导读:本文包含了转运体基因论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:密码子偏好性,李,密码子优化,苹果酸转运体
转运体基因论文文献综述
巫伟峰,陈明杰,陈发兴[1](2020)在《'皇冠李'苹果酸转运体基因ALMT4、ALMT9和tDT密码子偏好性分析》一文中研究指出AL~(3+)激活的苹果酸转运体4基因(aluminum-activated malate transporter 4, ALMT4)、AL~(3+)激活的苹果酸转运体9基因(aluminum-activated malate transporter 9, ALMT9)和液泡膜二羧酸转运体基因(tonoplast dicarboxylate transporter, tDT)可能是参与李(Prunus salicina)果实苹果酸转运与积累的关键基因,密码子偏好性分析对其后续基因功能研究具有重要意义。该研究运用CodonW和CUSP程序分析了'皇冠李'(Prunus salicina'Huangguan') ALMT4、ALMT9和tDT基因的密码子偏好性,并与大肠杆菌(Escherichia coli)、酵母(Saccharomyces cerevisiae)、烟草(Nicotiana tabacum)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)及番茄(Lycopersicon esculentum)等模式物种基因组密码子偏好性进行比较。结果显示,'皇冠李'ALMT4、ALMT9和tDT基因的有效密码子数(effective number of codons, ENC)远高于35,接近61,密码子适应指数(codon adaptation index, CAI)远小于1,接近0,密码子偏好性较弱。ALMT4和ALMT9偏好A/U(T)结尾的密码子,tDT偏好U(T)/C结尾的密码子。ALMT4的高频密码子有GCA、AGA、UGU、GGU、CCU、ACU、UAU、UUU、GAA、CAU、AAU、GAU,ALMT9的高频密码子有GCA、AGG、GGA、CAU、UUG、UCA、ACA、AAU、GAU、UUU、UAC,tDT的高频密码子有GCU、AGG、CGA、UGC、GAG、GGA、UUG、AGC、UCC、UAU、GAU、CAA、AAG。基因树相较于基于同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage, RSCU)构建的聚类树更能够反映物种的植物学分类关系。综合考虑密码子偏好性差异、成本、便捷等因素,酵母是'皇冠李'ALMT4、ALMT9、t DT基因较理想的异源蛋白表达系统,番茄是较理想的异源植物表达系统。以酵母和番茄为例对'皇冠李'ALMT4、ALMT9和tDT基因CDs序列进行改造优化,改造后的基因序列具有酵母和番茄基因组的密码子偏好性特征。本研究为后续的基因功能研究提供了理论基础。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2020年01期)
李曜均,刘莎,陈志璐,孙宁,杨春霞[2](2019)在《去甲肾上腺素转运体基因多态性与选择性5-羟色胺再摄取抑制剂抗抑郁疗效的关系》一文中研究指出目的:探讨去甲肾上腺素转运体(NET)基因rs2242446、rs5569多态性与选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRIs)抗抑郁疗效的关系。方法:312例抑郁障碍(MDD)患者抗抑郁治疗6周,根据汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分分为有效组与无效组、缓解组与未缓解组,同时进行NET基因型分型,收集治疗前及治疗后1、2、4、6周的一般资料和临床资料,多角度对SSRIs抗抑郁疗效与NET rs2242446、rs5569多态性进行关联分析。结果:以患者治疗6周HAMD分值作为结局指标,未发现有效组与无效组、缓解组与未缓解组NET基因型及等位基因的分布差异(P均>0.05)。NET基因rs5569位点的不同基因型患者在基线、治疗后1、2、4、6周5个时间点之间HAMD评分差异具有统计学意义(F=5.29,P=0.006)。AA基因型患者在治疗前与AG及GG基因型患者的HAMD评分差异无统计学意义(P>0.05),但在治疗后1、2、4、6周其分值显着低于AG及GG基因型患者(P均<0.05)。结论:NET rs5569位点可能与中国汉族MDD患者SSRIs抗抑郁药疗效相关。(本文来源于《临床精神医学杂志》期刊2019年06期)
