特异性序列的重组质粒标准品评价建立方法的灵敏度。结果建立的MGB二重探针实时荧光PCR检测方法特异性好,携带2种基因元件或单独含有ISCR1或者int1的实验菌株均出现相应特异性扩增曲线,对2种基因元件均不含的菌株进行试验扩增时,均未见出现特异性扩增曲线。对2种基因元件都存在的实验菌株的扩增中,亦不存在由于2套引物/探针相互影响而造成的干扰扩增。根据标准质粒样品构建的标准曲线可确定其对int1基因和ISCR1元件的检测灵敏度分别为5.89×10~1拷贝/μl和4.13×10~1拷贝/μl。结论本研究成功建立了MGB二重探针实时荧光PCR快速检测方法。(本文来源于《疾病监测》期刊2017年Z1期)

彭勤,刘献清,凌保东[6](2017)在《一种无标记基因敲除方法在多重耐药鲍曼不动杆菌AdeC基因敲除中的运用》一文中研究指出鲍曼不动杆菌是一种重要的条件致病菌,现对临床常用的多种抗菌药物均具有天然耐药性。药物外排泵系统普遍存在于鲍曼不动杆菌菌株中,不仅可以外排菌体自身代谢产物还可以主动的将进入菌体的抗菌药物选择性地排出,因此进入细菌内的抗菌药物浓度降低,达不到杀灭细菌的有效浓度。药物外排是细菌对多种抗生素的耐药机制之一,鲍曼不动杆菌中AdeABC外排泵的底物广,能够泵出多种抗菌药物,是RND(resistance-nodulation-cell division)超级家族中最重要的外排泵。在AdeABC外排泵系统中AdeC是外膜蛋白调控基因。本研究介绍无标记基因敲除方法在鲍曼不动杆菌AdeC基因敲除中的运用。本实验运用同源重组原理和自杀载体pMo130-Tel~R对亚碲酸盐的抗性,使用两步筛选法,选择AdeC基因缺失突变体。第一步筛选:自杀载体pMo130-TelR具有亚碲酸盐抗性,在含有碲酸盐的培养基生长并产生黑色菌落从而用于筛选成功导入该质粒的鲍曼不动杆菌;第二步筛选:pMo130-Tel~R上的sacB基因使得含有该质粒的鲍曼不动杆菌在10%的蔗糖YT培养基中不能生长,从而筛选出没有pMo130-TelR质粒的基因缺失突变体。首先通过PCR扩增法获得大量的AdeC基因上/下游约500bp的同源片段,在第一个目的片段上游引物的5端和最后一个目的片段下游引物的5端各设置与上下片断末端同源的序列,通过融合PCR和凝胶电泳回收的方法得到大量1020bp的同源片段。用酶切和酶连的方式将1020bp的同源片段克隆到自杀载体pMo130-TelR中,然后通过结合的方式将重组载体转入鲍曼不动杆菌中进行第一步筛选,最后将鲍曼不动杆菌于10%的蔗糖YT培养基中每天传代培养,继而用PCR扩增法鉴定AdeC基因缺失突变体。经PCR鉴定和测序结果显示已成功构建具有1020bp同源臂的pMo130-TelR载体。根据pMo130-Tel~R对亚碲酸盐的抗性,经过第一步筛选和PCR扩增鉴定的方法获得了具有重组载体的鲍曼不动杆菌;鲍曼不动杆菌在10%蔗糖液体YT培养基中摇床孵育并每天传代进行第二步筛选,数天后,用AdeC基因检测引物检测AdeC基因已敲除并用鲍曼不动杆菌AYE菌株中的特异性引物鉴定AYE菌株,同时未得到pMo130-Tel~R相应的PCR扩增产物说明该质粒从突变株中清除,经过一系列1PCR鉴定最终获得AdeC基因缺失的突变株。最后我们成功的构建了重组的pMo130-Tel~R载体,利用无标记基因敲除方法,成功的敲除鲍曼不动杆菌AYE菌株中AdeC基因,得到AdeC基因缺失突变体。(本文来源于《第十叁届全国抗生素学术会议论文集》期刊2017-11-22)

