马铃薯MYB转录因子基因的序列分析

论文摘要

MYB基因家族是植物中最大的一类转录因子家族,广泛参与植物的生长发育和代谢调控过程。本研究通过生物信息学方法对美国国立生物技术信息中心（national center for biotechnology information, NCBI）中筛选的16条马铃薯MYB基因进行分析,预测其分子量和等电点等理化性质、基序、二级结构和三级结构,并用MEGA 5.0与已报道具有明确功能的20个MYB蛋白进行多序列比对分析并构建系统进化树。结果表明:马铃薯中筛选出16个的MYB基因蛋白大小在104～379 aa,分子量和等电点分别介于66 877.11～147 918.09 k D和4.95～5.16之间;基序预测得到3个特征基序,最长的基序含50个氨基酸;α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋-转角-螺旋结构;进化树分析中,其中StMYB12与SIMYB12同源性高,StMYBA1、St AN1和StMYB113与矮牵牛AN2同源性高,StMYB21与MdMYB1有同源性,推测马铃薯的St MYB12、St MYBA1、StAN2、St AN1、StMYB113和StMYB21可能参与花青素合成代谢调控,这为下一步马铃薯花色素苷合成调控相关MYB基因功能研究提供参考依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 马铃薯MYB转录因子的保守基序分析
•   1.2 马铃薯MYB转录因子的基序分析
•   1.3 马铃薯MYB基因的同源性分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 MYB基因的筛选及分析
•   3.2 MYB转录因子的基序分析
•   3.3 MYB基因家族的基因结构和进化树分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 刘旭婷,范菠菠,张旭婷,王鹏伟,高慧,马艳红

关键词: 马铃薯,转录因子,序列分析

来源: 分子植物育种 2019年20期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 内蒙古农业大学农学院

基金: 国家自然科学基金项目(31860670),内蒙古自然科学基金项目(2018MS03016)共同资助

分类号: S532;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.006596

页码: 6596-6603

总页数: 8

文件大小: 4827K

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