柯雪茹,雷波,王明春,曹兴华[3](2019)在《疼痛敏感性及阿片类镇痛药用量与多巴胺转运体基因多态性的相关性》一文中研究指出目的探讨多巴胺转运体(dopamine transporter, DAT)基因(DAT1)多态性对疼痛敏感性及阿片类镇痛药用量的影响。方法选择择期上腹部手术的汉族患者121例,抽取患者外周静脉血通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测DAT1可变串联重复(VNTR)多态性,利用便携式压力测试仪对患者试验性疼痛压力痛阈(PPT)和压力耐痛阈(PTO)进行检测,记录患者术后阿片类镇痛药用量,分析患者的生物社会学特征和DAT1 VNTR多态性与疼痛敏感性和术后阿片类镇痛药用量的关系。结果 121例患者中,DAT1 VNTR等位基因的分布频率分别为9R(18.2%)、10R(81.8%),基因型分布频率分别为9R/9R(7.4%)、9R/10R(21.5%)、10R/10R(71.1%)。不同DAT1 VNTR等位基因型患者PPT和PTO差异无统计学意义,术后24 h和48 h阿片类药物用量差异无统计学意义。不同DAT1 VNTR等位基因型患者中,40岁以下患者的PTO明显高于65岁以上的患者(P<0.05),阿片类镇痛药用量明显多于65岁以上患者(P<0.05)。结论 DAT1 VNTR多态性可能与疼痛敏感性及术后阿片类镇痛药用量无关。(本文来源于《临床麻醉学杂志》期刊2019年12期)
魏锦萍,拉巴次仁,张红兵,许文黎,张亚娟[4](2019)在《辐射事故受照人员药物转运体基因表达的变化》一文中研究指出研究电离辐射引起的迟发性药物转运体基因表达的变化。以3例受~(60)Coγ射线照射3 a后的患者外周血为研究对象,采用Agilent全基因组基因表达芯片技术,筛选出药物转运体差异表达基因。对溶质转运体差异基因表达谱研究发现,3名事故受照人员有机离子转运体和糖类转运体的基因表达以上调为主,氨基酸/胺类转运体和无机离子类转运体基因表达上调或下调趋势不明显,其它类转运体的基因表达则以下调表达为主;对ATP结合盒(ABC)转运体差异基因表达谱研究发现,ABC转运体基因表达以参与多药耐药的转运体基因表达变化为主。结果表明,3名受照人员的多个药物转运体基因表达均发生了改变,其中,一些临床药物是这些药物转运体的底物,可能会改变这些药物的药代动力学特征,为电离辐射对药物的吸收、分布和排泄影响的研究提供参考。(本文来源于《辐射研究与辐射工艺学报》期刊2019年06期)
戴玉洋,武峰,赵秀丽[5](2019)在《腺苷叁磷酸结合盒转运体B1基因多态性与肾病综合征激素抵抗关联性的Meta分析》一文中研究指出目的通过Meta分析,探究腺苷叁磷酸结合盒转运体B1基因(ABCB1)多态性与肾病综合征(NS)患者发生糖皮质激素抵抗(GR)的相关性。方法通过检索中国知网、Pub Med、Em Base和Cochrane Library筛选相关文献,由2位独立的研究者进行数据提取,并分为GR组和激素敏感(GS)组。以Revman和Stata软件合并数据,并对5种遗传模型的GR风险进行异质性分析、敏感性分析和发表偏倚来检测结果稳定性。结果对于rs1128503和rs1045642多态性,Meta分析纳入7项研究,包括GR组272例和GS组554例。对于rs2032582的多态性,Meta分析纳入了5项研究,包括GR组219例和GS组441例。合并分析显示,ABCB1 rs1128503(C> T)与NS患者发生GR的危险性显着相关,等位基因模型(C vs T,P <0. 001),纯合子模型(CC vs TT,P <0. 01),显性模型(CC vs CT+TT,P <0. 05),隐性模型(CC+CT vs TT,P <0. 001)。然而,rs1045642、rs2032582多态性与GR均不具有统计关联性(P≥0. 05)。结论 ABCB1rs1128503的T等位基因是NS患者发生GR的危险因子。(本文来源于《中国临床药理学杂志》期刊2019年19期)