王超,陈红岩,卢大儒[7](2017)在《基于荧光标记探针对遗传性耳聋基因突变位点多重检测方法的建立》一文中研究指出研究背景和目的:先天性耳聋是最常见的出生缺陷之一,也是一种最常见的人类感觉系统疾病,严重影响着人类的生活质量。据统计,全球每1000名新生儿中,就有1~3例听力障碍的患儿,其中至少一半与遗传因素有关。遗传性耳聋基因检测能通过产前筛查、新生儿筛查等方式有效防控遗传性耳聋患儿的出生、延缓已出生患儿听力下降、避免外界因素造成耳聋等,所以建立快捷、高通量的分子遗传学诊断方法十分必要。目前市场上已有的耳聋基因检测方法主要有DNA直接测序法、TaqMAN水解探针定量PCR法、ARMSPCR法、微阵列芯片法等,但由于这些方法在技术操作便捷性、样本检测灵敏度以及成本等方面的限制,导致其在临床上的应用均不理想。本论文以荧光标记探针技术为平台,建立了一种灵敏度高、特异性强、检测结果稳定、可靠、通量较高的遗传性耳聋基基因突变位点多重检测的方法。材料和方法:近年来在国内外开展的大规模遗传性耳聋分子流行病学研究结果表明,大部分非综合征性聋多是由少数几个热点基因突变引起的,包括GJB2基因上的rs750188782、rs80338943、rs111033204和rs80338939四个位点,SZC26A4基因上的rs111033313和rs121908362两个位点,线粒体DNA12s rRNA rs267606619、rs267606617两个位点,以及GJB3基因上的rs74315319位点,本论文将以上9个位点作为检测对象,设计并合成9条探针及6对引物,利用多重不对称PCR技术两管完成所有位点的扩增,并应用单通道内多位点的熔解曲线分析技术,建立了一种两次实验即可检测耳聋4个热点基因上9个突变的方法。结果与讨论:遗传性耳聋基因突变位点基于荧光标记探针的检测方法分别对9个位点的野生、突变以及杂合叁种基因型均能得到清晰的分型。该方法检测灵敏度高,对样本质量要求不严格,抽提的DNA样本以及唾液样本、滤纸血痕等复杂样本都能得到准确清晰的实验结果。重复性测试结果显示在不同的实验条件下检测结果完全一致。在该方法的基础上,目前我们对一管检测以上9个位点的检测体系进行进一步的探索和优化,以期建立通量更高的检测方法。结论:成功建立了一种灵敏度高、特异性强、检测结果稳定、可靠、通量较高的遗传性耳聋基因探针检测方法。能够满足临床耳聋基因检测的需求,不仅可用于临床快速检测或大规模的人群筛查,还可用于产前筛查、新生儿筛查和遗传咨询及婚育指导,实现早发现、早干预,能有效的防止耳聋患儿的出生和控制聋哑残疾的发生,具有重大的社会效益。(本文来源于《2017中国长叁角遗传学大会会议手册》期刊2017-10-27)

王丽华,谢俊燕,张岳,郑慧琼[8](2016)在《空间培养箱中实时观察GFP标记开花基因表达方法与技术》一文中研究指出绿色荧光蛋白(Green Fluorescent Protein,GFP)已被广泛用作一种强有力的生物发光报告蛋白.但是,其在空间植物培养箱中应用尚存很大困难.本文提出一种在空间植物培养箱中利用LED作为激发光源,对拟南芥中开花基因启动子控制下GFP基因表达的观察与分析方法,为在空间生物学实验中研究基因表达模式提供了新的方法和技术.(本文来源于《空间科学学报》期刊2016年04期)

王敬琦,孔维文,刘婷婷,陈南,杨柏云[9](2015)在《基于esp基因和JCV标记的MST方法在五大流域典型水源地中的应用》一文中研究指出非点源污染目前已经成为影响水体环境的重要污染。微生物源示踪技术(microbial source tracking,MST)是解决非点源污染的一项新技术,它可以确定污染的宿主来源。肠球菌esp基因和多瘤病毒JCV可以作为检测水体中人源粪便污染的分子标记,其灵敏度和特异性都很高。为分析五大流域水源地是否受到人源粪便的污染,对辽河、海河、淮河、长江和黄河五大流域典型水源地水样进行采集和检测,选取人源粪便特异病原微生物肠球菌的esp基因和多瘤病毒JCV建立了相应的MST分子检测方法。结果表明,五大流域的典型水源地采样点均有可能受到了人源粪便的污染,可为当地相关部门提供技术支持和数据参考。(本文来源于《生态毒理学报》期刊2015年06期)