张川江,杨培锋,刘荣馨,贺金花,陈丽霞[6](2019)在《抑郁障碍与5-羟色胺转运体SLC6A4基因多态性的相关性分析》一文中研究指出目的针对抑郁障碍与5-羟色胺转运体SLC6A4基因多态性进行生物信息学及分子流行病学层面的相关性分析。方法运用生物信息学及分子流行病学的研究方法,先借助相关数据库判定出单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,运用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增、Western blot进一步验证结论,并在此基础上进行抑郁障碍与5-羟色胺转运体SLC6A4基因多态性的差异分析。结果生物信息学方法分析得到2个符合研究要求的SNP位点(rs25531及5-HTTLPR);PCR扩增产物测序后共发现7种基因型(分别为S_AS_A468bp,S_AS_G468bp、100bp,S_AL_A468bp,S_AL_G468bp,L_AL_A468bp,L_AL_G468bp,L_GL_G468bp),rs25531及5-HTTLPR两倍点等位基因单倍型发现,2个位点共构成4种单倍型(S-A、S-G、L-A、L-G);rs25531及5-HTTLPR基因多态性在不同抑郁等级人群当中的分布差异、两倍点等位基因单倍型在不同抑郁等级组之间的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 rs25531及5-HTTLPR基因多态性与抑郁障碍不具有统计学层面相关性,但具有生物学层面的相关性,其机制有待进一步验证。(本文来源于《河北医科大学学报》期刊2019年09期)
晁毛妮,胡海燕,王润豪,陈煜,付丽娜[7](2020)在《陆地棉钾转运体基因GhHAK5启动子的克隆与功能分析》一文中研究指出KUP/HAK/KT钾转运体基因的转录调控是植物响应低钾胁迫的一项重要机制。克隆和分析棉花钾转运体基因的启动子,不仅有助于了解其表达模式及调控机制,对于改良棉花的钾吸收特性也具有重要意义。陆地棉钾转运体基因GhHAK5是一个在根中特异性高表达的基因,其表达受低钾胁迫诱导,目前关于该基因启动子的功能还不清楚。本研究以陆地棉品种百棉1号为材料,通过PCR方法对GhHAK5上游2000bp启动子片段(pGhHAK5)进行克隆,并通过转化拟南芥、GUS组织定位和低钾诱导表达特性分析来研究其功能。结果表明, pGhHAK5除具有TATA-box和CAAT-box等基本顺式作用元件外,还含有多个响应于光、逆境胁迫、植物激素和生物钟等的顺式作用元件。pGhHAK5与雷蒙德氏棉pGrHAK5在重要调控元件的数量和位置分布上具有较高的一致性,均具有5个参与根特异性表达调控的元件(ATAAAAT)和1个参与低钾条件下转录调控的ARF转录因子结合位点(TGTCNN)。GUS组织化学染色结果显示,转基因拟南芥幼苗的叶脉和胚轴维管束组织染色较深,根系染色较浅;成熟期转基因拟南芥植株的根、叶脉和花萼维管束组织染色较深,茎和荚皮染色较浅,表明pGhHAK5驱动的GUS主要在拟南芥成熟的根和地上部维管束组织中表达。进一步低钾诱导表达特性分析表明, PGhHAK5驱动的GUS在拟南芥幼苗幼嫩根中的表达很弱,且其表达不受低钾胁迫诱导而增强,表明PGhHAK5可能是一个主要在成熟根中具有功能的低钾诱导型启动子。转录组分析和荧光定量PCR结果表明, GhHAK5主要在成熟的根中表达,且其表达受发育时期的影响,该结果与pGhHAK5驱动的GUS在拟南芥根中的表达结果一致。本研究结果有助于深入了解GhHAK5表达调控的分子机制,并为棉花钾吸收效率的提高及钾高效棉花品种的培育提供理论依据。(本文来源于《作物学报》期刊2020年01期)
张丽娥,樊伟军[8](2019)在《老年慢性心力衰竭患者去甲肾上腺素转运体SLC6A2基因启动子区甲基化水平及其与预后的相关性》一文中研究指出目的探究老年慢性心力衰竭患者去甲肾上腺素转运体SLC6A2基因启动子区甲基化水平及其与预后的相关性。方法前瞻性研究,选择2017年3月至2018年4月西安交通大学第二附属医院心内科收治的200例老年慢性心力衰竭患者作为研究对象,根据预后情况将患者分为死亡组(n=40)和生存组(n=160)。比较两组患者的一般临床资料及SLC6A2基因启动子区相对集中Cp G岛的A、B、C和D共4个相关片段的甲基化率,分析老年慢性心力衰竭患者预后的影响因素。结果死亡组患者的年龄[(69. 46±7. 72)岁]、吸烟史(57. 50%)、饮酒史(80. 00%)和病程[(5. 55±1. 36)年]均显着高于生存组患者的年龄[(63. 83±7. 91)岁]、吸烟史(37. 50%)、饮酒史(60. 63%)和病程[(4. 34±1. 42)年](P <0. 05),死亡组患者的男性百分比(52. 50%)、体重指数[(23. 43±2. 12) kg/m2]、收缩压[(143. 51±8. 96) mm Hg]和舒张压[(78. 83±6. 15) mm Hg]与生存组患者的男性百分比(51. 88%)、体重指数[(23. 12±2. 33) kg/m2]、收缩压[(141. 65±7. 97) mm Hg]和舒张压[(77. 92±6. 96) mm Hg]的差异无统计学意义(P> 0. 05);死亡组患者Cp G岛的A、B、C和D共4个相关片段的甲基化率[(54. 29±2. 34)%、(52. 19±3. 03)%、(56. 26±4. 21)%、(57. 25±3. 34)%]及总体甲基化率(55. 89±3. 98)%均显着性高于生存组Cp G岛的A、B、C和D共4个相关片段的甲基化率[(43. 96±2. 13)%、(40. 50±2. 89)%、(41. 46±2. 89)%、(42. 47±3. 01)%]及总体甲基化率(42. 04±3. 23)%(P <0. 05); SLC6A2基因启动子区总体甲基化率以及年龄、吸烟史、饮酒史和病程是心力衰竭患者死亡预后的危险因素(P <0. 05)。结论去甲肾上腺素转运体SLC6A2基因启动子区甲基化与老年慢性心力衰竭患者的预后出现死亡具有正相关性,是影响老年慢性心力衰竭患者预后的危险因素,能够增加老年慢性心力衰竭患者的死亡风险。(本文来源于《临床和实验医学杂志》期刊2019年17期)
林敏,沈仲夏,钱敏才,崔力军,任列[9](2019)在《5-羟色胺转运体基因多态性与抗抑郁剂治疗广泛性焦虑障碍疗效的关联》一文中研究指出目的:探索5-羟色胺转运体(5-hydroxytryptamine transporter,5-HTT)基因多态性与抗抑郁剂治疗广泛性焦虑障碍(generalized anxiety disorder,GAD)疗效的关联性。方法:188例符合DSM-IV广泛性焦虑障碍诊断标准的患者接受艾司西酞普兰(n=117)或者文拉法辛缓释剂(n=71)治疗8周,疗效判定以汉密尔顿焦虑量表(hamilton anxiety rating scale, HAMA)评分减分率及HAMA评分来评定。对所有患者及169例正常对照组接受5-HTT基因多态性检测。结果:5-HTT各基因型(SS、LS、LL)及等位基因(S、L)在GAD病例组和对照组的分布差异无统计学意义(P>0.05)。5-HTT各基因型患者基线时HAMA评分差异无统计学意义(F=0.052,P=0.949)。所有患者中SS、LS、LL基因型治疗后HAMA减分值差异无统计学意义(F=0.748,P=0.475)。艾司西酞普兰治疗组SS、LS、LL基因型治疗后HAMA减分值差异无统计学意义(F=0.210,P=0.811)。文拉法辛缓释剂治疗组SS、LS、LL基因型治疗后HAMA减分值差异有统计学意义(F=3.505,P=0.036),LL基因型患者HAMA减分值显着高于SS和LS基因型。结论:5-HTT基因多态性与GAD发病的易感性之间可能无直接关系。5-HTT基因多态性和艾司西酞普兰的疗效不相关,但LL基因型的GAD患者接受文拉法辛缓释剂治疗的疗效可能优于SS和LS基因型。(本文来源于《中国临床药理学与治疗学》期刊2019年08期)