郎遥玲,管晓燕,白国辉,刘建国[10](2015)在《转基因植物中标记基因去除方法的研究进展》一文中研究指出随着越来越多的转基因植物品种的出现,转基因植物的环境安全及食用安全越来越受到人们的广泛关注。目前存在的问题之一是转基因植物中抗生素或除草剂抗性的选择标记基因的存留。为了提高转基因植物的安全性,将转基因植物中选择性标记基因去除,不仅利于同一转基因植物的多次操作,而且更容易被人们所接受。就目前转基因植物中选择性标记基因去除的方法及其优缺点进行了横纵向的比较,希望对相关研究领域方法的选择方向具有指导意义。(本文来源于《生物技术通报》期刊2015年05期)

基因标记方法论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

白粉病严重威胁着小麦的产量和品质,地方品种‘小白冬麦’对白粉病具有良好的抗性。为进一步精细定位‘小白冬麦’抗白粉病基因,利用SLAF测序,结合BSA方法将抗病基因mlxbd定位在小麦7BL染色体上总长度19.26 Mb的候选区域内[参照小麦CSS(Chromosome survey sequence)基因组(IWGSC,2014)]。将候选区域对应到‘中国春’IWGSC RefSeq v1.0基因组(IWGSC,2018)7BL染色体上,位置为611 088 744~723 157 603。在抗感材料间,定位于染色体候选区间内的SNP和InDel分别有788个和47个。利用已经报道的与mlxbd和mlmz基因连锁标记,进一步将候选区域缩小,基因mlxbd进一步定位于染色体700 631 952~711 234 115。基因功能参照IWGSC RefSeq v1.0(IWGSC,2018)注释,筛选出9个含有NBS或者LRR抗病结构域的基因。利用已有小麦转录组数据库对候选基因分析发现,候选区域内有5个基因受小麦白粉病菌诱导。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基因标记方法论文参考文献

[1].朱慧,朱文侠,黄广智,马小娜.携载增强型绿色荧光蛋白基因慢病毒标记小鼠脐带间充质干细胞示踪方法[J].延安大学学报(医学科学版).2019

[2].金彦龙,李艳军,张新宇,孙杰,薛飞.利用SLAF-Seq结合BSA方法分子标记‘小白冬麦’抗白粉病基因mlxbd[J].西北农业学报.2019

[3].潘学文,刘元明.基于主动标记支持向量机和太赫兹光谱的转基因物质检测方法研究[J].光电子·激光.2018

[4].陈颖,严壮志,高欣.基于基因影像学方法的肝细胞癌预后影像标记物研究[J].航天医学与医学工程.2017

[5].车洁,赵晓菲,卢金星,李娟,陈霞.MGB探针标记-实时荧光PCR方法检测细菌int1基因和ISCR1元件方法的建立[J].疾病监测.2017

[6].彭勤,刘献清,凌保东.一种无标记基因敲除方法在多重耐药鲍曼不动杆菌AdeC基因敲除中的运用[C].第十叁届全国抗生素学术会议论文集.2017

[7].王超,陈红岩,卢大儒.基于荧光标记探针对遗传性耳聋基因突变位点多重检测方法的建立[C].2017中国长叁角遗传学大会会议手册.2017

[8].王丽华,谢俊燕,张岳,郑慧琼.空间培养箱中实时观察GFP标记开花基因表达方法与技术[J].空间科学学报.2016

[9].王敬琦,孔维文,刘婷婷,陈南,杨柏云.基于esp基因和JCV标记的MST方法在五大流域典型水源地中的应用[J].生态毒理学报.2015

[10].郎遥玲,管晓燕,白国辉,刘建国.转基因植物中标记基因去除方法的研究进展[J].生物技术通报.2015

论文知识图

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