邬兰,邓通,耿培亮,王云云,曾宪涛[10](2019)在《5-羟色胺转运体基因多态性与牙周病易感性的相关性研究》一文中研究指出目的探讨5-羟色胺转运体(5-HTT)基因多态性(rs6354、rs12449783)与牙周病易感性的关系。方法纳入245名汉族研究对象,包括120例牙周病患者和125例健康对照组。通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法 (PCR-RFLP)对5-HTT基因(rs6354和rs12449783)多态性位点进行检测。病例组与对照组的基因型、等位基因频率的差异性采用卡方检验评价;并根据性别差异进行亚组分析。所有统计分析采用PASW statistics18.0软件。结果 5-HTT rs6354多态性的AC基因型和C等位基因分布在牙周病患者高于健康对照组,且存在统计学差异(P<0.05),提示AC基因型和C等位基因可能是罹患牙周病的危险因素(AC:OR=1.786,95%CI=1.001-3.187;C:OR=1.723,95%CI=1.015-2.925),且女性人群处于更高的风险(OR=2.167,95%CI=1.034-4.542)。而与对照组相比,rs12449783基因型及其等位基因频率无显着性差异(P>0.05)。结论 5-HTT基因rs6354多态性可能与中国汉族人群牙周病相关,尤其是女性人群;而rs12449783多态性可能与中国汉族人群牙周病无显着相关性。(本文来源于《2019年中华口腔医学会口腔预防医学专业委员会第十九次全国学术年会资料汇编》期刊2019-07-24)
转运体基因论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
目的:探讨去甲肾上腺素转运体(NET)基因rs2242446、rs5569多态性与选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRIs)抗抑郁疗效的关系。方法:312例抑郁障碍(MDD)患者抗抑郁治疗6周,根据汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分分为有效组与无效组、缓解组与未缓解组,同时进行NET基因型分型,收集治疗前及治疗后1、2、4、6周的一般资料和临床资料,多角度对SSRIs抗抑郁疗效与NET rs2242446、rs5569多态性进行关联分析。结果:以患者治疗6周HAMD分值作为结局指标,未发现有效组与无效组、缓解组与未缓解组NET基因型及等位基因的分布差异(P均>0.05)。NET基因rs5569位点的不同基因型患者在基线、治疗后1、2、4、6周5个时间点之间HAMD评分差异具有统计学意义(F=5.29,P=0.006)。AA基因型患者在治疗前与AG及GG基因型患者的HAMD评分差异无统计学意义(P>0.05),但在治疗后1、2、4、6周其分值显着低于AG及GG基因型患者(P均<0.05)。结论:NET rs5569位点可能与中国汉族MDD患者SSRIs抗抑郁药疗效相关。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
转运体基因论文参考文献
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[2].李曜均,刘莎,陈志璐,孙宁,杨春霞.去甲肾上腺素转运体基因多态性与选择性5-羟色胺再摄取抑制剂抗抑郁疗效的关系[J].临床精神医学杂志.2019
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[10].邬兰,邓通,耿培亮,王云云,曾宪涛.5-羟色胺转运体基因多态性与牙周病易感性的相关性研究[C].2019年中华口腔医学会口腔预防医学专业委员会第十九次全国学术年会资料汇编.2019